当前解析结果
SmilChr06G001973| 统一新 Gene ID | SmilChr06G001973 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr06G001973 |
| 描述 | uncharacterized SmilChr06G001973 |
| 染色体 / SeqID | Chr06 / NC_080392.1 |
| 坐标与链方向 | 24894452 - 24895630 / + |
| NCBI Gene ID | LOC130990674 |
|---|---|
| GeneID | 130990674 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC130990674 |
| 原始查询 | SmilChr06G001973 |
| 来源 | GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | confidence=no_hit |
| 产物 | confidence=no_hit |
| Arabidopsis | -- |
| Rice | -- |
| GO | - |
| KEGG | - |
| Pfam | - |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:130990674 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Cytoplasm | 细胞质 | 0.80000 | XP_057770880.1 |
| 2 | Nucleus | 细胞核 | 0.40000 | XP_057770880.1 |
| 3 | Cytoplasmic granule | 细胞质颗粒 | 0.20000 | XP_057770880.1 |
| 4 | Cytoplasmic ribonucleoprotein granule | Cytoplasmic ribonucleoprotein granule | 0.20000 | XP_057770880.1 |
| 5 | Chromosome | 染色体 | 0.00000 | XP_057770880.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr6:24894456 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | A15,B110,B13,C71 |
Chr6:24894464 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | B58,B8,B82 |
Chr6:24894473 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | stop_gained | 3 | B110,B13,C71 |
Chr6:24894473 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | B110,B13,C71 |
Chr6:24894475 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B108 |
Chr6:24894495 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B112 |
Chr6:24894497 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | A5,B8,C10,C8 |
Chr6:24894499 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | B110,B13,C71 |
Chr6:24894500 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | stop_gained | 6 | A14,B102,B127,B79,C42,C67 |
Chr6:24894533 |
CG |
* |
1bp_deletion | CDS_variant | 4 | B125,C15,C72,C76 |
Chr6:24894540 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | A11,B33,D11 |
Chr6:24894567 |
GA |
G |
1bp_deletion | frameshift_variant | 4 | A1,B100,C74,C9 |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。