当前解析结果
SmilChr06G002083| 统一新 Gene ID | SmilChr06G002083 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr06G002083 |
| 描述 | uncharacterized SmilChr06G002083 |
| 染色体 / SeqID | Chr06 / NC_080392.1 |
| 坐标与链方向 | 27475703 - 27476887 / - |
| NCBI Gene ID | LOC130990709 |
|---|---|
| GeneID | 130990709 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC130990709 |
| 原始查询 | SmilChr06G002083 |
| 来源 | GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | confidence=no_hit |
| 产物 | confidence=no_hit |
| Arabidopsis | -- |
| Rice | -- |
| GO | - |
| KEGG | - |
| Pfam | - |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:130990709 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Nucleus | 细胞核 | 1.00000 | XP_057770921.1 |
| 2 | Cytoplasm | 细胞质 | 1.00000 | XP_057770921.1 |
| 3 | Chromosome | 染色体 | 0.00000 | XP_057770921.1 |
| 4 | Centromere | 着丝粒 | 0.00000 | XP_057770921.1 |
| 5 | Chromatin | 染色质 | 0.00000 | XP_057770921.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr6:27475714 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | stop_gained | 1 | A10 |
Chr6:27475714 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | A10 |
Chr6:27475716 |
GGT |
G |
2bp_deletion | frameshift_variant | 4 | B12,B52,C61,D8 |
Chr6:27475716 |
GGT |
G |
2bp_deletion | CDS_variant | 4 | B12,B52,C61,D8 |
Chr6:27475726 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | B12,B52,C61,D8 |
Chr6:27475741 |
GT |
G |
1bp_deletion | frameshift_variant | 28 | A22,A5,B102,B109,B113,B125,B131,B138,B36,B51,B52,B53,B6,B72,B79,B88,C19,C26,C27,C53,C55,C66,C67,C72,C76,C77,C80,D2 |
Chr6:27475747 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | stop_gained | 35 | A22,A5,B1,B10,B107,B11,B130,B27,B28,B57,B63,B70,B77,B80,B93,B95,B98,C10,C11,C13,C18,C2,C27,C31,C4,C40,C43,C45,C50,C51,C58,C75,C78,D6,D9 |
Chr6:27475750 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | stop_gained | 14 | A13,A16,A3,A4,B100,B17,B21,B46,B72,C20,C64,C71,C85,D1 |
Chr6:27475816 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | stop_gained | 7 | A22,B12,B18,B34,B61,B85,C38 |
Chr6:27475828 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | stop_gained | 2 | B57,B75 |
Chr6:27475828 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B57,B75 |
Chr6:27475851 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B104 |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。