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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr06G002044`

染色体: Chr06 坐标: 26727968-26729446 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr06G002044`
名称	SmilChr06G002044
描述	protein FAR1-RELATED SEQUENCE 5-like
染色体 / SeqID	Chr06 / NC_080392.1
坐标与链方向	26727968 - 26729446 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130990696`
GeneID	`130990696`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130990696`
原始查询	`SmilChr06G002044`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	protein FAR1-RELATED SEQUENCE 5-like
产物	protein FAR1-RELATED SEQUENCE 5-like
Arabidopsis	`AT4G38180` (FRS5) FAR1-related sequence 5 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:829974] identity=30.5; qcov=0.832; evalue=5.05e-59; confidence=low
Rice	`Os06g0166100` - identity=34.1; qcov=0.904; evalue=1.08e-87; confidence=low
GO	GO:0003700 (DNA-binding transcription factor activity); GO:0006355 (regulation of DNA-templated transcription); GO:0043565 (sequence-specific DNA binding)
KEGG	-
Pfam	PF03101 (FAR1); PF10551 (MULE)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130990696

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057770906.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.20000	`XP_057770906.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057770906.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057770906.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057770906.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr6:26728116`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B115,B89,C82
`Chr6:26728136`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	1	A4
`Chr6:26728136`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A4
`Chr6:26728180`	`A`	`ATC`	2bp_insertion	frameshift_variant	2	B36,B61
`Chr6:26728180`	`A`	`ATC`	2bp_insertion	CDS_variant	2	B36,B61
`Chr6:26728192`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B36,B61
`Chr6:26728203`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A9,C14,C20
`Chr6:26728234`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B42,B86,C2
`Chr6:26728251`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B66
`Chr6:26728294`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B14,B66,C10,C45
`Chr6:26728296`	`AAG`	`A`	2bp_deletion	frameshift_variant	43	A20,A8,A9,B1,B104,B113,B123,B13,B134,B14,B17,B21,B23,B36,B44,B53,B54,B58,B61,B66,B67,B69,B72,B83,B92,C10,C14,C15,C16,C20,C40,C44,C45,C46,C48,C52,C61,C67,C69,C76,C83,C87,D10
`Chr6:26728299`	`G`	`GAA`	2bp_insertion	frameshift_variant	43	A20,A8,A9,B1,B104,B113,B123,B13,B134,B14,B17,B21,B23,B36,B44,B53,B54,B58,B61,B66,B67,B69,B72,B83,B92,C10,C14,C15,C16,C20,C40,C44,C45,C46,C48,C52,C61,C67,C69,C76,C83,C87,D10

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057770906.1

477 aa

238

477

FAR1

MULE

PF03101 FAR1 74-164 aa PF10551 MULE 288-382 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057770906.1`	Pfam	`PF03101`	FAR1	Domain	74	164	5.8e-16	59.7	FAR1 DNA-binding domain
`XP_057770906.1`	Pfam	`PF10551`	MULE	Domain	288	382	1.4e-25	90.2	MULE transposase domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057914923.1
ATGAAGGTTGTCCCGATTTTGAGAGTGGTAGTGGTAGTGGTAATAGCAGAGAAGTTGTCTGAAGATAGTGTCCATATTGATAGCAGTGCTCAAGGTACAGATGGAAATAATGTAGATTTTGGGCAAGGAAGTGATAACGAAGTTCTTGTGACATTGGCCGAAGTGGAAGGGAAGATTAACGTTCGATGTGCCATTGACACATTGGATGATGTTTTTGTTCTGTATGCAGCATATGCCCGGATGATTGGTTTTTCAGCTCG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130990696
ATGAAGGTTGTCCCGATTTTGAGAGTGGTAGTGGTAGTGGTAATAGCAGAGAAGTTGTCTGAAGATAGTGTCCATATTGATAGCAGTGCTCAAGGTACAGATGGAAATAATGTAGATTTTGGGCAAGGAAGTGATAACGAAGTTCTTGTGACATTGGCCGAAGTGGAAGGGAAGATTAACGTTCGATGTGCCATTGACACATTGGATGATGTTTTTGTTCTGTATGCAGCATATGCCCGGATGATTGGTTTTTCAGCTCG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057770906.1
MKVVPILRVVVVVVIAEKLSEDSVHIDSSAQGTDGNNVDFGQGSDNEVLVTLAEVEGKINVRCAIDTLDDVFVLYAAYARMIGFSARKGTQAYFKGTNKISCGKVFHCSCEGQLDNKSSKGCVAALKKHSYRSNCKARLRVSRTDVESPWVVTTFVKKHNHDMLHPTKTYLLRSARKLAHSQKTILIAMKSSGIGVSRSYHFLENEAGGRENVGFLRKDVYNELNRENANMAKVANFDANKLMEYFTEKGLSDPLFYCKV...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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