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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr06G002038`

染色体: Chr06 坐标: 26634273-26635415 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr06G002038`
名称	SmilChr06G002038
描述	uncharacterized SmilChr06G002038
染色体 / SeqID	Chr06 / NC_080392.1
坐标与链方向	26634273 - 26635415 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130990693`
GeneID	`130990693`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130990693`
原始查询	`SmilChr06G002038`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os11g0577650; species=rice; confidence=medium
产物	hit=Os11g0577650; species=rice; confidence=medium
Arabidopsis	`AT5G41980` (AT5G41980) nuclease [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:834203] identity=38.4; qcov=0.626; evalue=1.08e-20; confidence=low
Rice	`Os11g0577650` - identity=61.3; qcov=0.62; evalue=5.88e-41; confidence=medium
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF26138 (DUF8040)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130990693

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057770902.1`
2	Chromosome	染色体	0.40000	`XP_057770902.1`
3	Telomere	端粒	0.40000	`XP_057770902.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057770902.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057770902.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr6:26634316`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C16
`Chr6:26634405`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B71
`Chr6:26634406`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A13,B37
`Chr6:26634448`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A13,B37
`Chr6:26634472`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B134
`Chr6:26634537`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B122,B24,C82
`Chr6:26634648`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B37
`Chr6:26635257`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B6
`Chr6:26635307`	`T`	`TA`	1bp_insertion	frameshift_variant	2	A13,B37
`Chr6:26635307`	`T`	`TA`	1bp_insertion	CDS_variant	2	A13,B37

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057770902.1

179 aa

179

DUF8040

PF26138 DUF8040 1-70 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057770902.1`	Pfam	`PF26138`	DUF8040	Domain	1	70	1.8e-23	82.9	Domain of unknown function (DUF8040)

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057914919.1
ATGGATAGATACACGTTTAGAAGGCTAGTTAACATGCTTCAAACGACTGGACGACTAAGAGCTACAAGGAACCTGACAGTTGATGAGCAAGTTGCTATTTTTCTATACATACTAGCACATCATCAAAAGAACCGTACAATGAAAACTAATTTCTTACGGTCAGGAGAAACAATTAGTAGGTATTTCAATAAGGTATTGAGTGCAGTTCTTAGGCTTCAAGGTCATTTACTAAAAGCTCCTATGCCTATAGCTGAGGATTC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130990693
ATGGATAGATACACGTTTAGAAGGCTAGTTAACATGCTTCAAACGACTGGACGACTAAGAGCTACAAGGAACCTGACAGTTGATGAGCAAGTTGCTATTTTTCTATACATACTAGCACATCATCAAAAGAACCGTACAATGAAAACTAATTTCTTACGGTCAGGAGAAACAATTAGTAGGTATTTCAATAAGGTATTGAGTGCAGTTCTTAGGCTTCAAGGTCATTTACTAAAAGCTCCTATGCCTATAGCTGAGGATTC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057770902.1
MDRYTFRRLVNMLQTTGRLRATRNLTVDEQVAIFLYILAHHQKNRTMKTNFLRSGETISRYFNKVLSAVLRLQGHLLKAPMPIAEDSTDVKWKWFKNCIGALDGTHIEVKVSENHIRDHMPVDPIETHYNDNLQNEDQDAIELDGEPITSVEPTQEWTDWRYNLASQMFNQWMQNRHVA

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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