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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr06G002005`

染色体: Chr06 坐标: 25725322-25727894 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr06G002005`
名称	SmilChr06G002005
描述	microtubule-associated protein RP/EB family member 1C
染色体 / SeqID	Chr06 / NC_080392.1
坐标与链方向	25725322 - 25727894 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130990953`
GeneID	`130990953`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130990953`
原始查询	`SmilChr06G002005`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	microtubule-associated protein RP/EB family member 1C
产物	microtubule-associated protein RP/EB family member 1C
Arabidopsis	`AT5G67270` (EB1C) end binding protein 1C [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:836862] identity=64.9; qcov=1.03; evalue=2.61e-147; confidence=high
Rice	`Os10g0498900` - identity=60.5; qcov=1.02; evalue=4.27e-146; confidence=high
GO	GO:0005815 (microtubule organizing center); GO:0005881 (cytoplasmic microtubule); GO:0009652 (thigmotropism); GO:0031110 (regulation of microtubule polymerization or depolymerization); GO:0035371 (microtubule plus-end); GO:0051010 (microtubule plus-end binding); GO:0051225 (spindle assembly); GO:0051233 (spindle midzone); GO:1904825 (protein localization to microtubule plus-end)
KEGG	-
Pfam	PF00307 (CH); PF03271 (EB1)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130990953

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoskeleton	细胞骨架	1.00000	`XP_057771153.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.80000	`XP_057771153.1`
3	Spindle	Spindle	0.60000	`XP_057771153.1`
4	Spindle pole	Spindle pole	0.60000	`XP_057771153.1`
5	Centrosome	中心体	0.20000	`XP_057771153.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr6:25725690`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C85
`Chr6:25725717`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B77
`Chr6:25727063`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C48
`Chr6:25727430`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B112,B132,B80,C1,D4
`Chr6:25727441`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B101,D7
`Chr6:25727490`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C49

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057771153.1

333 aa

166

333

EB1

PF00307 CH 16-107 aa PF03271 EB1 217-255 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057771153.1`	Pfam	`PF00307`	CH	Domain	16	107	3.3e-10	40.9	Calponin homology (CH) domain
`XP_057771153.1`	Pfam	`PF03271`	EB1	Family	217	255	6e-16	59.2	EB1-like C-terminal motif

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057915170.1
ATCACCATTCCCAAAGCCCTGATAATTTGAACTACAAAAATAAATTATCCCGCTCACACCTCATTTCAAACAACCTCACTCTAACGGCTCTCTCTCTCTCTCTCTAAAGTCTATACCAGACGCGCTCCAAATCAAAATTCCAAAGACAATTTTTGAGATACGAAATGGCGACAAATATTGGGATGATGGACTCCGCATACTTCGTCGGCAGATCGGAGATCCTCTCGTGGATCAATTCTACTCTCCATCTCAATCTCTCC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130990953
ATGGCGACAAATATTGGGATGATGGACTCCGCATACTTCGTCGGCAGATCGGAGATCCTCTCGTGGATCAATTCTACTCTCCATCTCAATCTCTCCAAAGTTGAAGAGGCTTGCACCGGCGCCGTCCATTGCCAGCTGATGGATGCGGTTCACCCAGGGATGGTTCCGATGCACAAAGTCAATTTCGACGCCAAGAGTGAGTATGAGATGATCCAGAACTACAAGGTCCTTCAAGATGTTTTCAACAAGCTCAAGGTCAC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057771153.1
MATNIGMMDSAYFVGRSEILSWINSTLHLNLSKVEEACTGAVHCQLMDAVHPGMVPMHKVNFDAKSEYEMIQNYKVLQDVFNKLKVTKHIEVNKLIKGRPLDNLEFMQWMKRYCDCANGGQMNNYNALERREACKGGKELSKKSAASQPSTKSSASVPKQGTSHNGRRADAAHANAANQSVKAVRPSSSGGRSGCSDAERTMFEQQITELKLSIDSLEKERDFYFAKLRDIEILCQTPDIEKLPVVGAMKRILYAAEDDA...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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