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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr06G002086`

染色体: Chr06 坐标: 27519653-27525872 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr06G002086`
名称	SmilChr06G002086
描述	uncharacterized SmilChr06G002086
染色体 / SeqID	Chr06 / NC_080392.1
坐标与链方向	27519653 - 27525872 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130988981`
GeneID	`130988981`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130988981`
原始查询	`SmilChr06G002086`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	CLK4-associating serine/arginine-rich protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:829852]; symbol=AT4G36980; hit=AT4G36980; species=arabidopsis; confidence=high
产物	CLK4-associating serine/arginine-rich protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:829852]; symbol=AT4G36980; hit=AT4G36980; species=arabidopsis; confidence=high
Arabidopsis	`AT4G36980` (AT4G36980) CLK4-associating serine/arginine-rich protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:829852] identity=72.3; qcov=0.858; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os03g0395900` - identity=69.5; qcov=0.862; evalue=0; confidence=high
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF09750 (DRY_EERY)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130988981

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057768953.1`
2	Nuclear speckle	核斑点	1.00000	`XP_057768953.1`
3	Nucleoplasm	核质	1.00000	`XP_057768953.1`
4	Chromatin	染色质	0.20000	`XP_057768953.1`
5	Nuclear body	核内小体	0.20000	`XP_057768953.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr6:27519916`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B23,D3
`Chr6:27519932`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B12
`Chr6:27523342`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B36
`Chr6:27523383`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C77
`Chr6:27523613`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B75
`Chr6:27523772`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B12
`Chr6:27523887`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B27,B57,B75
`Chr6:27523923`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B40
`Chr6:27524625`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B125,C87
`Chr6:27525454`	`G`	`GC`	1bp_insertion	frameshift_variant	4	B40,B76,B9,C38
`Chr6:27525454`	`G`	`GC`	1bp_insertion	CDS_variant	4	B40,B76,B9,C38
`Chr6:27525466`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A15,B40,B76,B9,C38

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057768953.1

556 aa

278

556

DRY_EERY

PF09750 DRY_EERY 41-176 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057768953.1`	Pfam	`PF09750`	DRY_EERY	Domain	41	176	8.5e-41	139.9	Alternative splicing regulator

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057912970.1
TAAGAATAGGTGAGTACGGCCTACACCAATTTTCAAAGTCAAACAAAAACAATTTCTCAGCCCCTTCATCCAAATTAGGGAACACTAGGGTTCATACCAGAATCGATTTTTGATCGGAGTGAATACCTAATCATCATTGTAGCCGGCGACATGTGGCACGAGGCGCGGAGATCGGAGAGGAAGGTCCACGACATGATGGACGCGGCTCGGAAGCGGGCGCAGCGGCGCGCCATATACCTGGCCAAGAGGCGCGGCGACCC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130988981
ATGTGGCACGAGGCGCGGAGATCGGAGAGGAAGGTCCACGACATGATGGACGCGGCTCGGAAGCGGGCGCAGCGGCGCGCCATATACCTGGCCAAGAGGCGCGGCGACCCCCAGCAGTCAATCCAGGCCGTTGGATCCCGCTGCCGCATCCACCGCGACGACGCCCTCTACCAGGCCACCGAGGATCAGCAGGGCCTGATACCTTGGAATGGGAAGCAGGATGTTTTGATTGACAGATTCGATGGTCGTGCTCTTCTTGA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057768953.1
MWHEARRSERKVHDMMDAARKRAQRRAIYLAKRRGDPQQSIQAVGSRCRIHRDDALYQATEDQQGLIPWNGKQDVLIDRFDGRALLDFIRDNTSKRFRVPEKTEEEEELEEFVNFERYRDLIKHRRRGFADEEGLQHVNQEMEAKITAAFGSERPHVAQPPANKGSYSQVGFSYDGDGQEDLQYSDGEEDDDEDDEEEEDFNSDDSNDEAMESIAKEFGVKRYGWLVYMDKKAKEEARRQKEVIKGDPSIRKLSRKERRK...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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