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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr06G002065`

染色体: Chr06 坐标: 27178638-27182633 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr06G002065`
名称	SmilChr06G002065
描述	uncharacterized SmilChr06G002065
染色体 / SeqID	Chr06 / NC_080392.1
坐标与链方向	27178638 - 27182633 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130988964`
GeneID	`130988964`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130988964`
原始查询	`SmilChr06G002065`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	Remorin family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:841090]; symbol=AT1G45207; hit=AT1G45207; species=arabidopsis; confidence=medium
产物	Remorin family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:841090]; symbol=AT1G45207; hit=AT1G45207; species=arabidopsis; confidence=medium
Arabidopsis	`AT1G45207` (AT1G45207) Remorin family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:841090] identity=42.6; qcov=0.979; evalue=6.94e-61; confidence=medium
Rice	`Os02g0767000` (OsREM5.1) - identity=43.6; qcov=1.06; evalue=5.62e-60; confidence=medium
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF03763 (Remorin_C)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130988964

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cell membrane	细胞膜	0.80000	`XP_057768935.1`
2	Nucleus	细胞核	0.40000	`XP_057768935.1`
3	Nucleus membrane	核膜	0.20000	`XP_057768935.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057768935.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057768935.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr6:27179064`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A10,D1
`Chr6:27179190`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C74,D10
`Chr6:27179284`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B120,B75,C10
`Chr6:27179367`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B108
`Chr6:27181029`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr6:27181275`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	1	A6
`Chr6:27181275`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A6

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057768935.1

338 aa

169

338

Remorin_C

PF03763 Remorin_C 276-331 aa

XP_057768936.1

338 aa

169

338

Remorin_C

PF03763 Remorin_C 276-331 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057768935.1`	Pfam	`PF03763`	Remorin_C	Family	276	331	5.5e-18	65.4	Remorin, C-terminal region
`XP_057768936.1`	Pfam	`PF03763`	Remorin_C	Family	276	331	5.5e-18	65.4	Remorin, C-terminal region

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XM_057912952.1
CCAAACAAATTTACAAATCCATTTGCCAAATATGTTTTGGCGAAATCACCACCCAGCAAAGAGAGAGAGAGAGATCCAAAGTCGATCCAGAGAGGGCCCGTATGTTTTGGGAGTATCCTCACATGGATTGGAAATGAAATGAGAGACATCATCTGCCAACTCAACCTTCTTCACCTTCTCTCTCTCTCCTCCTTCCTCCATTAATTTATTATTGAAAAAAACTGAGTCTTCAGGTGCAGAGAATTCAAATCACCACACCC...

XM_057912953.1
CAAATATGTTTTGGCGAAATCACCACCCAGCAAAGAGAGAGAGAGAGATCCAAAGTCGATCCAGAGAGGGCCCGTATGTTTTGGGAGTATCCTCACATGGATTGGAAATGAAATGAGAGACATCATCTGCCAACTCAACCTTCTTCACCTTCTCTCTCTCTCCTCCTTCCTCCATTAATTTATTATTGAAAAAAACTGAGTCTTCAGGTGCAGAGAATTCAAATCACCACACCCATTATTTCCCTCAGCTATACTTTTCT...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA

LOC130988964
ATGAGAAGGAATTCGGGGCCGCCTTTTAGGAACTCCGGTGCCTTCACTAGCCCGGGGACACCCGAGTATGGTGATCACTTGCCGAAGACGTGGAGCTCTGAGAGAGTGCCGTTGCCTGCAAGCAGTAGTAGGAGGCATGTCTCTGCTGCTGCATTGATGCCCTTCAATAGTGGGAGGACTGTGCCTTCGAAATGGGATGATGCCGAGAGATGGATCACTAGCCCGATTTCGGGGTTTGGCGCCTTCAACACTGCGGCTGC...

Protein

2 records

下载 Protein FASTA

XP_057768935.1
MRRNSGPPFRNSGAFTSPGTPEYGDHLPKTWSSERVPLPASSSRRHVSAAALMPFNSGRTVPSKWDDAERWITSPISGFGAFNTAAAQRRPKSKSGPLGPTPMGLVYLPNYSPTMPVHEGGAVRNFMANSPLTTGVLVPEGLSVHYESEMAARSRSLYAEDNRRHGASMLGLSDMLSETSEPSSQDEKFGGKEEEALVSRRDVATQMSPDGSTRSSSKGRLSFSTRSSIPMLERLHAGKDDIRDVQVDKGTDTCRGSRKQ...

XP_057768936.1
MRRNSGPPFRNSGAFTSPGTPEYGDHLPKTWSSERVPLPASSSRRHVSAAALMPFNSGRTVPSKWDDAERWITSPISGFGAFNTAAAQRRPKSKSGPLGPTPMGLVYLPNYSPTMPVHEGGAVRNFMANSPLTTGVLVPEGLSVHYESEMAARSRSLYAEDNRRHGASMLGLSDMLSETSEPSSQDEKFGGKEEEALVSRRDVATQMSPDGSTRSSSKGRLSFSTRSSIPMLERLHAGKDDIRDVQVDKGTDTCRGSRKQ...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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