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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr06G001945`

染色体: Chr06 坐标: 23939520-23944110 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr06G001945`
名称	SmilChr06G001945
描述	uncharacterized SmilChr06G001945
染色体 / SeqID	Chr06 / NC_080392.1
坐标与链方向	23939520 - 23944110 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130990663`
GeneID	`130990663`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130990663`
原始查询	`SmilChr06G001945`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	confidence=no_hit
产物	confidence=no_hit
Arabidopsis	`-` -
Rice	`-` -
GO	GO:0003676 (nucleic acid binding); GO:0004190 (aspartic-type endopeptidase activity); GO:0006508 (proteolysis); GO:0008270 (zinc ion binding)
KEGG	-
Pfam	PF00098 (zf-CCHC); PF08284 (RVP_2)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130990663

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057770870.1`
2	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057770870.1`
3	Cytoplasmic granule	细胞质颗粒	0.40000	`XP_057770870.1`
4	Cytoplasmic ribonucleoprotein granule	Cytoplasmic ribonucleoprotein granule	0.20000	`XP_057770870.1`
5	P-body	P-body	0.20000	`XP_057770870.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr6:23939527`	`T`	`TG`	1bp_insertion	frameshift_variant	2	B14,D5
`Chr6:23939527`	`T`	`TG`	1bp_insertion	CDS_variant	2	B14,D5
`Chr6:23939528`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A10,B105,C57
`Chr6:23939537`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B102,B75,C63
`Chr6:23939542`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A10,B105,C57
`Chr6:23939546`	`AT`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	76	A1,A13,A20,A21,A22,A24,A5,A6,B102,B107,B108,B109,B120,B121,B122,B124,B125,B126,B131,B136,B137,B138,B14,B15,B26,B27,B3,B30,B31,B38,B39,B42,B43,B47,B49,B5,B51,B55,B60,B7,B71,B75,B83,B86,B88,B97,B98,C11,C14,C16,C24,C26,C27,C28,C4,C40,C41,C45,C48,C51,C53,C55,C56,C63,C65,C66,C67,C71,C73,C76,C78,C79,C83,C84,C87,D8
`Chr6:23939549`	`T`	`TA`	1bp_insertion	frameshift_variant	73	A1,A13,A20,A21,A24,A5,A6,B102,B107,B108,B109,B120,B121,B122,B124,B125,B126,B136,B137,B138,B14,B15,B26,B27,B3,B30,B31,B38,B39,B42,B43,B47,B49,B5,B51,B55,B64,B7,B71,B75,B86,B88,B97,B98,C11,C14,C16,C24,C26,C27,C28,C4,C40,C41,C45,C48,C51,C53,C55,C56,C63,C65,C66,C67,C71,C73,C76,C78,C79,C83,C84,C87,D8
`Chr6:23939566`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A3,C63
`Chr6:23939588`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B100,B55,C27
`Chr6:23939590`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A10,B112,C11,C30,C75
`Chr6:23939596`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B132,C20,C72
`Chr6:23939598`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B49

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057770870.1

254 aa

127

254

zf-CCHC

RVP_2

PF00098 zf-CCHC 11-28 aa PF08284 RVP_2 82-157 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057770870.1`	Pfam	`PF00098`	zf-CCHC	Domain	11	28	9.3e-06	26.2	Zinc knuckle
`XP_057770870.1`	Pfam	`PF08284`	RVP_2	Domain	82	157	8.2e-11	42.6	Retroviral aspartyl protease

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057914887.1
ATGCACTTGGGGGTTTGCAAAGCTGGATCTAATGTTTGCTACAATTGTGGACAAGCTGGTCATTACTCGTCGCACTGCCCGAGTAAACAACAAGGAATGGCAAGAGGGAAGCCTGATCAGAGTTCGGCTCAGCCCTTGAGAGCCATTATGGGGTATCCGCAACCGCCCCAACAACAGCGCCAGCCGCAAGGTCCACAGAAACACCAGAAACAGCAGCAGCAGCAACAACAACTACCACAGCATCAGAGAGCCTTTGCGCT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130990663
ATGCACTTGGGGGTTTGCAAAGCTGGATCTAATGTTTGCTACAATTGTGGACAAGCTGGTCATTACTCGTCGCACTGCCCGAGTAAACAACAAGGAATGGCAAGAGGGAAGCCTGATCAGAGTTCGGCTCAGCCCTTGAGAGCCATTATGGGGTATCCGCAACCGCCCCAACAACAGCGCCAGCCGCAAGGTCCACAGAAACACCAGAAACAGCAGCAGCAGCAACAACAACTACCACAGCATCAGAGAGCCTTTGCGCT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057770870.1
MHLGVCKAGSNVCYNCGQAGHYSSHCPSKQQGMARGKPDQSSAQPLRAIMGYPQPPQQQRQPQGPQKHQKQQQQQQQLPQHQRAFALNEKQPEKNQGNLTGMGKILDVPVIVLFDTGASHSFVAQACVNTFKLEPKLATPELRVITPVGFITSRSISAFSHASCSYPSSDDSSPPNQSRNQNPTMRTQTTRSNSDASSSSASSSCSSSSSSSPPRRLELWERGGEEGAVRFDSGMGRRLEEGLRRAVVVDVAVT

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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