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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr06G001868`

染色体: Chr06 坐标: 22091607-22097006 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr06G001868`
名称	SmilChr06G001868
描述	RNA-binding protein Y14A-like
染色体 / SeqID	Chr06 / NC_080392.1
坐标与链方向	22091607 - 22097006 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130987511`
GeneID	`130987511`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130987511`
原始查询	`SmilChr06G001868`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	RNA-binding protein Y14A-like
产物	RNA-binding protein Y14A-like
Arabidopsis	`AT1G51510` (Y14) RNA-binding (RRM/RBD/RNP motifs) family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:841576] identity=65.4; qcov=0.97; evalue=1.44e-78; confidence=high
Rice	`Os05g0140500` (OsY14a) - identity=72.6; qcov=0.685; evalue=6.48e-67; confidence=high
GO	GO:0003729 (mRNA binding); GO:0005634 (nucleus); GO:0005737 (cytoplasm); GO:0008380 (RNA splicing); GO:0035145 (exon-exon junction complex)
KEGG	smil03013 (Nucleocytoplasmic transport - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil03015 (mRNA surveillance pathway - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil03040 (Spliceosome - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF00076 (RRM_1)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130987511

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057767029.1`
2	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057767029.1`
3	Nucleoplasm	核质	0.80000	`XP_057767033.1`
4	Nuclear speckle	核斑点	0.60000	`XP_057767033.1`
5	Cytoplasmic granule	细胞质颗粒	0.20000	`XP_057767029.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr6:22094521`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B139,B19,B32,C4
`Chr6:22094617`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C87
`Chr6:22094622`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A25,B63,B72,C42
`Chr6:22094624`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B108,B22,B36,C28,C39
`Chr6:22094632`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B21,B24,B98,C75
`Chr6:22094651`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B131,B24,C14,C30,C74
`Chr6:22094659`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B21,B7,B82,C6
`Chr6:22094734`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A21
`Chr6:22094744`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C39
`Chr6:22094753`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C39
`Chr6:22095323`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B135,B48,C50
`Chr6:22095357`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B4,C41

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057767029.1

200 aa

100

200

RRM_1

PF00076 RRM_1 95-162 aa

XP_057767030.1

200 aa

100

200

RRM_1

PF00076 RRM_1 95-162 aa

XP_057767031.1

200 aa

100

200

RRM_1

PF00076 RRM_1 95-162 aa

XP_057767032.1

200 aa

100

200

RRM_1

PF00076 RRM_1 95-162 aa

XP_057767033.1

197 aa

197

RRM_1

PF00076 RRM_1 95-162 aa

XP_057767034.1

197 aa

197

RRM_1

PF00076 RRM_1 95-162 aa

XP_057767035.1

197 aa

197

RRM_1

PF00076 RRM_1 95-162 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057767029.1`	Pfam	`PF00076`	RRM_1	Domain	95	162	3.6e-16	59.5	RNA recognition motif
`XP_057767030.1`	Pfam	`PF00076`	RRM_1	Domain	95	162	3.6e-16	59.5	RNA recognition motif
`XP_057767031.1`	Pfam	`PF00076`	RRM_1	Domain	95	162	3.6e-16	59.5	RNA recognition motif
`XP_057767032.1`	Pfam	`PF00076`	RRM_1	Domain	95	162	3.6e-16	59.5	RNA recognition motif
`XP_057767033.1`	Pfam	`PF00076`	RRM_1	Domain	95	162	3.5e-16	59.6	RNA recognition motif
`XP_057767034.1`	Pfam	`PF00076`	RRM_1	Domain	95	162	3.5e-16	59.6	RNA recognition motif
`XP_057767035.1`	Pfam	`PF00076`	RRM_1	Domain	95	162	3.5e-16	59.6	RNA recognition motif

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

7 records

下载 cDNA FASTA

XM_057911052.1
AGAATAGGGGTGAGCAAAATACCCGAAATCCGAATATCCGATCCGATCCAATCCGAAATTTAAACTTTGGTTCGGATTAATCGGATCTTTGGATCGGATCGGATTGAATTTTAAGAAAATTTCGGATATTCGGATCGGATCAGTACTTTTCAAATCCGAACTAATCCGAAATCCGAATTGTATTTAATATATATATATATATATATATATATATATATTGAATATGTTAATTTATATATATATAAATTTTGAATTATTGA...

XM_057911047.1
TTATTGAATATGTTAAAAAGTAAAACCTAAACCCTAATTTCCTAACTAAATCAGCGCCGCACACACAGCCACAACTCCACTCCACCACCGCGTCTGACTCCCATCGCTCTCCAGTCTCCACCACCGGGCGTTCCGCGCCGACGCCGTCCCACCCCGCCGGCCACCACCCCACCTACTCTTCGCCTGCAATCCCCCACCACGCCACCTCCGCGCTTGCAATCCCCCAGAGCAGCTCGAAGCTCGAGCGCAGAGCGCCGCAG...

CDS

7 records

下载 CDS FASTA

LOC130987511
ATGGCGAATGCGGAGGCGGAGGCCGTCGATTTCGAGCCTGAGGAGGACGATCTTATGGACGAGGATGTCGGCTATGGCTCCCCCAACCGAGCCACCGTTCCTCGCCTGAAGTCCGCCATCACCGGCGGCGGCTCCTCCACCGCTCCAAAGAAGACTAAGGGCCGCGGGTTTCGCGACGAGGCCGCTGCTGAAGCGGACCGAAATGCTCGCATGTCCGCCCCCTTCGATTCGCTCGATTCAGAAGGCGGTCCTGGCCCCGA...

Protein

7 records

下载 Protein FASTA

XP_057767029.1
MANAEAEAVDFEPEEDDLMDEDVGYGSPNRATVPRLKSAITGGGSSTAPKKTKGRGFRDEAAAEADRNARMSAPFDSLDSEGGPGPERSIEGWIILVTGVHEEAQEDDLQNAFGDFGEIKNLHLNLDRRTGFVKGYALIEFEKFEEAQRAINEMNGTELLTQTMNVDWAFSKGPFRRRNIRRRYVISNSLQQQYKSLCSF

XP_057767030.1
MANAEAEAVDFEPEEDDLMDEDVGYGSPNRATVPRLKSAITGGGSSTAPKKTKGRGFRDEAAAEADRNARMSAPFDSLDSEGGPGPERSIEGWIILVTGVHEEAQEDDLQNAFGDFGEIKNLHLNLDRRTGFVKGYALIEFEKFEEAQRAINEMNGTELLTQTMNVDWAFSKGPFRRRNIRRRYVISNSLQQQYKSLCSF

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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