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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr06G001894`

染色体: Chr06 坐标: 22676724-22680835 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr06G001894`
名称	SmilChr06G001894
描述	SAGA-associated factor 29 homolog A-like
染色体 / SeqID	Chr06 / NC_080392.1
坐标与链方向	22676724 - 22680835 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130987532`
GeneID	`130987532`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130987532`
原始查询	`SmilChr06G001894`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	SAGA-associated factor 29 homolog A-like
产物	SAGA-associated factor 29 homolog A-like
Arabidopsis	`AT3G27460` (SGF29a) SGF29 tudor-like domain-containing protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:822367] identity=72.3; qcov=1; evalue=1.23e-141; confidence=high
Rice	`Os12g0290600` - identity=65.3; qcov=0.993; evalue=1.31e-111; confidence=high
GO	GO:0000124 (SAGA complex); GO:0035064 (GO:0035064); GO:0043966 (GO:0043966)
KEGG	-
Pfam	PF07039 (SGF29_Tudor)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130987532

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057767066.1`
2	Nucleoplasm	核质	1.00000	`XP_057767066.1`
3	Nuclear body	核内小体	0.60000	`XP_057767066.1`
4	Nucleolar fibrillar center	Nucleolar fibrillar center	0.20000	`XP_057767068.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057767066.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr6:22677311`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C30
`Chr6:22680587`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B101

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057767066.1

271 aa

136

271

SGF29_Tudor

PF07039 SGF29_Tudor 133-266 aa

XP_057767067.1

270 aa

135

270

SGF29_Tudor

PF07039 SGF29_Tudor 132-265 aa

XP_057767068.1

268 aa

134

268

SGF29_Tudor

PF07039 SGF29_Tudor 130-263 aa

XP_057767069.1

267 aa

134

267

SGF29_Tudor

PF07039 SGF29_Tudor 129-262 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057767066.1`	Pfam	`PF07039`	SGF29_Tudor	Domain	133	266	2e-34	119.2	SGF29 tudor-like domain
`XP_057767067.1`	Pfam	`PF07039`	SGF29_Tudor	Domain	132	265	2.1e-34	119.1	SGF29 tudor-like domain
`XP_057767068.1`	Pfam	`PF07039`	SGF29_Tudor	Domain	130	263	1.9e-34	119.3	SGF29 tudor-like domain
`XP_057767069.1`	Pfam	`PF07039`	SGF29_Tudor	Domain	129	262	2e-34	119.2	SGF29 tudor-like domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

4 records

下载 cDNA FASTA

XM_057911084.1
TAAACTAAGACACCCCCAAAAGAAATCTCCAAAATTCATACTCATCTTAAATTAAAAATAATTTTAAAAAAAATAATTTCCAGAATTCCTCGAGCAGATGAATACTCGCAGCTGAAATTCTTCAGATTGCTTGCTGTCCTTGAATCCGTCGAAGCTGCTGAGTTCGCGCGATCTCCGAGTTGGCTCGGAACGATGTCGTCGCCCGACATTGCCGGAATCCTCGAAAACTCGAAGGAGCTCGATCGGCTGAGGAAAGAGCA...

XM_057911083.1
TAAACTAAGACACCCCCAAAAGAAATCTCCAAAATTCATACTCATCTTAAATTAAAAATAATTTTAAAAAAAATAATTTCCAGAATTCCTCGAGCAGATGAATACTCGCAGCTGAAATTCTTCAGATTGCTTGCTGTCCTTGAATCCGTCGAAGCTGCTGAGTTCGCGCGATCTCCGAGTTGGCTCGGAACGATGTCGTCGCCCGACATTGCCGGAATCCTCGAAAACTCGAAGGAGCTCGATCGGCTGAGGAAAGAGCA...

CDS

4 records

下载 CDS FASTA

LOC130987532
ATGTCGTCGCCCGACATTGCCGGAATCCTCGAAAACTCGAAGGAGCTCGATCGGCTGAGGAAAGAGCAGGAGGAGGTGCTTCTCGAGATCAACAAGATGCACAAGAAGCTCATATCTTCTCCGGAGGTGGTTGAAAAGCCGGGTGATTCTTCACTATCAAAGCTTAAGATGTTATATGTTCAAGCCAAAGAGTTGTCAGAGAGTGAAGTGAGTATTTCTAGTCAATTGTTAGGACAACTGGATGCATTAATGCCTTCTGG...

Protein

4 records

下载 Protein FASTA

XP_057767066.1
MSSPDIAGILENSKELDRLRKEQEEVLLEINKMHKKLISCESSPEVVEKPGDSSLSKLKMLYVQAKELSESEVSISSQLLGQLDALMPSGTQGQHRRRIEGSEQKKKRVKADSEVPRLSPSMRSHLESLASLKGEQVAARITQENSGKDEWFVVKVIHFDKETREFEVLDEDPGEDEESTVQRKYKLPMSHIIPFPKRSDLSSVPDFPTGRHVLAVYPETTALYKATVCQSRKRKIDDYVVEFDDDEEDGSLPQRVVPFH...

XP_057767067.1
MSSPDIAGILENSKELDRLRKEQEEVLLEINKMHKKLISCESSPEVVEKPGDSSLSKLKMLYVQAKELSESEVSISSQLLGQLDALMPSGTQGQHRRRIGSEQKKKRVKADSEVPRLSPSMRSHLESLASLKGEQVAARITQENSGKDEWFVVKVIHFDKETREFEVLDEDPGEDEESTVQRKYKLPMSHIIPFPKRSDLSSVPDFPTGRHVLAVYPETTALYKATVCQSRKRKIDDYVVEFDDDEEDGSLPQRVVPFHR...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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