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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID,以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因,再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。
示例

当前解析结果

SmilChr06G002037

染色体: Chr06 坐标: 26622988-26623580 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene IDSmilChr06G002037
名称SmilChr06G002037
描述protein RALF-like 34
染色体 / SeqIDChr06 / NC_080392.1
坐标与链方向26622988 - 26623580 / +

ID 对照

NCBI Gene IDLOC130990098
GeneID130990098
locus_tag-
NCBI NameLOC130990098
原始查询SmilChr06G002037

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述protein RALF-like 34
产物protein RALF-like 34
ArabidopsisAT5G67070 (RALFL34)
ralf-like 34 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:836842]
identity=77.8; qcov=0.783; evalue=1.5e-36; confidence=medium
RiceOs05g0203000 (OsRALF-21)
-
identity=50; qcov=0.717; evalue=8.32e-13; confidence=low
GO-
KEGG-
PfamPF05498 (RALF)
InterPro-
eggNOG-
NRGeneID:130990098

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank定位位置中文ScoreProtein ID
1 Secreted 分泌到胞外 1.00000 XP_057770286.1
2 Nucleus 细胞核 0.00000 XP_057770286.1
3 Chromosome 染色体 0.00000 XP_057770286.1
4 Centromere 着丝粒 0.00000 XP_057770286.1
5 Chromatin 染色质 0.00000 XP_057770286.1

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

该基因暂未检索到已上线的精选 EMS CDS / LoF 突变,或 EMS 突变库仍在构建。

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan;位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057770286.1
92 aa
N
1
46
92
RALF
C
PF05498 RALF 28-92 aa
Protein ID 来源 结构域编号 结构域名称 类型 起始 aa 终止 aa E-value Score 说明
XP_057770286.1 Pfam PF05498 RALF Family 28 92 3.1e-22 80.1 Rapid ALkalinization Factor (RALF)

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA(仅基因区域)

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA
XM_057914303.1
ATGAATGTAATTATGGTGTGTCCCACTCCTACTCGCTCTGGAGCAAAGTAACAACACAGTCTTCACTCTTGTCTCATCAATTCCCCCACAATGGCTTCCCGCTTCCTCTTCGCCCTAACTCTCCTCCTCCTCCTCGTCCTCTCCGCCGCCGAGGAAGAAGCCATGGATGACGGCGCGCCTAATCGCCGCTCACTCTTCTGGAACAAAGCGATCCACTACTACATCTCCTACGGCGCTCTCTCCGCCAACAGGATCCCTTG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA
LOC130990098
ATGGCTTCCCGCTTCCTCTTCGCCCTAACTCTCCTCCTCCTCCTCGTCCTCTCCGCCGCCGAGGAAGAAGCCATGGATGACGGCGCGCCTAATCGCCGCTCACTCTTCTGGAACAAAGCGATCCACTACTACATCTCCTACGGCGCTCTCTCCGCCAACAGGATCCCTTGCCCGCCGCGCTCCGGCCGCTCCTACTACACGCATAATTGCCACAGAGCGAGGGGCCCCGTCCACCCCTACTCCCGCGGCTGCTCCGCCAT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA
XP_057770286.1
MASRFLFALTLLLLLVLSAAEEEAMDDGAPNRRSLFWNKAIHYYISYGALSANRIPCPPRSGRSYYTHNCHRARGPVHPYSRGCSAITRCRR

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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