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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr06G001985`

染色体: Chr06 坐标: 25282543-25292150 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr06G001985`
名称	SmilChr06G001985
描述	uncharacterized SmilChr06G001985
染色体 / SeqID	Chr06 / NC_080392.1
坐标与链方向	25282543 - 25292150 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130990935`
GeneID	`130990935`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130990935`
原始查询	`SmilChr06G001985`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	confidence=no_hit
产物	confidence=no_hit
Arabidopsis	`-` -
Rice	`-` -
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF03004 (Transposase_24)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130990935

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057771139.1`
2	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057771139.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057771139.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057771139.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057771139.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr6:25284312`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B12
`Chr6:25284364`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C36,C82
`Chr6:25284409`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B6,C11
`Chr6:25284416`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	2	A10,B12
`Chr6:25284416`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A10,B12
`Chr6:25284425`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A18,B6,C11
`Chr6:25284472`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A10,B12
`Chr6:25284474`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C45
`Chr6:25284476`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	58	A19,A3,A7,B104,B109,B110,B112,B119,B120,B121,B131,B132,B138,B20,B22,B23,B3,B30,B33,B34,B37,B41,B44,B45,B52,B57,B58,B65,B67,B69,B70,B72,B75,B79,B8,B89,B93,C1,C14,C15,C22,C25,C3,C30,C39,C41,C46,C49,C5,C51,C55,C61,C62,C69,C71,C80,D3,D6
`Chr6:25284546`	`AC`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	2	C14,C18
`Chr6:25284546`	`AC`	`A`	1bp_deletion	CDS_variant	2	C14,C18
`Chr6:25284558`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B47

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057771139.1

335 aa

168

335

Transposase_24

PF03004 Transposase_24 130-260 aa

XP_057771140.1

335 aa

168

335

Transposase_24

PF03004 Transposase_24 130-260 aa

XP_057771142.1

335 aa

168

335

Transposase_24

PF03004 Transposase_24 130-260 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057771139.1`	Pfam	`PF03004`	Transposase_24	Family	130	260	4.4e-13	50.3	Plant transposase (Ptta/En/Spm family)
`XP_057771140.1`	Pfam	`PF03004`	Transposase_24	Family	130	260	4.4e-13	50.3	Plant transposase (Ptta/En/Spm family)
`XP_057771142.1`	Pfam	`PF03004`	Transposase_24	Family	130	260	4.4e-13	50.3	Plant transposase (Ptta/En/Spm family)

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

3 records

下载 cDNA FASTA

XM_057915159.1
GAATACACCCCCATATCTTCCCCCAAAATCATTTGCCCTACGCCATTCCCCCAAAAGCAATTGAACGCCATTCCCTCAAGCTGCCGGATTTCGCCCCCTGCCGGAGTCGATCTGCTGCTGGAGTCGTTTCCCAAGCTGCCGGATTTCACCATCGATCTTCCCCGTTCGCCCCACCGTCCGCCGGAGTCCCCTGCTTCTGTCTGCCGCCGCCTCGCTCCCGCCGGATCTCCTCTTTCTCTCTCTCTCTCTCAAATTTGAAA...

XM_057915157.1
GAATACACCCCCATATCTTCCCCCAAAATCATTTGCCCTACGCCATTCCCCCAAAAGCAATTGAACGCCATTCCCTCAAGCTGCCGGATTTCGCCCCCTGCCGGAGTCGATCTGCTGCTGGAGTCGTTTCCCAAGCTGCCGGATTTCACCATCGATCTTCCCCGTTCGCCCCACCGTCCGCCGGAGTCCCCTGCTTCTGTCTGCCGCCGCCTCGCTCCCGCCGGATCTCCTCTTTCTCTCTCTCTCTCTCAAATTTGAAA...

CDS

3 records

下载 CDS FASTA

LOC130990935
ATGAGGTCCAGCAGCAGCCTGCATCGTCACATCTCTCGGTCAGGCGAGAATATCACTGTTCTTTCTAATGGGAAGATTTTATGCACTTTAACTAATGGGATTTTACGACCAAGCAATAAAATCCGGCGTCACACATCACGTACTTTTCAAGCATACATAGAGATCACTGGCACCTCATGGAAGGCGCTTACTGAAGACACGATTGAAGTTTACTTCAATCGGTTTATTAATGCATTTGAGTGGGACCCTTCTATGTATTC...

Protein

3 records

下载 Protein FASTA

XP_057771139.1
MRSSSSLHRHISRSGENITVLSNGKILCTLTNGILRPSNKIRRHTSRTFQAYIEITGTSWKALTEDTIEVYFNRFINAFEWDPSMYSREFIRTAWIKIARVAYKDFLSVTKKLVLIEKKTPLYLKENVETAWKANWDLPEVKRKSEQASKNRRSKPGGPGIGIAIHHGSSRSAIDHAEHMAREKNIPVDCTAYDTFLRIHRKGGLYTGPRFEAHAVEIESRIQDIQATKGRVPTPEEVHCIFKEVVKRDAKGRVLGIRMM...

XP_057771140.1
MRSSSSLHRHISRSGENITVLSNGKILCTLTNGILRPSNKIRRHTSRTFQAYIEITGTSWKALTEDTIEVYFNRFINAFEWDPSMYSREFIRTAWIKIARVAYKDFLSVTKKLVLIEKKTPLYLKENVETAWKANWDLPEVKRKSEQASKNRRSKPGGPGIGIAIHHGSSRSAIDHAEHMAREKNIPVDCTAYDTFLRIHRKGGLYTGPRFEAHAVEIESRIQDIQATKGRVPTPEEVHCIFKEVVKRDAKGRVLGIRMM...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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