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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr06G002056`

染色体: Chr06 坐标: 27082629-27083252 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr06G002056`
名称	SmilChr06G002056
描述	uncharacterized SmilChr06G002056
染色体 / SeqID	Chr06 / NC_080392.1
坐标与链方向	27082629 - 27083252 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130990700`
GeneID	`130990700`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130990700`
原始查询	`SmilChr06G002056`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	Polynucleotidyl transferase, ribonuclease H-like superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:819255]; symbol=AT2G46460; hit=AT2G46460; species=arabidopsis; confidence=low
产物	Polynucleotidyl transferase, ribonuclease H-like superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:819255]; symbol=AT2G46460; hit=AT2G46460; species=arabidopsis; confidence=low
Arabidopsis	`AT2G46460` (AT2G46460) Polynucleotidyl transferase, ribonuclease H-like superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:819255] identity=31.5; qcov=0.691; evalue=3.25e-12; confidence=low
Rice	`Os06g0683500` - identity=25.8; qcov=0.787; evalue=2.21e-10; confidence=low
GO	GO:0003676 (nucleic acid binding); GO:0004523 (RNA-DNA hybrid ribonuclease activity)
KEGG	-
Pfam	PF13456 (RVT_3)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130990700

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	0.80000	`XP_057770911.1`
2	Nucleus	细胞核	0.60000	`XP_057770911.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057770911.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057770911.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057770911.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr6:27082633`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	3	B103,B15,C35
`Chr6:27082633`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B103,B15,C35
`Chr6:27082650`	`AC`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	2	A15,C38
`Chr6:27082650`	`AC`	`A`	1bp_deletion	CDS_variant	2	A15,C38
`Chr6:27082660`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C48
`Chr6:27082748`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C48
`Chr6:27082787`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A3,B66,B98
`Chr6:27082843`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C86
`Chr6:27082858`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B139,B19,B32,C4
`Chr6:27082930`	`T`	`TC`	1bp_insertion	frameshift_variant	2	B44,C62
`Chr6:27082930`	`T`	`TC`	1bp_insertion	CDS_variant	2	B44,C62
`Chr6:27082948`	`C`	`CTA`	2bp_insertion	frameshift_variant	4	A10,B94,C43,C75

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057770911.1

207 aa

104

207

RVT_3

PF13456 RVT_3 58-176 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057770911.1`	Pfam	`PF13456`	RVT_3	Domain	58	176	9.8e-16	58.5	Reverse transcriptase-like

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057914928.1
ATGTGGGTGAGTCGACATGATACTCGTTCTACGCTATCACTGGCTAGAAAGCGGGCCGCGACAAAAGAGTATCTTGTTATCAGACAGTTGGGCATTAGAGTACGTGAGAAGTCGTCCCCGAAGTTTGACTCTGTTTACTGGTCCCCTCCTACTTACTCGTGGTTTAAAGTGAACACTGATGGTTCTACCATCAGAGCGCCTGGACGTATTTGTGCGGGCAGGGTTTTCAGAGACTGGAGAGGCATGGTTCGTGGTTGTTT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130990700
ATGTGGGTGAGTCGACATGATACTCGTTCTACGCTATCACTGGCTAGAAAGCGGGCCGCGACAAAAGAGTATCTTGTTATCAGACAGTTGGGCATTAGAGTACGTGAGAAGTCGTCCCCGAAGTTTGACTCTGTTTACTGGTCCCCTCCTACTTACTCGTGGTTTAAAGTGAACACTGATGGTTCTACCATCAGAGCGCCTGGACGTATTTGTGCGGGCAGGGTTTTCAGAGACTGGAGAGGCATGGTTCGTGGTTGTTT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057770911.1
MWVSRHDTRSTLSLARKRAATKEYLVIRQLGIRVREKSSPKFDSVYWSPPTYSWFKVNTDGSTIRAPGRICAGRVFRDWRGMVRGCFHVEGGNGFAFEAELLGLISAIEFAYSNGRLKIWFEADSSYVVHILSTKSRRVPWHFVAIWNHALHLVENMEFRISHIFREGNSPVDIMVSPHTPEGWWTHNIDIIKDAMIRDLSVYSHFR

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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