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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr06G001966`

染色体: Chr06 坐标: 24752610-24754833 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr06G001966`
名称	SmilChr06G001966
描述	uncharacterized SmilChr06G001966
染色体 / SeqID	Chr06 / NC_080392.1
坐标与链方向	24752610 - 24754833 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130990672`
GeneID	`130990672`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130990672`
原始查询	`SmilChr06G001966`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	MuDR family transposase [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:3766669]; symbol=MUG3; hit=AT1G06740; species=arabidopsis; confidence=low
产物	MuDR family transposase [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:3766669]; symbol=MUG3; hit=AT1G06740; species=arabidopsis; confidence=low
Arabidopsis	`AT1G06740` (MUG3) MuDR family transposase [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:3766669] identity=25.1; qcov=0.642; evalue=1.84e-25; confidence=low
Rice	`Os02g0192200` - identity=22.9; qcov=0.635; evalue=1.06e-22; confidence=weak
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF00872 (Transposase_mut); PF10551 (MULE)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130990672

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057770877.1`
2	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057770877.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057770877.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057770877.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057770877.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr6:24752691`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B23,B65,B73,C79
`Chr6:24752740`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B129,B140
`Chr6:24752784`	`TC`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	B113
`Chr6:24752784`	`TC`	`T`	1bp_deletion	CDS_variant	1	B113
`Chr6:24752878`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A7
`Chr6:24752883`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A3
`Chr6:24752884`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B125,B40,B58,B69
`Chr6:24752897`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A23
`Chr6:24752908`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B123,D3,D4
`Chr6:24752945`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B130
`Chr6:24753904`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D4
`Chr6:24754018`	`G`	`GC`	1bp_insertion	frameshift_variant	2	B29,D2

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057770877.1

551 aa

276

551

MULE

Transposase_mut

PF10551 MULE 310-393 aa PF00872 Transposase_mut 310-394 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057770877.1`	Pfam	`PF10551`	MULE	Domain	310	393	4.9e-13	50.0	MULE transposase domain
`XP_057770877.1`	Pfam	`PF00872`	Transposase_mut	Family	310	394	1.5e-07	31.4	Transposase, Mutator family

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057914894.1
ATGAGAGGATTTAACTGGTTTTCGGATTCAACTCCTAATTCAACCATGAATCATCACACTATAAGATCTGTTGGGGATGATGACATTGATGATGATGAGTACGTCCCATCAATAGATTCTGATGGGGATGATGAAGAGGAAGAAGAAGCAGATGAGCGGGAGTCAGCTCGAGTGGATTATGGAATATTTGCAGAGCATACTGCGTGGATATGCCGTGAGAGTGGGATTGGCGAGCTTATGGCGATGATAATGCAAACAAA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130990672
ATGAGAGGATTTAACTGGTTTTCGGATTCAACTCCTAATTCAACCATGAATCATCACACTATAAGATCTGTTGGGGATGATGACATTGATGATGATGAGTACGTCCCATCAATAGATTCTGATGGGGATGATGAAGAGGAAGAAGAAGCAGATGAGCGGGAGTCAGCTCGAGTGGATTATGGAATATTTGCAGAGCATACTGCGTGGATATGCCGTGAGAGTGGGATTGGCGAGCTTATGGCGATGATAATGCAAACAAA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057770877.1
MRGFNWFSDSTPNSTMNHHTIRSVGDDDIDDDEYVPSIDSDGDDEEEEEADERESARVDYGIFAEHTAWICRESGIGELMAMIMQTNLRGLSEDLGQEASQKLRNWLVPVIPEDFTENLFAGRLADIPNPDELTEGLIFESKELLKLAIGLWHLERRAEFIIPRSDLDRITFKCKYRNRCPFQLRATQQGSFWFIRKFRPAHTCIGDMVNTGVRKFHARVIAAHIAKKMSEDGEIVKPRTIMADLQREYGVNISYSVAIR...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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