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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr06G001959`

染色体: Chr06 坐标: 24405973-24407366 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr06G001959`
名称	SmilChr06G001959
描述	uncharacterized SmilChr06G001959
染色体 / SeqID	Chr06 / NC_080392.1
坐标与链方向	24405973 - 24407366 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130990668`
GeneID	`130990668`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130990668`
原始查询	`SmilChr06G001959`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os06g0597250; species=rice; confidence=medium
产物	hit=Os06g0597250; species=rice; confidence=medium
Arabidopsis	`AT2G13770` (AT2G13770) nuclease [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:815861] identity=47.9; qcov=0.524; evalue=4.44e-31; confidence=medium
Rice	`Os06g0597250` - identity=49.1; qcov=0.601; evalue=9.11e-50; confidence=medium
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF04827 (Plant_tran); PF28509 (DUF8418)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130990668

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057770875.1`
2	Chromosome	染色体	0.20000	`XP_057770875.1`
3	Telomere	端粒	0.20000	`XP_057770875.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057770875.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057770875.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr6:24405999`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C83
`Chr6:24406708`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	13	B108,B130,B14,B22,B36,B77,C28,C29,C32,C39,C63,C68,C79
`Chr6:24406741`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B33,C14
`Chr6:24406743`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A10
`Chr6:24406746`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	C19,C32,C48,C61,C68
`Chr6:24406747`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	C19,C48,C61
`Chr6:24406789`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B101,B112,B59,C1,D7
`Chr6:24406837`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B113
`Chr6:24406844`	`AG`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	5	B11,B30,B47,C48,D1
`Chr6:24406844`	`AG`	`A`	1bp_deletion	CDS_variant	5	B11,B30,B47,C48,D1
`Chr6:24406870`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B10,C46,C48
`Chr6:24406895`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B64,B71,C1,C65

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057770875.1

271 aa

136

271

DUF8418

Plant_tran

PF28509 DUF8418 78-117 aa PF04827 Plant_tran 185-230 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057770875.1`	Pfam	`PF28509`	DUF8418	Domain	78	117	1.3e-16	60.8	Domain of unknown function (DUF8418)
`XP_057770875.1`	Pfam	`PF04827`	Plant_tran	Family	185	230	6e-16	59.4	Plant transposon protein

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057914892.1
ATGTCATCTTCCAATAATTCTTCTCACAATTCTTCGTCGAATTCCTCCTCCGACGAAGAAGTGCCAAATCAAGGTCATCTTCCCACAATTCTTCCTGATTCAAATGTTGATCCCGATTTACTTTTTATGCAGCTTGCTTCCAATTTCATGCAAGTGGCGAGTACTTTTAAATTTGATCCTCCATCTCAACCGAAAAGGAAGCGTCGAGTTATTCCTCGTGATCGTGAAAGCGGTGGTAATCGCGTTTATAGGGATTATTT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130990668
ATGTCATCTTCCAATAATTCTTCTCACAATTCTTCGTCGAATTCCTCCTCCGACGAAGAAGTGCCAAATCAAGGTCATCTTCCCACAATTCTTCCTGATTCAAATGTTGATCCCGATTTACTTTTTATGCAGCTTGCTTCCAATTTCATGCAAGTGGCGAGTACTTTTAAATTTGATCCTCCATCTCAACCGAAAAGGAAGCGTCGAGTTATTCCTCGTGATCGTGAAAGCGGTGGTAATCGCGTTTATAGGGATTATTT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057770875.1
MSSSNNSSHNSSSNSSSDEEVPNQGHLPTILPDSNVDPDLLFMQLASNFMQVASTFKFDPPSQPKRKRRVIPRDRESGGNRVYRDYFAPEPVYGPQFFRCHFRMNQELFLRIVNALEVDLYFQQRADACGRVGFSSIQKCTTAFHQLAYGTVANCCDVYLRIEETTTLACLKKFCKAVVHIFSGQYLKRPTTADVQRLLAIHEAKHGFPGILGSLDCMHWTWKNCPVAWYELNLTELAFIRPEQNTFTELNISRATSANT...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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