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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr06G001996`

染色体: Chr06 坐标: 25391466-25392873 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr06G001996`
名称	SmilChr06G001996
描述	transcription factor MYB73-like
染色体 / SeqID	Chr06 / NC_080392.1
坐标与链方向	25391466 - 25392873 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130990946`
GeneID	`130990946`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130990946`
原始查询	`SmilChr06G001996`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	transcription factor MYB73-like
产物	transcription factor MYB73-like
Arabidopsis	`AT4G37260` (MYB73) myb domain protein 73 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:829880] identity=55; qcov=0.892; evalue=8.41e-94; confidence=high
Rice	`Os09g0106700` (R2R3-MYB) - identity=77.5; qcov=0.464; evalue=1.04e-72; confidence=medium
GO	GO:0000978 (RNA polymerase II cis-regulatory region sequence-specific DNA binding); GO:0000981 (DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific); GO:0005634 (nucleus); GO:0006355 (regulation of DNA-templated transcription)
KEGG	-
Pfam	PF00249 (Myb_DNA-binding); PF13921 (Myb_DNA-bind_6)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130990946

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057771149.1`
2	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057771149.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057771149.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057771149.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057771149.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr6:25392020`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B122,B140,B2,B37,D2
`Chr6:25392116`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B105,B134,B84
`Chr6:25392195`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B10
`Chr6:25392211`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C73
`Chr6:25392285`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B12,B137,B55,C2
`Chr6:25392318`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B139,B82,C52
`Chr6:25392409`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B92,C1
`Chr6:25392583`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B12

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057771149.1

306 aa

153

306

Myb_DNA-binding

Myb_DNA-bind_6

Myb_DNA-binding

Myb_DNA-bind_6

PF00249 Myb_DNA-binding 10-56 aa PF13921 Myb_DNA-bind_6 13-70 aa PF00249 Myb_DNA-binding 64-106 aa PF13921 Myb_DNA-bind_6 65-112 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057771149.1`	Pfam	`PF00249`	Myb_DNA-binding	Domain	10	56	3.1e-39	133.6	Myb-like DNA-binding domain
`XP_057771149.1`	Pfam	`PF13921`	Myb_DNA-bind_6	Domain	13	70	4.4e-29	101.2	Myb-like DNA-binding domain
`XP_057771149.1`	Pfam	`PF00249`	Myb_DNA-binding	Domain	64	106	3.1e-39	133.6	Myb-like DNA-binding domain
`XP_057771149.1`	Pfam	`PF13921`	Myb_DNA-bind_6	Domain	65	112	4.4e-29	101.2	Myb-like DNA-binding domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057915166.1
ATGTGACGCGTGTCCGTTGGCCAGCTGTATCCCATCTCCATTACAACCGCTTTCCCCTTTCCCCTTAAGCGGTGCCCCATACACTACAATCCCTCTCTCTCTCATCACAATTCACATATATATACCCTCCCCCCAATCCCACTCCTTGACCCACGATACATCAACTAACCCAACCATAACCCAACTCCAATCTTACATGACAAGATGATGAAAACGGATATCGATCGGATCAAGGGGCCGTGGAGCCCCGAGGAGGATGA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130990946
ATGATGAAAACGGATATCGATCGGATCAAGGGGCCGTGGAGCCCCGAGGAGGATGATCTGCTGCAGCAGCTCGTCCAGAGGCACGGCCCCAGGAACTGGTCCCTCATCAGCAAGTCCATCCCGGGCCGCTCCGGCAAGAGCTGCCGCCTGCGCTGGTGCAACCAGCTCTCCCCGCAGGTGGAGCACCGCGCCTTCACGCCCGAGGAGGACGACACCATCATCCGCGCCCACGCCCGCTTCGGCAACAAGTGGGCCACCAT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057771149.1
MMKTDIDRIKGPWSPEEDDLLQQLVQRHGPRNWSLISKSIPGRSGKSCRLRWCNQLSPQVEHRAFTPEEDDTIIRAHARFGNKWATIARLLSGRTDNAIKNHWNSTLKRKCSSLTSDDDAPPFKRSASAGSGSGAPMYLSPASPSGSDSSHTSFPVARAGADPPTSLSLSLPGVDSAESTESAQPQINPIQIQLLPPPPVQTQAPPPIDSRIAPFGAELMEVMQEMIRAEVRNYMVGIEQQKQQQQQQQNQRIQQQQKQI...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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