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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr06G001946`

染色体: Chr06 坐标: 24008200-24026207 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr06G001946`
名称	SmilChr06G001946
描述	suppressor of RPS4-RLD 1
染色体 / SeqID	Chr06 / NC_080392.1
坐标与链方向	24008200 - 24026207 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130988922`
GeneID	`130988922`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130988922`
原始查询	`SmilChr06G001946`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	suppressor of RPS4-RLD 1
产物	suppressor of RPS4-RLD 1
Arabidopsis	`AT4G37460` (SRFR1) Tetratricopeptide repeat (TPR)-like superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:829901] identity=61.8; qcov=1.01; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os07g0113700` (OJ1513_F02.124) - identity=56.9; qcov=0.99; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0005515 (protein binding); GO:0045892 (negative regulation of DNA-templated transcription)
KEGG	-
Pfam	PF13181 (TPR_8); PF13432 (TPR_16)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130988922

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	0.60000	`XP_057768889.1`
2	Cytosol	细胞质基质	0.60000	`XP_057768889.1`
3	Cytoplasm	细胞质	0.40000	`XP_057768889.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057768889.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057768889.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr6:24010425`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B52
`Chr6:24010780`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A21,B28,C87,D5
`Chr6:24012124`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B122,B140,B37,D2
`Chr6:24014070`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B140
`Chr6:24022755`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A21,B28,C87,D5
`Chr6:24025294`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C83

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057768889.1

1034 aa

517

1034

TPR_8

TPR_16

TPR_8

PF13181 TPR_8 311-341 aa PF13432 TPR_16 316-378 aa PF13181 TPR_8 480-512 aa PF13181 TPR_8 515-544 aa

XP_057768890.1

969 aa

484

969

TPR_8

TPR_16

TPR_8

PF13181 TPR_8 246-276 aa PF13432 TPR_16 251-313 aa PF13181 TPR_8 415-447 aa PF13181 TPR_8 450-479 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057768889.1`	Pfam	`PF13181`	TPR_8	Repeat	311	341	7.5e-29	98.1	Tetratricopeptide repeat
`XP_057768889.1`	Pfam	`PF13432`	TPR_16	Repeat	316	378	1.5e-16	61.2	Tetratricopeptide repeat
`XP_057768889.1`	Pfam	`PF13181`	TPR_8	Repeat	480	512	7.5e-29	98.1	Tetratricopeptide repeat
`XP_057768889.1`	Pfam	`PF13181`	TPR_8	Repeat	515	544	7.5e-29	98.1	Tetratricopeptide repeat
`XP_057768890.1`	Pfam	`PF13181`	TPR_8	Repeat	246	276	1.3e-24	84.9	Tetratricopeptide repeat
`XP_057768890.1`	Pfam	`PF13432`	TPR_16	Repeat	251	313	2.3e-16	60.6	Tetratricopeptide repeat
`XP_057768890.1`	Pfam	`PF13181`	TPR_8	Repeat	415	447	1.3e-24	84.9	Tetratricopeptide repeat
`XP_057768890.1`	Pfam	`PF13181`	TPR_8	Repeat	450	479	1.3e-24	84.9	Tetratricopeptide repeat

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XM_057912906.1
TCCTTGTTCATCAGCACTTTACGAATTTACACAAATGCCCCTCCCATTTTGTGAACTCCAACTCCGATTGCGAGCGATTCCTTCCTCTCTCCTATTTTCTCATTTCTACCCTCCGTTTTCCTCACTCTCGTCGCCCAAAACACAAGCAACCACTTCACGCACAACCGCCGTCGATCCATTTTCTCCGGCAAATTTCTCCTCCAATGGCGCCGGCGGTGGCGGAGCGGATTGAGCTCGCCAAGCTCTGCAGCTCAAAGGAT...

XM_057912907.1
ATAATCAGATTGGGAATGGTTCTGGAGGATAATGTCATATTTTCTGCTGGAGGTCATGCATTTTCTGCTCTGGGAAGGAAAGAGGAAGCTCTTTTGGTTTGGGAACAAGGATATGAGCGTGCTGTTAGTCAGTCTGCTGATCTAAAACAACTTATGGAGCTGGAAGAGCTCATGACAATTGCTAAGCAAAATGGTTCCATCTCCTGTCAGAATGGAGATATGGAGTCATCTCCCTCATCTTTTCCTGCATCTGAATCTGC...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA

LOC130988922
ATGGCGCCGGCGGTGGCGGAGCGGATTGAGCTCGCCAAGCTCTGCAGCTCAAAGGATTGGTCAAAGGCTATCCGGATTCTCGATTCACTCCTTGCTCACTCCTGCGCCATTCAGGATCTCTGCAATCGAGCTTTCTGCTATAGCCAATTGGAGTTGCACAAGCACGTCGTCAAGGACTGCGATAAGGCTCTGCAGCTCGATCCTAAGCTTCTCCAAGCATATATTCTTAAAGGTCATGCATTTTCTGCTCTGGGAAGGAA...

LOC130988922
ATGGTTCTGGAGGATAATGTCATATTTTCTGCTGGAGGTCATGCATTTTCTGCTCTGGGAAGGAAAGAGGAAGCTCTTTTGGTTTGGGAACAAGGATATGAGCGTGCTGTTAGTCAGTCTGCTGATCTAAAACAACTTATGGAGCTGGAAGAGCTCATGACAATTGCTAAGCAAAATGGTTCCATCTCCTGTCAGAATGGAGATATGGAGTCATCTCCCTCATCTTTTCCTGCATCTGAATCTGCTGTTTCCACAAAATT...

Protein

2 records

下载 Protein FASTA

XP_057768889.1
MAPAVAERIELAKLCSSKDWSKAIRILDSLLAHSCAIQDLCNRAFCYSQLELHKHVVKDCDKALQLDPKLLQAYILKGHAFSALGRKEEALLVWEQGYERAVSQSADLKQLMELEELMTIAKQNGSISCQNGDMESSPSSFPASESAVSTKLSDASINHGKSNGRITSPSSSTQQVESHKNGSSHNVKGESSFGSLSNTKLENHPMETNGIHKNKKSVGKSALYDSAESSSELIDFSEMCSEPLNLSEIHNELMDEANRS...

XP_057768890.1
MVLEDNVIFSAGGHAFSALGRKEEALLVWEQGYERAVSQSADLKQLMELEELMTIAKQNGSISCQNGDMESSPSSFPASESAVSTKLSDASINHGKSNGRITSPSSSTQQVESHKNGSSHNVKGESSFGSLSNTKLENHPMETNGIHKNKKSVGKSALYDSAESSSELIDFSEMCSEPLNLSEIHNELMDEANRSKKFCVARISKNKSINVDFRLSRGIAQVNEGKYAHAISIFDKILQEEPDYPEALIGRGTAYAFQRE...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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