当前解析结果
SmilChr06G001911| 统一新 Gene ID | SmilChr06G001911 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr06G001911 |
| 描述 | uncharacterized SmilChr06G001911 |
| 染色体 / SeqID | Chr06 / NC_080392.1 |
| 坐标与链方向 | 23091585 - 23092097 / + |
| NCBI Gene ID | LOC130990655 |
|---|---|
| GeneID | 130990655 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC130990655 |
| 原始查询 | SmilChr06G001911 |
| 来源 | GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | zinc ion binding / nucleic acid binding protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:814629]; symbol=AT2G01050; hit=AT2G01050; species=arabidopsis; confidence=low |
| 产物 | zinc ion binding / nucleic acid binding protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:814629]; symbol=AT2G01050; hit=AT2G01050; species=arabidopsis; confidence=low |
| Arabidopsis | AT2G01050 (AT2G01050)zinc ion binding / nucleic acid binding protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:814629] identity=25.8; qcov=0.571; evalue=2.55e-06; confidence=low |
| Rice | -- |
| GO | - |
| KEGG | - |
| Pfam | PF14111 (DUF4283) |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:130990655 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Chloroplast | 叶绿体 | 0.80000 | XP_057770865.1 |
| 2 | Cytoplasm | 细胞质 | 0.40000 | XP_057770865.1 |
| 3 | Cytosol | 细胞质基质 | 0.20000 | XP_057770865.1 |
| 4 | Nucleus | 细胞核 | 0.00000 | XP_057770865.1 |
| 5 | Chromosome | 染色体 | 0.00000 | XP_057770865.1 |
结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan;位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。
XP_057770865.1PF14111
DUF4283 42-127 aa
| Protein ID | 来源 | 结构域编号 | 结构域名称 | 类型 | 起始 aa | 终止 aa | E-value | Score | 说明 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
XP_057770865.1 |
Pfam | PF14111 |
DUF4283 | Domain | 42 | 127 | 1.3e-07 | 31.9 | Domain of unknown function (DUF4283) |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。