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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr06G001962`

染色体: Chr06 坐标: 24467267-24470574 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr06G001962`
名称	SmilChr06G001962
描述	probable indole-3-acetic acid-amido synthetase GH3.1
染色体 / SeqID	Chr06 / NC_080392.1
坐标与链方向	24467267 - 24470574 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130988933`
GeneID	`130988933`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130988933`
原始查询	`SmilChr06G001962`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	probable indole-3-acetic acid-amido synthetase GH3.1
产物	probable indole-3-acetic acid-amido synthetase GH3.1
Arabidopsis	`AT2G14960` (GH3.1) Auxin-responsive GH3 family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:815985] identity=74.9; qcov=1.01; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os07g0592600` (GH3-8) - identity=72.5; qcov=0.988; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0005737 (cytoplasm); GO:0016881 (acid-amino acid ligase activity)
KEGG	smil04075 (Plant hormone signal transduction - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF03321 (GH3); PF23571 (GH3_M); PF23572 (GH3_C)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130988933

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057768909.1`
2	Cytosol	细胞质基质	1.00000	`XP_057768909.1`
3	Nucleoplasm	核质	0.20000	`XP_057768909.1`
4	Cytoplasm	细胞质	0.20000	`XP_057768909.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057768909.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr6:24467795`	`TC`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	B130
`Chr6:24467795`	`TC`	`T`	1bp_deletion	CDS_variant	1	B130
`Chr6:24467955`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B21,D1
`Chr6:24467972`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr6:24468026`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B80
`Chr6:24468816`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr6:24468846`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A23,A8,C1
`Chr6:24469014`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B10,C18,C37
`Chr6:24469923`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C48
`Chr6:24469947`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B129,B140
`Chr6:24469976`	`TC`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	B48
`Chr6:24469976`	`TC`	`T`	1bp_deletion	CDS_variant	1	B48

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057768909.1

595 aa

298

595

GH3

GH3_M

GH3_C

PF03321 GH3 18-325 aa PF23571 GH3_M 353-434 aa PF23572 GH3_C 450-565 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057768909.1`	Pfam	`PF03321`	GH3	Domain	18	325	2.1e-118	395.7	GH3 family N-terminal domain
`XP_057768909.1`	Pfam	`PF23571`	GH3_M	Domain	353	434	1.3e-29	102.7	GH3 family central domain
`XP_057768909.1`	Pfam	`PF23572`	GH3_C	Domain	450	565	3.4e-39	134.9	GH3 family C-terminal domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057912926.1
AACCGAGTCTCCGACTCTATTTCATATTTTATTATTTTTATTTACTTAATGGTTTTGATTTACTCGATTTCGCCGGCAGCCTATCATTGTCCCTGACCGACAAAAACTAAGGCCAGACAAAAGAGCCGGAGCTGGAAAATGATTACGTGGATCCGCAGTGGGCCCATGTGTCCCCTGCAACGAAGGCAAGATGGCGTCACGTGGTCCCACGGTGCCACCCCTGGGCGTTACATTTCCTACGACACATACGTTACAAATGT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130988933
ATGGCTGTTGACTCCTCTCCCCCGCCGGTCAACGAGAAATTCGTTAAGACTCTCAATTTCATCGAGGAGATGACCAAGACCACCGATCTCGTGCAAGAGAAGGTGCTCGCCGAGATACTCGCCCAAAACGCCCGCACTGAATACCTCGAGCGCTTCAATCTCGGCGGCGCCACCGACCGCCACGCCTTCAAGTCCAAGGTTCCGGTCGTCACGTACGAGGATCTTCAGCCGGAGATCCAACGCATCGCCAATGGCGACCG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057768909.1
MAVDSSPPPVNEKFVKTLNFIEEMTKTTDLVQEKVLAEILAQNARTEYLERFNLGGATDRHAFKSKVPVVTYEDLQPEIQRIANGDRSPILCSYPISEFLTSSGTSAGERKLMPTIREEMDRRQMLYSLLMPVMNLYVPGLDKGKGLYFLFIKAETKTPGGLVARPVLTSYYKSEQFKNRPVDPYNVYTSPDEAILCVDSFQSMYTQMLCGLLMREEVLRVGAVFASGLLRAIKFLTLNWRPLAHDIATGSLNPKITDPA...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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