当前解析结果
SmilChr06G002088| 统一新 Gene ID | SmilChr06G002088 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr06G002088 |
| 描述 | uncharacterized SmilChr06G002088 |
| 染色体 / SeqID | Chr06 / NC_080392.1 |
| 坐标与链方向 | 27591351 - 27591989 / + |
| NCBI Gene ID | LOC130990711 |
|---|---|
| GeneID | 130990711 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC130990711 |
| 原始查询 | SmilChr06G002088 |
| 来源 | GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | confidence=no_hit |
| 产物 | confidence=no_hit |
| Arabidopsis | -- |
| Rice | -- |
| GO | - |
| KEGG | - |
| Pfam | - |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:130990711 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Cytoplasm | 细胞质 | 1.00000 | XP_057770923.1 |
| 2 | Nucleus | 细胞核 | 0.40000 | XP_057770923.1 |
| 3 | Cytosol | 细胞质基质 | 0.40000 | XP_057770923.1 |
| 4 | Chromosome | 染色体 | 0.00000 | XP_057770923.1 |
| 5 | Centromere | 着丝粒 | 0.00000 | XP_057770923.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr6:27591360 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | C63 |
Chr6:27591373 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | B27,B57,B75 |
Chr6:27591419 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | B100,B127,B35 |
Chr6:27591421 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B81 |
Chr6:27591427 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B71 |
Chr6:27591428 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | A10,D1 |
Chr6:27591429 |
AC |
A |
1bp_deletion | frameshift_variant | 1 | B1 |
Chr6:27591429 |
AC |
A |
1bp_deletion | CDS_variant | 1 | B1 |
Chr6:27591435 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | stop_gained | 3 | B100,B127,B35 |
Chr6:27591435 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | B100,B127,B35 |
Chr6:27591439 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | stop_gained | 3 | B100,B127,B35 |
Chr6:27591439 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | B100,B127,B35 |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。