当前解析结果
SmilChr06G001938| 统一新 Gene ID | SmilChr06G001938 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr06G001938 |
| 描述 | uncharacterized SmilChr06G001938 |
| 染色体 / SeqID | Chr06 / NC_080392.1 |
| 坐标与链方向 | 23684433 - 23685855 / + |
| NCBI Gene ID | LOC130988915 |
|---|---|
| GeneID | 130988915 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC130988915 |
| 原始查询 | SmilChr06G001938 |
| 来源 | GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | uncharacterized protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:836870]; symbol=AT5G67350; hit=AT5G67350; species=arabidopsis; confidence=low |
| 产物 | uncharacterized protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:836870]; symbol=AT5G67350; hit=AT5G67350; species=arabidopsis; confidence=low |
| Arabidopsis | AT5G67350 (AT5G67350)uncharacterized protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:836870] identity=29.59; qcov=0.878; evalue=2.15e-17; confidence=low |
| Rice | Os03g0439000- identity=24.75; qcov=0.789; evalue=2.48e-06; confidence=weak |
| GO | - |
| KEGG | - |
| Pfam | - |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:130988915 |
特征证据限制:抽查两个保留的历史缓存共 206 行,PROFEAT 特征全部为零;第二块缓存为 106 行,比对应 FASTA 的 100 个蛋白多 6 个。ESM2 特征在抽查范围内为有限非零值。缓存与当前定位结果的历史执行链仍未核实,不能据蛋白编号重合认定这些特征用于线上预测,也不能将抽查推广到全蛋白组。当前结果仅作为探索性候选,特征完整性与预测可靠性尚未建立。
| Rank | 定位位置 | 中文 | 五折投票比例 | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Cell membrane | 细胞膜 | 1.00000 | XP_057768885.1 |
| 2 | Nucleus | 细胞核 | 0.80000 | XP_057768885.1 |
| 3 | Cytosol | 细胞质基质 | 0.20000 | XP_057768885.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr6:23684975 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B52 |
Chr6:23685027 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | B10,C18,C37 |
Chr6:23685147 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B17 |
Chr6:23685153 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B52 |
Chr6:23685182 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | C83 |
Chr6:23685299 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | A20,B51 |
Chr6:23685320 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | A20,B81,C39 |
Chr6:23685322 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | A20,B81,C39 |
Chr6:23685348 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | A20,B81,C39 |
Chr6:23685446 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B13 |
Chr6:23685479 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | C48 |
Chr6:23685590 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B52 |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。