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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr06G001974`

染色体: Chr06 坐标: 24924021-24924563 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr06G001974`
名称	SmilChr06G001974
描述	uncharacterized mitochondrial protein AtMg00810-like
染色体 / SeqID	Chr06 / NC_080392.1
坐标与链方向	24924021 - 24924563 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130990675`
GeneID	`130990675`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130990675`
原始查询	`SmilChr06G001974`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=ATMG00810; species=arabidopsis; confidence=medium
产物	hit=ATMG00810; species=arabidopsis; confidence=medium
Arabidopsis	`ATMG00810` - identity=36.2; qcov=0.983; evalue=2.11e-36; confidence=medium
Rice	`gene-orf490` (orf490) - identity=37.4; qcov=1.04; evalue=1.78e-35; confidence=medium
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF07727 (RVT_2)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130990675

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057770881.1`
2	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057770881.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057770881.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057770881.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057770881.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr6:24924022`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B129,B140
`Chr6:24924024`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B38,C15
`Chr6:24924033`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B38,C15
`Chr6:24924046`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B19,B38,B77,C15,C26
`Chr6:24924054`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B19,B38,B77,C15,C26
`Chr6:24924058`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B136,C82,C83
`Chr6:24924094`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr6:24924095`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	10	A5,B4,B50,B60,B62,B65,B68,B86,C12,C49
`Chr6:24924143`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr6:24924156`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B100,C68,C84
`Chr6:24924187`	`AGC`	`A`	2bp_deletion	frameshift_variant	34	A25,A4,B101,B104,B110,B117,B14,B24,B29,B32,B34,B38,B39,B50,B51,B52,B53,B54,B59,B75,B77,B83,B87,C15,C22,C26,C29,C31,C38,C59,C87,D3,D5,D6
`Chr6:24924202`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C25

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057770881.1

180 aa

180

RVT_2

PF07727 RVT_2 2-64 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057770881.1`	Pfam	`PF07727`	RVT_2	Domain	2	64	1.8e-10	41.6	Reverse transcriptase (RNA-dependent DNA polymerase)

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057914898.1
ATGTGCAAGAAGTTTACTGAGATTATGACAAGTAAATTCCAGATGTCAATGATGGGAGAAATGAGTTTCTTTCTGGGATTACAAGTCAAGCAAACCAAGGAAGGCATACTGATCAATCAGTCTAAGTATGCCAAGGAACTGATCAACAAGTTTGAAGTTCAACACATGAAGACCGTGAAGATTCCCATGAACACCAACTGGAAACTCGATCCAGAAAAAGTGGAAAAATCTGTTTCACCAACAAAGTACAGAGAAATCAT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130990675
ATGTGCAAGAAGTTTACTGAGATTATGACAAGTAAATTCCAGATGTCAATGATGGGAGAAATGAGTTTCTTTCTGGGATTACAAGTCAAGCAAACCAAGGAAGGCATACTGATCAATCAGTCTAAGTATGCCAAGGAACTGATCAACAAGTTTGAAGTTCAACACATGAAGACCGTGAAGATTCCCATGAACACCAACTGGAAACTCGATCCAGAAAAAGTGGAAAAATCTGTTTCACCAACAAAGTACAGAGAAATCAT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057770881.1
MCKKFTEIMTSKFQMSMMGEMSFFLGLQVKQTKEGILINQSKYAKELINKFEVQHMKTVKIPMNTNWKLDPEKVEKSVSPTKYREIIGSLIYLTASRPDIAFAVGVCARYQSDPKEAHIDATKRMLRYIKGTPNIGLWYPANDDFKLIGYTDLDFARCAIDRKSTFETCQFLGSKLISWF

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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