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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr06G001991`

染色体: Chr06 坐标: 25315027-25319930 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr06G001991`
名称	SmilChr06G001991
描述	probable cinnamyl alcohol dehydrogenase
染色体 / SeqID	Chr06 / NC_080392.1
坐标与链方向	25315027 - 25319930 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130990940`
GeneID	`130990940`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130990940`
原始查询	`SmilChr06G001991`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	probable cinnamyl alcohol dehydrogenase
产物	probable cinnamyl alcohol dehydrogenase
Arabidopsis	`AT3G19450` (ATCAD4) GroES-like zinc-binding alcohol dehydrogenase family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:821479] identity=54.7; qcov=1.02; evalue=8.72e-127; confidence=high
Rice	`Os02g0187800` (GH2) - identity=58.4; qcov=1.02; evalue=6.05e-119; confidence=high
GO	GO:0008270 (zinc ion binding); GO:0009809 (lignin biosynthetic process); GO:0045551 (cinnamyl-alcohol dehydrogenase activity)
KEGG	smil00940 (Phenylpropanoid biosynthesis - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01100 (Metabolic pathways - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01110 (Biosynthesis of secondary metabolites - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF00107 (ADH_zinc_N); PF08240 (ADH_N); PF13602 (ADH_zinc_N_2)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130990940

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	0.80000	`XP_057771145.1`
2	Cytosol	细胞质基质	0.60000	`XP_057771145.1`
3	Nucleus	细胞核	0.20000	`XP_057771145.1`
4	Peroxisome	过氧化物酶体	0.20000	`XP_057771145.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057771145.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr6:25315216`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B52
`Chr6:25315517`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B132,C1
`Chr6:25315580`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C22
`Chr6:25315613`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B47
`Chr6:25315617`	`GC`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	B60
`Chr6:25315617`	`GC`	`G`	1bp_deletion	CDS_variant	1	B60
`Chr6:25315692`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B112,B132,C1,D10
`Chr6:25315710`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C12
`Chr6:25315737`	`AC`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	4	A24,B19,B32,C4
`Chr6:25315737`	`AC`	`A`	1bp_deletion	CDS_variant	4	A24,B19,B32,C4
`Chr6:25315739`	`C`	`CT`	1bp_insertion	frameshift_variant	9	A15,A21,A24,B19,B32,B74,B9,C14,C4
`Chr6:25315783`	`T`	`TGC`	2bp_insertion	frameshift_variant	2	A21,B101

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057771145.1

335 aa

168

335

ADH_N

ADH_zinc_N

ADH_zinc_N_2

PF08240 ADH_N 31-141 aa PF00107 ADH_zinc_N 170-289 aa PF13602 ADH_zinc_N_2 201-319 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057771145.1`	Pfam	`PF08240`	ADH_N	Domain	31	141	9.9e-20	71.5	Alcohol dehydrogenase GroES-like domain
`XP_057771145.1`	Pfam	`PF00107`	ADH_zinc_N	Domain	170	289	5.8e-24	85.2	Zinc-binding dehydrogenase
`XP_057771145.1`	Pfam	`PF13602`	ADH_zinc_N_2	Domain	201	319	3.4e-06	28.7	Zinc-binding dehydrogenase

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057915162.1
GGTATTATGAATTCGGTGTATATTATTCTCTCATTCCGATCCATCTCTATAAATTTTCTACACTAATCTAAAGTCTGAGAAATATGGTGGGAGCAGTAGCCAATGGTTGGGCTGCCAGGGACTCATCTGGTCATCTCTCTCCTTATTCATTTCATCTCAGAGAAACAGGTGGTGATGACATTCTATTGCGCGTTTTATACCGTGGAGTAGACCACACAGATCTCCATCAGGTGAGGAGTGAGATTGGCAAAACCAACTAC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130990940
ATGGTGGGAGCAGTAGCCAATGGTTGGGCTGCCAGGGACTCATCTGGTCATCTCTCTCCTTATTCATTTCATCTCAGAGAAACAGGTGGTGATGACATTCTATTGCGCGTTTTATACCGTGGAGTAGACCACACAGATCTCCATCAGGTGAGGAGTGAGATTGGCAAAACCAACTACCCTTTGGTTCCAGGGCATGAAATAGTGGGCCAAGTAGTTGAAGTAGGGGAAGAAGTGAAGAATTTGAAAGCAGGCGATGTGGT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057771145.1
MVGAVANGWAARDSSGHLSPYSFHLRETGGDDILLRVLYRGVDHTDLHQVRSEIGKTNYPLVPGHEIVGQVVEVGEEVKNLKAGDVVGVGGIIGSCXSDLEHYCRARVLTYNHVFPDGTITQGGFSSAIVVHHRFAVKIPEKLEAAQAAPLLCAGVTAYSPLKQFKDXAGHLAVMIAKAMGHHVTVISSSHKKREEAMEHLGADAYLVSSDEAAMAEAADSLDYILDTVPALHPLELYISLLKAQGKLLLVGAPPHPLEF...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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