当前解析结果
SmilChr06G002112| 统一新 Gene ID | SmilChr06G002112 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr06G002112 |
| 描述 | uncharacterized SmilChr06G002112 |
| 染色体 / SeqID | Chr06 / NC_080392.1 |
| 坐标与链方向 | 28207590 - 28208069 / + |
| NCBI Gene ID | LOC130990719 |
|---|---|
| GeneID | 130990719 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC130990719 |
| 原始查询 | SmilChr06G002112 |
| 来源 | GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | confidence=no_hit |
| 产物 | confidence=no_hit |
| Arabidopsis | -- |
| Rice | -- |
| GO | - |
| KEGG | - |
| Pfam | - |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:130990719 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Nucleus | 细胞核 | 1.00000 | XP_057770930.1 |
| 2 | Cytoplasm | 细胞质 | 0.60000 | XP_057770930.1 |
| 3 | Chromosome | 染色体 | 0.00000 | XP_057770930.1 |
| 4 | Centromere | 着丝粒 | 0.00000 | XP_057770930.1 |
| 5 | Chromatin | 染色质 | 0.00000 | XP_057770930.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr6:28207593 |
TC |
T |
1bp_deletion | frameshift_variant | 36 | A1,A10,A20,A7,B105,B108,B128,B129,B131,B132,B138,B2,B26,B33,B40,B45,B46,B48,B69,B7,B80,B85,B91,C1,C23,C39,C42,C46,C52,C53,C54,C60,C68,C79,C82,D11 |
Chr6:28207595 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 5 | A11,B106,B44,C6,D5 |
Chr6:28207614 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B71,C60 |
Chr6:28207615 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | D7 |
Chr6:28207652 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B25,C80 |
Chr6:28207671 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | stop_gained | 206 | A13,A14,A15,A16,A18,A2,A20,A21,A22,A23,A24,A25,A3,A4,A5,A6,A9,B1,B10,B101,B104,B105,B106,B107,B108,B11,B110,B111,B113,B114,B115,B118,B119,B12,B120,B122,B123,B124,B125,B126,B128,B129,B13,B130,B131,B133,B134,B135,B136,B137,B138,B139,B14,B140,B15,B17,B19,B2,B21,B22,B23,B24,B25,B26,B27,B28,B29,B3,B30,B32,B33,B34,B36,B37,B38,B39,B4,B40,B41,B44,B45,B46,B47,B48,B49,B5,B50,B51,B52,B55,B57,B58,B59,B60,B61,B62,B63,B64,B65,B67,B68,B69,B7,B70,B71,B72,B74,B75,B76,B77,B78,B8,B80,B81,B82,B83,B84,B86,B87,B88,B89,B9,B90,B91,B92,B93,B95,B97,B98,C10,C12,C13,C14,C15,C16,C17,C18,C19,C2,C20,C23,C24,C25,C26,C27,C28,C29,C30,C31,C32,C35,C36,C37,C38,C39,C4,C40,C41,C43,C44,C45,C46,C47,C48,C5,C50,C51,C52,C53,C55,C56,C57,C59,C6,C60,C61,C62,C63,C64,C66,C68,C70,C71,C72,C73,C74,C76,C77,C78,C79,C8,C80,C83,C85,C86,C87,D1,D10,D11,D2,D3,D4,D5,D6,D7,D9 |
Chr6:28207707 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | stop_gained | 34 | A10,A20,B105,B108,B114,B12,B128,B129,B131,B134,B136,B2,B25,B45,B48,B69,B7,B74,B80,B85,B91,C1,C12,C32,C42,C46,C50,C52,C53,C54,C80,C82,D11,D9 |
Chr6:28207755 |
G |
GAC |
2bp_insertion | frameshift_variant | 5 | B137,C23,C31,C45,D6 |
Chr6:28207755 |
G |
GAC |
2bp_insertion | CDS_variant | 5 | B137,C23,C31,C45,D6 |
Chr6:28207759 |
ATG |
A |
2bp_deletion | frameshift_variant | 5 | B137,C23,C31,C45,D6 |
Chr6:28207759 |
ATG |
A |
2bp_deletion | CDS_variant | 5 | B137,C23,C31,C45,D6 |
Chr6:28207833 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | stop_gained | 58 | A1,A10,A13,A14,A20,A21,A7,B102,B112,B115,B118,B123,B125,B128,B138,B14,B2,B21,B27,B31,B47,B48,B52,B59,B67,B68,B69,B72,B76,B79,B83,B85,B90,B91,B92,C1,C11,C17,C2,C30,C46,C52,C56,C58,C60,C65,C69,C72,C78,C79,C81,C83,C84,C87,D1,D11,D5,D9 |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。