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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr06G001873`

染色体: Chr06 坐标: 22238063-22240797 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr06G001873`
名称	SmilChr06G001873
描述	28 kDa ribonucleoprotein, chloroplastic-like
染色体 / SeqID	Chr06 / NC_080392.1
坐标与链方向	22238063 - 22240797 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130987515`
GeneID	`130987515`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130987515`
原始查询	`SmilChr06G001873`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	28 kDa ribonucleoprotein, chloroplastic-like
产物	28 kDa ribonucleoprotein%2C chloroplastic-like
Arabidopsis	`AT5G50250` (CP31B) chloroplast RNA-binding protein 31B [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:835090] identity=64.3; qcov=0.898; evalue=1.24e-107; confidence=high
Rice	`Os09g0565200` - identity=78.6; qcov=0.658; evalue=5.77e-107; confidence=high
GO	GO:0003729 (mRNA binding); GO:0005829 (cytosol)
KEGG	-
Pfam	PF00076 (RRM_1)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130987515

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Chloroplast	叶绿体	1.00000	`XP_057767039.1`
2	Chloroplast stroma	叶绿体基质	0.80000	`XP_057767039.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057767039.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057767039.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057767039.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr6:22238643`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	C51,C74,C82
`Chr6:22238818`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C77
`Chr6:22239613`	`GC`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	B57
`Chr6:22239613`	`GC`	`G`	1bp_deletion	CDS_variant	1	B57
`Chr6:22240355`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A1,B40
`Chr6:22240485`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B131,B24,C14,C30,C74

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057767039.1

284 aa

142

284

RRM_1

PF00076 RRM_1 108-177 aa PF00076 RRM_1 202-272 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057767039.1`	Pfam	`PF00076`	RRM_1	Domain	108	177	7.9e-43	144.9	RNA recognition motif
`XP_057767039.1`	Pfam	`PF00076`	RRM_1	Domain	202	272	7.9e-43	144.9	RNA recognition motif

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057911056.1
AAAAATGAGGAAGAAAAATCACAACAATATCTGAGGCTGCATCTCCGTGTGTGATATTTGTCTGATATCAAACGCCAACCAATTTCTCGTATGCTTAGTGTGGTTTCAAATTCTTATCTTCAGCTCAGCATTTCTCTCTCCCTCTCTCTAACACTTGCAATTGCAAATGACTTCTGCTACTGCCCTCCATCTCAGATTGCTCGAATGCTGTTGCGCAGCAACTATCCCTAAAACTTCCATATCTAAACCCTCTTGCCCCT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130987515
ATGACTTCTGCTACTGCCCTCCATCTCAGATTGCTCGAATGCTGTTGCGCAGCAACTATCCCTAAAACTTCCATATCTAAACCCTCTTGCCCCTCGCTCTCTCTAAGGCAAATCCACTTCCCTCACTCTTCAGTTCAGCTCAAATCCAGGAATTCGCCTCTCAGAATCCTCCCATTCGTCCCTCAGGCCTCCGATTGGGCCGCCGGCGATGAAGGGCTAGCGGCTACAGCCGTCGAATCTTCTTCCTGGGAGAGCGCCGA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057767039.1
MTSATALHLRLLECCCAATIPKTSISKPSCPSLSLRQIHFPHSSVQLKSRNSPLRILPFVPQASDWAAGDEGLAATAVESSSWESADENAEGDGGEESFVQPPEEAKLFVGNLPYDIDSEKLAKLFDQAGVVEISEVIYNRQTDQSRGFGFVTMSTVEQAEKAVEMFSGYDIGGRLLTVNKAAPRGSQPERITRTYEPSFRIYVGNLPWQVDNARLMELFSEHGKVIDARVVIDRETGRSRGFGFVTMSSEPELNDAIAA...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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