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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr06G002043`

染色体: Chr06 坐标: 26707110-26710939 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr06G002043`
名称	SmilChr06G002043
描述	PI-PLC X domain-containing protein At5g67130-like
染色体 / SeqID	Chr06 / NC_080392.1
坐标与链方向	26707110 - 26710939 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130990093`
GeneID	`130990093`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130990093`
原始查询	`SmilChr06G002043`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	PI-PLC X domain-containing protein At5g67130-like
产物	PI-PLC X domain-containing protein At5g67130-like
Arabidopsis	`AT4G36945` (AT4G36945) PLC-like phosphodiesterases superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:5008186] identity=57.6; qcov=0.922; evalue=3.54e-140; confidence=high
Rice	`Os08g0103500` - identity=53.7; qcov=0.883; evalue=3.01e-131; confidence=high
GO	GO:0006629 (lipid metabolic process); GO:0008081 (phosphoric diester hydrolase activity)
KEGG	-
Pfam	PF26146 (PI-PLC_X)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130990093

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cell membrane	细胞膜	1.00000	`XP_057770280.1`
2	Cell wall	细胞壁	0.40000	`XP_057770282.1`
3	Vacuole	液泡	0.40000	`XP_057770283.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057770280.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057770280.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr6:26709690`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C1
`Chr6:26710327`	`ACG`	`A`	2bp_deletion	frameshift_variant	2	B48,B97
`Chr6:26710327`	`ACG`	`A`	2bp_deletion	CDS_variant	2	B48,B97

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057770280.1

430 aa

215

430

PI-PLC_X

PF26146 PI-PLC_X 128-353 aa

XP_057770281.1

412 aa

206

412

PI-PLC_X

PF26146 PI-PLC_X 128-335 aa

XP_057770282.1

403 aa

202

403

PI-PLC_X

PF26146 PI-PLC_X 101-326 aa

XP_057770283.1

384 aa

192

384

PI-PLC_X

PF26146 PI-PLC_X 94-307 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057770280.1`	Pfam	`PF26146`	PI-PLC_X	Domain	128	353	1.5e-23	84.3	PI-PLC X 1
`XP_057770281.1`	Pfam	`PF26146`	PI-PLC_X	Domain	128	335	1.8e-15	57.9	PI-PLC X 1
`XP_057770282.1`	Pfam	`PF26146`	PI-PLC_X	Domain	101	326	1.3e-23	84.6	PI-PLC X 1
`XP_057770283.1`	Pfam	`PF26146`	PI-PLC_X	Domain	94	307	1.7e-18	67.7	PI-PLC X 1

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

4 records

下载 cDNA FASTA

XM_057914297.1
GTAGAGAGAAATGGCACAATTACACATCCTTTTTTAAAGTGTCTTGCTCTCTCTCCTCTTTCTCTCTCTAAATCTGTCTGCTAATTTTTAGGAGTCCCAAAACCAAATGCAGGCATGCAAAAATTGAGCCCTCCTATGTTTAAGCTTCATTCTCGTCGTCACCTTTCTGAATCGACTTGCCTTCGCCTTCTGTCTTCTCAGGCTCTCAACTATGCGCCCTTAAAGCTGTTCTTCGTAGCAGCTTTCCTCTTTCCCTATTC...

XM_057914299.1
GAAATGGCACAATTACACATCCTTTTTTAAAGTGTCTTGCTCTCTCTCCTCTTTCTCTCTCTAAATCTGTCTGCTAATTTTTAGGAGTCCCAAAACCAAATGCAGGCTCTCAACTATGCGCCCTTAAAGCTGTTCTTCGTAGCAGCTTTCCTCTTTCCCTATTCTTCAACCCTCAAGATTGGCGAAACCTGTTCCAGCTCCAGCAGTAACTGCGACGCCGGCTCGAATTGCGGTAGCTGCGTTGCCAACGGCAACACCAG...

CDS

4 records

下载 CDS FASTA

LOC130990093
ATGCAGGCTCTCAACTATGCGCCCTTAAAGCTGTTCTTCGTAGCAGCTTTCCTCTTTCCCTATTCTTCAACCCTCAAGATTGGCGAAACCTGTTCCAGCTCCAGCAGTAACTGCGACGCCGGCTCGAATTGCGGTAGCTGCGTTGCCAACGGCAACACCAGGCCTCGTTGCACCCGCATTCAACCTATAAATCCTTTGACTAAGGTAGGAGGGCTGCCTTTTAACAAGTATTCATGGCTTACGACACACAACTCGTTTGC...

LOC130990093
ATGCAAAAATTGAGCCCTCCTATGTTTAAGCTTCATTCTCGTCGTCACCTTTCTGAATCGACTTGCCTTCGCCTTCTGTCTTCTCAGGCTCTCAACTATGCGCCCTTAAAGCTGTTCTTCGTAGCAGCTTTCCTCTTTCCCTATTCTTCAACCCTCAAGATTGGCGAAACCTGTTCCAGCTCCAGCAGTAACTGCGACGCCGGCTCGAATTGCGGTAGCTGCGTTGCCAACGGCAACACCAGGCCTCGTTGCACCCGCAT...

Protein

4 records

下载 Protein FASTA

XP_057770280.1
MQKLSPPMFKLHSRRHLSESTCLRLLSSQALNYAPLKLFFVAAFLFPYSSTLKIGETCSSSSSNCDAGSNCGSCVANGNTRPRCTRIQPINPLTKVGGLPFNKYSWLTTHNSFALTGRKSGVGSDLLAPTNQEDSVTDQLKNGVRGLMLDMYDFNNDIWLCHSFGGRCLNVTAFQPAINVLREIQAFLHENPTEIVTIFVEDYVASPQGLTKVFNASGLNQYLFPLSQMPKNGEEWPIVDDMVKKNQRLVVFSSQSSKEA...

XP_057770281.1
MQKLSPPMFKLHSRRHLSESTCLRLLSSQALNYAPLKLFFVAAFLFPYSSTLKIGETCSSSSSNCDAGSNCGSCVANGNTRPRCTRIQPINPLTKVGGLPFNKYSWLTTHNSFALTGRKSGVGSDLLAPTNQEDSVTDQLKNGVRGLMLDMYDFNNDIWLCHSFGGRCLNVTAFVKIVTIFVEDYVASPQGLTKVFNASGLNQYLFPLSQMPKNGEEWPIVDDMVKKNQRLVVFSSQSSKEASEMVAFEWNYVVESQYGN...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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