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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr06G001999`

染色体: Chr06 坐标: 25526593-25529411 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr06G001999`
名称	SmilChr06G001999
描述	putative oxidoreductase TDA3
染色体 / SeqID	Chr06 / NC_080392.1
坐标与链方向	25526593 - 25529411 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130990947`
GeneID	`130990947`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130990947`
原始查询	`SmilChr06G001999`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	putative oxidoreductase TDA3
产物	putative oxidoreductase TDA3
Arabidopsis	`AT5G67290` (AT5G67290) FAD-dependent oxidoreductase family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:836864] identity=67.6; qcov=0.896; evalue=7.62e-177; confidence=high
Rice	`Os07g0155100` - identity=59.6; qcov=0.923; evalue=1.65e-138; confidence=high
GO	GO:0005737 (cytoplasm); GO:0016491 (oxidoreductase activity)
KEGG	-
Pfam	PF01266 (DAO); PF13450 (NAD_binding_8)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130990947

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Chloroplast	叶绿体	1.00000	`XP_057771150.1`
2	Chloroplast stroma	叶绿体基质	0.20000	`XP_057771150.1`
3	Peroxisome	过氧化物酶体	0.20000	`XP_057771150.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057771150.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057771150.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr6:25526757`	`TTA`	`T`	2bp_deletion	frameshift_variant	1	B108
`Chr6:25526757`	`TTA`	`T`	2bp_deletion	CDS_variant	1	B108
`Chr6:25527049`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B13
`Chr6:25527052`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B140,C46
`Chr6:25527142`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr6:25527186`	`TG`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	7	A9,B128,B30,B45,B64,C19,C5
`Chr6:25527680`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B32
`Chr6:25527727`	`GA`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	D11
`Chr6:25527727`	`GA`	`G`	1bp_deletion	CDS_variant	1	D11
`Chr6:25527797`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr6:25527845`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C14
`Chr6:25527919`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A21

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057771150.1

413 aa

206

413

DAO

NAD_binding_8

PF01266 DAO 42-391 aa PF13450 NAD_binding_8 46-84 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057771150.1`	Pfam	`PF01266`	DAO	Domain	42	391	5.6e-46	158.4	FAD dependent oxidoreductase
`XP_057771150.1`	Pfam	`PF13450`	NAD_binding_8	Domain	46	84	3.1e-05	24.9	NAD(P)-binding Rossmann-like domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057915167.1
GGTAGGGAAGAAAAACAATAAACAAGCCAGCATAATACTTTTTTTTTTTAAGAAAACACAAGCCAGCATACTAAGCATAGTACTCAGTTCTAGGCATTACTTACTGACACGTGTCAGCTTAATAACCAGTAAATATGCCAGCAATCATCACCTCATCTTCACTCTTATCTCTCTTCCGGATCCAACCCCAACAACTCGGATCCGACCCGATCAAGGCCTCGGTTCGCTGCTCCTCATCAACCATGGACCCGCCAAAGAGA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130990947
ATGCCAGCAATCATCACCTCATCTTCACTCTTATCTCTCTTCCGGATCCAACCCCAACAACTCGGATCCGACCCGATCAAGGCCTCGGTTCGCTGCTCCTCATCAACCATGGACCCGCCAAAGAGAGTGATTGTCTGCGGCGGCGGAATCATCGGCGTCTGCACCGCCTACTTCCTATCCAAAACAGGCGTCGCCGTCACGCTAGTCGAGAAATCCTCAATCGCCTGCGCCGCCTCCGGCAAGGCTGGCGGCTTCCTCGC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057771150.1
MPAIITSSSLLSLFRIQPQQLGSDPIKASVRCSSSTMDPPKRVIVCGGGIIGVCTAYFLSKTGVAVTLVEKSSIACAASGKAGGFLALDWCDGGPVSSLARASFNLHRSLAEELNGAESYGYRPVTTLSLSIAETTSSASAQLSGKPSPIIPSWVDGPAKSPRIIGTAETTAQVHPQLFTKTLAGKAVEEYGLEVVIGKVESVEAAGGVAKAVVLLDGRRIEGDAVVLALGPWSGKFGLLRSIFRVSGLKAHSIVLEPKD...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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