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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr06G001949`

染色体: Chr06 坐标: 24050547-24055023 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr06G001949`
名称	SmilChr06G001949
描述	metal transporter Nramp3-like
染色体 / SeqID	Chr06 / NC_080392.1
坐标与链方向	24050547 - 24055023 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130988926`
GeneID	`130988926`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130988926`
原始查询	`SmilChr06G001949`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	metal transporter Nramp3-like
产物	metal transporter Nramp3-like
Arabidopsis	`AT1G47240` (NRAMP2) NRAMP metal ion transporter 2 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:841127] identity=77.4; qcov=0.939; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os12g0581600` (OsNRAMP7) - identity=75.4; qcov=0.951; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0005384 (manganese ion transmembrane transporter activity); GO:0005774 (vacuolar membrane); GO:0015086 (cadmium ion transmembrane transporter activity); GO:0030001 (metal ion transport); GO:0042742 (defense response to bacterium); GO:2000379 (positive regulation of reactive oxygen species metabolic process)
KEGG	smil04142 (Lysosome biogenesis - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF01566 (Nramp)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130988926

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Vacuole membrane	液泡膜	1.00000	`XP_057768893.1`
2	Vacuole	液泡	0.80000	`XP_057768893.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057768893.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057768893.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057768893.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr6:24051085`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A21,B28,C87,D5
`Chr6:24054357`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C27
`Chr6:24054418`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C16,C52
`Chr6:24054456`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C48
`Chr6:24054570`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A1,A4,B91,C35
`Chr6:24054621`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr6:24054654`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A10,B52,C72

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057768893.1

508 aa

254

508

Nramp

PF01566 Nramp 60-458 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057768893.1`	Pfam	`PF01566`	Nramp	Domain	60	458	8.5e-129	430.6	Natural resistance-associated macrophage protein-like

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057912910.1
AATTCAACTTAATAATAAATAATGAGTTGAATTCAATTCAATTACACCCTATTGGACTGGTAGTTTCTCCGCATAAAGCCCTTCCCTCCTTTGCCACGATAAAAGCAAAGCACCCACCGTCGATTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCATTCCACTATCCCATTTACAATCGCACAACTCATCACTCCATTCTCTTCACTGTTTCATTTACTCATATTTCAATCTAAAACAATTTAAATCCCCCACCAAAAAATGT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130988926
ATGTCTGCACACAGAGACGAGCACCAGCAGCCCCTACTCGAATCCCTCGACGAAGAGGAGCGGGCCTACGACGCCAATGAGAAAGTCCACATCATCGGCCTCGACGAGGCCGGCGACGAGTTCTCCACCACAGCGCCGCCGTTCTCGTGGCGGAAGCTCTGGCTATTCACGGGGCCGGGGTTCCTGATGAGCATAGCCTTCCTCGATCCTGGGAACCTGGAGGGGGATCTCCAGTCCGGGGCCATCGCCGGCTACTCGCT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057768893.1
MSAHRDEHQQPLLESLDEEERAYDANEKVHIIGLDEAGDEFSTTAPPFSWRKLWLFTGPGFLMSIAFLDPGNLEGDLQSGAIAGYSLLWLLLWATAMGLLVQLLAARLGVVTGRHLAELCREEYPNWARLLLWIMAELALIGADIQEVIGSAIAIKILSQGVLPLWAGVIITALDCFIFLFLENYGVRKLEALFAVLIATMAISFAWMFGETKPDGRELMIGILVPKLSSSTIKQAVGVVGCVIMPHNVFLHSALVQSRE...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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