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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr06G001935`

染色体: Chr06 坐标: 23557498-23560563 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr06G001935`
名称	SmilChr06G001935
描述	subtilisin-like protease SBT1.7
染色体 / SeqID	Chr06 / NC_080392.1
坐标与链方向	23557498 - 23560563 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130988914`
GeneID	`130988914`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130988914`
原始查询	`SmilChr06G001935`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	subtilisin-like protease SBT1.7
产物	subtilisin-like protease SBT1.7
Arabidopsis	`AT5G67360` (ARA12) Subtilase family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:836871] identity=73.1; qcov=0.984; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os03g0761500` (OsSub31) - identity=66.4; qcov=0.964; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0004252 (serine-type endopeptidase activity); GO:0006508 (proteolysis)
KEGG	-
Pfam	PF00082 (Peptidase_S8); PF02225 (PA); PF05922 (Inhibitor_I9); PF17766 (fn3_6)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130988914

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Secreted	分泌到胞外	0.60000	`XP_057768884.1`
2	Cell wall	细胞壁	0.40000	`XP_057768884.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057768884.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057768884.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057768884.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr6:23558027`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A24,B139,B19,B32,C4
`Chr6:23558048`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B139,B19,B32,C4
`Chr6:23558366`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B10,C18,C37
`Chr6:23558621`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C12
`Chr6:23558644`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B35,C40
`Chr6:23558663`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B17,D11
`Chr6:23558667`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B33,B49,B83,C68
`Chr6:23558709`	`TC`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	117	A1,A10,A13,A14,A15,A18,A19,A2,A21,A22,A24,A4,B100,B101,B102,B104,B107,B110,B112,B114,B115,B119,B120,B123,B124,B126,B132,B133,B135,B136,B137,B138,B139,B14,B15,B18,B2,B21,B23,B24,B25,B31,B33,B34,B35,B40,B42,B43,B44,B46,B47,B5,B50,B55,B56,B58,B59,B60,B61,B62,B63,B64,B65,B66,B70,B73,B76,B8,B80,B81,B82,B86,B89,B9,B96,B99,C1,C16,C18,C19,C2,C21,C23,C24,C3,C32,C33,C35,C36,C39,C40,C44,C47,C48,C51,C54,C55,C57,C58,C60,C61,C62,C66,C68,C7,C72,C73,C74,C75,C77,C8,C84,C86,C87,D3,D5,D8
`Chr6:23558715`	`AC`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	122	A10,A13,A14,A15,A18,A19,A2,A21,A22,A24,A4,B100,B101,B102,B104,B107,B110,B112,B114,B115,B117,B119,B120,B123,B124,B126,B132,B133,B135,B136,B137,B138,B139,B14,B15,B18,B2,B21,B23,B24,B25,B31,B33,B34,B35,B38,B40,B42,B43,B44,B46,B47,B5,B50,B55,B56,B58,B59,B60,B61,B62,B63,B64,B65,B66,B70,B73,B76,B8,B80,B81,B82,B86,B89,B9,B95,B96,B97,B99,C1,C16,C18,C19,C2,C21,C23,C24,C3,C33,C35,C36,C39,C40,C44,C47,C48,C51,C54,C55,C56,C57,C58,C60,C61,C62,C66,C68,C7,C72,C73,C74,C75,C76,C77,C8,C84,C86,C87,D3,D5,D7,D8
`Chr6:23558735`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B9
`Chr6:23558891`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B114
`Chr6:23558921`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C82

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057768884.1

760 aa

380

760

Inhibitor_I9

Peptidase_S8

fn3_6

PF05922 Inhibitor_I9 34-109 aa PF00082 Peptidase_S8 133-588 aa PF02225 PA 384-459 aa PF17766 fn3_6 659-757 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057768884.1`	Pfam	`PF05922`	Inhibitor_I9	Domain	34	109	5.4e-18	66.2	Peptidase inhibitor I9
`XP_057768884.1`	Pfam	`PF00082`	Peptidase_S8	Domain	133	588	6.6e-48	164.2	Subtilase family
`XP_057768884.1`	Pfam	`PF02225`	PA	Domain	384	459	6.3e-14	52.6	PA domain
`XP_057768884.1`	Pfam	`PF17766`	fn3_6	Domain	659	757	2.8e-26	92.3	Fibronectin type-III domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057912901.1
ATTAAGCAGCATTCCATTAACCAGAGGAAGAAACATCGAGCCATCAAAATTTCGAATATGAAAATGATTGTGTGAGTTGGCAAAAAACAATGAATCATCAACTTTTCTCCTCTTTTATTCTCTACATAAAAAGAAGAGTGGGAAAAAAGAGTGTGTTTGTAGTAGAATAATTTCTTCAAGAGGGATTAAAGCCTGTGCACACGTGAACAAAGCTGTAGTAGTTTCCCCCACTATTTAGCACCAATTCTCCGCACACATTT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130988914
ATGGCGATCAGAAACATCAGAATTCCGCCATTTTCGGTGGCTGCGCTGCTTCTGCCACTCATTCTCCACGTGGCGGCGGCGGCGGAGGAGAAGAAGGAGACCTACATTGTTCACATGGCCAAGTCGGAGATGCCGGCCGAGTTCCTTGACCATACGCACTGGTACGACGCGTCGCTGAAATCGGTGTCCGCGTCGGCGGCGATCCTCTACACCTACACCAACGCGGTCCACGGCTTCTCCACGCGCCTCACCCCCGAGGA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057768884.1
MAIRNIRIPPFSVAALLLPLILHVAAAAEEKKETYIVHMAKSEMPAEFLDHTHWYDASLKSVSASAAILYTYTNAVHGFSTRLTPEEARAMEARPGILSVLPELRYQLHTTRTPSFLGLDQNAAMFLESDSASDIVVGVLDTGVWPESPSFDDTGFGSVPSSWRGECEIGTNFTKSNCNKKLIGARYFARGYEATLGPIDESKESRSPRDDDGHGTHTSTTAAGSVVSGASLFGYASGTARGMAPRARVAVYKVCWIGGC...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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