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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr06G002097`

染色体: Chr06 坐标: 27906980-27913007 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr06G002097`
名称	SmilChr06G002097
描述	methionine aminopeptidase 1D, chloroplastic/mitochondrial
染色体 / SeqID	Chr06 / NC_080392.1
坐标与链方向	27906980 - 27913007 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130988985`
GeneID	`130988985`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130988985`
原始查询	`SmilChr06G002097`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	methionine aminopeptidase 1D, chloroplastic/mitochondrial
产物	methionine aminopeptidase 1D%2C chloroplastic/mitochondrial
Arabidopsis	`AT4G37040` (MAP1D) methionine aminopeptidase 1D [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:829858] identity=76.2; qcov=1; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os02g0761700` - identity=66.6; qcov=1.04; evalue=2.27e-178; confidence=high
GO	GO:0006508 (proteolysis); GO:0070006 (metalloaminopeptidase activity)
KEGG	-
Pfam	PF00557 (Peptidase_M24)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130988985

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Mitochondrion	线粒体	1.00000	`XP_057768958.1`
2	Chloroplast	叶绿体	0.60000	`XP_057768958.1`
3	Mitochondrion matrix	线粒体基质	0.20000	`XP_057768958.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057768958.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057768958.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr6:27907162`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C46,D4
`Chr6:27907215`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B93
`Chr6:27907257`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A15,B40,B76,B9,C38
`Chr6:27910081`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A4
`Chr6:27910084`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C36,C82
`Chr6:27910115`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B12
`Chr6:27910371`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A21,C36,C82
`Chr6:27911011`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B68,B73,B99,C30,C75
`Chr6:27911078`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B76
`Chr6:27911177`	`C`	`CT`	1bp_insertion	frameshift_variant	4	B133,B53,B64,C6
`Chr6:27911177`	`C`	`CT`	1bp_insertion	CDS_variant	4	B133,B53,B64,C6
`Chr6:27911214`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B47

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057768958.1

353 aa

176

353

Peptidase_M24

PF00557 Peptidase_M24 117-344 aa

XP_057768959.1

352 aa

176

352

Peptidase_M24

PF00557 Peptidase_M24 116-343 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057768958.1`	Pfam	`PF00557`	Peptidase_M24	Domain	117	344	1.9e-52	178.8	Metallopeptidase family M24
`XP_057768959.1`	Pfam	`PF00557`	Peptidase_M24	Domain	116	343	1.9e-52	178.8	Metallopeptidase family M24

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

4 records

下载 cDNA FASTA

XR_009090352.1
GGTTGATACGTTCGTGTGAAGGGTAAAAAGCGGCCATCGCCGCAAAAATATCTTAATACACAGTTTCCTATTATGAGATGTAGCAGCAGCCGGAGCGGATAATAGAAGAGAAGAGAAGAGAAGAGAAGAAAGAAGAAAATGGTGGCGCCCACTTTCATTCAACCTCGCCTAATCTCCACCTTCCTTGGGGACTGCCGCTTTCTTCCCTCCCATTCCGCTCATTCAATCCATCATCTCTTCCGTTTCAATCCAGGAAGAGA...

XR_009090351.1
GGTTGATACGTTCGTGTGAAGGGTAAAAAGCGGCCATCGCCGCAAAAATATCTTAATACACAGTTTCCTATTATGAGATGTAGCAGCAGCCGGAGCGGATAATAGAAGAGAAGAGAAGAGAAGAGAAGAAAGAAGAAAATGGTGGCGCCCACTTTCATTCAACCTCGCCTAATCTCCACCTTCCTTGGGGACTGCCGCTTTCTTCCCTCCCATTCCGCTCATTCAATCCATCATCTCTTCCGTTTCAATCCAGGAAGAGA...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA

LOC130988985
ATGGTGGCGCCCACTTTCATTCAACCTCGCCTAATCTCCACCTTCCTTGGGGACTGCCGCTTTCTTCCCTCCCATTCCGCTCATTCAATCCATCATCTCTTCCGTTTCAATCCAGGAAGAGACCACGTGTCAATGAAAATGTCAAGGAAGTTCTCTGGATTAACCAATTTATTATTTAACAGAAGTACTGAAGAAGTCGCTGATAGCAAGAGGCAACGTTTAAAACCTGGTAAAGTATCTCCCATTCGGCTAGTTCCCAG...

LOC130988985
ATGGTGGCGCCCACTTTCATTCAACCTCGCCTAATCTCCACCTTCCTTGGGGACTGCCGCTTTCTTCCCTCCCATTCCGCTCATTCAATCCATCATCTCTTCCGTTTCAATCCAGGAAGAGACCACGTGTCAATGAAAATGTCAAGGAAGTTCTCTGGATTAACCAATTTATTATTTAACAGAAGAAGTACTGAAGAAGTCGCTGATAGCAAGAGGCAACGTTTAAAACCTGGTAAAGTATCTCCCATTCGGCTAGTTCC...

Protein

2 records

下载 Protein FASTA

XP_057768958.1
MVAPTFIQPRLISTFLGDCRFLPSHSAHSIHHLFRFNPGRDHVSMKMSRKFSGLTNLLFNRRSTEEVADSKRQRLKPGKVSPIRLVPSHIIKPPYVKSRKPPGIASGPEIHDEKGIACMRASGRLAAQVLLHAGTLVKPGITTDEIDQAVHQMIIDNGAYPSPLGYGGFPKSVCTSVNECICHGIPDSRALEDGDIINIDVTVYLNGYHGDTSATFFVGAVNEEAKSLVKVTKECLDKAISICAPGVEFKQIGKTIHDHA...

XP_057768959.1
MVAPTFIQPRLISTFLGDCRFLPSHSAHSIHHLFRFNPGRDHVSMKMSRKFSGLTNLLFNRSTEEVADSKRQRLKPGKVSPIRLVPSHIIKPPYVKSRKPPGIASGPEIHDEKGIACMRASGRLAAQVLLHAGTLVKPGITTDEIDQAVHQMIIDNGAYPSPLGYGGFPKSVCTSVNECICHGIPDSRALEDGDIINIDVTVYLNGYHGDTSATFFVGAVNEEAKSLVKVTKECLDKAISICAPGVEFKQIGKTIHDHAD...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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