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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr06G002022`

染色体: Chr06 坐标: 26061076-26063758 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr06G002022`
名称	SmilChr06G002022
描述	uncharacterized SmilChr06G002022
染色体 / SeqID	Chr06 / NC_080392.1
坐标与链方向	26061076 - 26063758 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130990688`
GeneID	`130990688`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130990688`
原始查询	`SmilChr06G002022`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os12g0597300; species=rice; confidence=low
产物	hit=Os12g0597300; species=rice; confidence=low
Arabidopsis	`AT1G06740` (MUG3) MuDR family transposase [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:3766669] identity=24.7; qcov=0.766; evalue=1.42e-48; confidence=weak
Rice	`Os12g0597300` - identity=26.6; qcov=0.773; evalue=9.6e-56; confidence=low
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF00872 (Transposase_mut); PF10551 (MULE)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130990688

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057770896.1`
2	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057770896.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057770896.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057770896.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057770896.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr6:26061082`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B53,D4
`Chr6:26061092`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B129,B31
`Chr6:26061106`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C48
`Chr6:26061155`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C51,C74
`Chr6:26061167`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B12,B137,B55,C2
`Chr6:26061189`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B32
`Chr6:26061192`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	29	A3,B1,B100,B119,B123,B22,B23,B3,B30,B34,B37,B41,B44,B48,B58,B61,B66,B7,B70,B81,B91,B98,C15,C46,C5,C62,C71,C80,D3
`Chr6:26061203`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D2
`Chr6:26061218`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B10,B32,D10
`Chr6:26061243`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B104,B110,C37
`Chr6:26061262`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B104,C82
`Chr6:26061296`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B23

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057770896.1

730 aa

365

730

MULE

Transposase_mut

PF10551 MULE 345-439 aa PF00872 Transposase_mut 376-515 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057770896.1`	Pfam	`PF10551`	MULE	Domain	345	439	2e-17	64.1	MULE transposase domain
`XP_057770896.1`	Pfam	`PF00872`	Transposase_mut	Family	376	515	1.2e-07	31.7	Transposase, Mutator family

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057914913.1
ATGGTTAATTATGGAGGTGCCTTCAATGCTTATGAGTACATCGGCGGCTCTTCTAAGAGTGGGGATGGTTTGGAAGCAATCCAAAGATATGCTTATTTAGACTTATCAGCCGGAGATTCACCAGCGCAAGAAATTGTTGAACCGTCGGTCACTTGGGGTAATCATCAATCAACGGGTTGGCCTTCATGGGATGAGCCAGATCCGAACGTTTACTATCACCAAACAACTGAGCATTCTTGGGGTCCAGCTGATAATCAATA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130990688
ATGGTTAATTATGGAGGTGCCTTCAATGCTTATGAGTACATCGGCGGCTCTTCTAAGAGTGGGGATGGTTTGGAAGCAATCCAAAGATATGCTTATTTAGACTTATCAGCCGGAGATTCACCAGCGCAAGAAATTGTTGAACCGTCGGTCACTTGGGGTAATCATCAATCAACGGGTTGGCCTTCATGGGATGAGCCAGATCCGAACGTTTACTATCACCAAACAACTGAGCATTCTTGGGGTCCAGCTGATAATCAATA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057770896.1
MVNYGGAFNAYEYIGGSSKSGDGLEAIQRYAYLDLSAGDSPAQEIVEPSVTWGNHQSTGWPSWDEPDPNVYYHQTTEHSWGPADNQYTDEPQFVENADNADEEYVPSSESKTDTSASEDLSELENLRRAGIENAAALVDIEDYQLLPRELSKNSYFNSKDDLIVAIGLRNMKQGKEYSVTKSDSRRIYFKCKHSNKCPFKLSASSQDGSIWDVYKFTNEHSCDGDLGRVKRIKAPAKVVASYLAQKIHDDCEILKPKAIQ...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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