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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr06G002079`

染色体: Chr06 坐标: 27406944-27409455 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr06G002079`
名称	SmilChr06G002079
描述	uncharacterized SmilChr06G002079
染色体 / SeqID	Chr06 / NC_080392.1
坐标与链方向	27406944 - 27409455 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130990707`
GeneID	`130990707`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130990707`
原始查询	`SmilChr06G002079`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os12g0539700; species=rice; confidence=medium
产物	hit=Os12g0539700; species=rice; confidence=medium
Arabidopsis	`-` -
Rice	`Os12g0539700` - identity=40.5; qcov=0.478; evalue=1.05e-90; confidence=medium
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF14214 (Helitron_like_N)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130990707

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057770918.1`
2	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057770918.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057770918.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057770918.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057770918.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr6:27406989`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr6:27407055`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A10,A4,C80,D1
`Chr6:27407213`	`G`	`GA`	1bp_insertion	frameshift_variant	8	A16,B103,B42,B63,B87,B90,B93,C31
`Chr6:27407218`	`TG`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	9	A16,B103,B20,B42,B63,B87,B90,B93,C31
`Chr6:27407239`	`T`	`TGA`	2bp_insertion	frameshift_variant	12	A16,B103,B139,B20,B4,B42,B63,B87,B90,B93,C10,C31
`Chr6:27407240`	`ACT`	`A`	2bp_deletion	frameshift_variant	12	A16,B103,B139,B20,B4,B42,B63,B87,B90,B93,C10,C31
`Chr6:27407325`	`G`	`GT`	1bp_insertion	frameshift_variant	73	A11,A23,A5,A7,B1,B10,B103,B104,B105,B106,B109,B115,B117,B119,B125,B127,B130,B131,B139,B17,B20,B22,B3,B30,B35,B4,B42,B43,B48,B49,B52,B54,B60,B63,B64,B65,B66,B7,B74,B75,B77,B79,B82,B84,B9,B90,C10,C14,C16,C18,C19,C20,C26,C31,C35,C36,C39,C41,C43,C45,C46,C53,C60,C63,C66,C67,C68,C70,C71,C73,C74,C84,C87
`Chr6:27407327`	`G`	`GTA`	2bp_insertion	frameshift_variant	73	A11,A23,A5,A7,B1,B10,B103,B104,B105,B106,B109,B115,B117,B119,B125,B127,B130,B131,B139,B17,B20,B22,B3,B30,B35,B4,B42,B43,B48,B49,B52,B54,B60,B63,B64,B65,B66,B7,B74,B75,B77,B79,B82,B84,B9,B90,C10,C14,C16,C18,C19,C20,C26,C31,C35,C36,C39,C41,C43,C45,C46,C53,C60,C63,C66,C67,C68,C70,C71,C73,C74,C84,C87
`Chr6:27407330`	`GCA`	`G`	2bp_deletion	frameshift_variant	72	A11,A23,A5,A7,B1,B10,B103,B104,B105,B106,B109,B115,B117,B119,B125,B127,B130,B131,B139,B17,B20,B22,B3,B30,B35,B4,B42,B43,B48,B49,B52,B54,B60,B63,B64,B65,B66,B7,B74,B75,B77,B79,B82,B84,B9,B90,C10,C14,C16,C18,C19,C20,C26,C31,C35,C36,C39,C41,C43,C45,C46,C53,C60,C63,C66,C67,C68,C70,C71,C73,C84,C87
`Chr6:27407333`	`A`	`AT`	1bp_insertion	frameshift_variant	5	A1,B138,B8,C34,D7
`Chr6:27407333`	`A`	`AT`	1bp_insertion	CDS_variant	5	A1,B138,B8,C34,D7
`Chr6:27407338`	`GC`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	5	A1,B138,B8,C34,D7

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057770918.1

781 aa

390

781

Helitron_like_N

PF14214 Helitron_like_N 206-388 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057770918.1`	Pfam	`PF14214`	Helitron_like_N	Domain	206	388	1.6e-63	215.1	Helitron helicase-like domain at N-terminus

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057914935.1
ATGGGTGGTAAAATTGATCACTCGATAAATCAAGGCAATACCCCTCCGATTTTTCGATTGCATGGGCAAAACTATCATCTCATTGGTAGTTTGATGCCTATGGAAGGTTGTCCTCCAAAGTTTGCACAGTTGTATATCTATGACACAGATAATGAAGTTCACAATAGAATACTTTCAGTGAGGGATGTTGGAAATTATAATGATTTACATACTGAAATTGTGCGTGATTTGCAAGCAATGCTTGATGAACAAAATGTGTT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130990707
ATGGGTGGTAAAATTGATCACTCGATAAATCAAGGCAATACCCCTCCGATTTTTCGATTGCATGGGCAAAACTATCATCTCATTGGTAGTTTGATGCCTATGGAAGGTTGTCCTCCAAAGTTTGCACAGTTGTATATCTATGACACAGATAATGAAGTTCACAATAGAATACTTTCAGTGAGGGATGTTGGAAATTATAATGATTTACATACTGAAATTGTGCGTGATTTGCAAGCAATGCTTGATGAACAAAATGTGTT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057770918.1
MGGKIDHSINQGNTPPIFRLHGQNYHLIGSLMPMEGCPPKFAQLYIYDTDNEVHNRILSVRDVGNYNDLHTEIVRDLQAMLDEQNVLAKSFRMAKDRLRDAIQPDVNLRLISERGKDARTYNLPSTSEVAALIVGDIDDSMGNRDIVIEFKSGQLKRINELHPSYLALQYPLLFPYGEDGYKCDIPFAKGVEESKYSRKKISVKEFLAYRLHERRGEFSILFYCRRLFQQFIVDSYTMVEAGRLNFFRYNQKKLRCDMYK...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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