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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr06G002118`

染色体: Chr06 坐标: 28328337-28329495 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr06G002118`
名称	SmilChr06G002118
描述	uncharacterized SmilChr06G002118
染色体 / SeqID	Chr06 / NC_080392.1
坐标与链方向	28328337 - 28329495 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130990722`
GeneID	`130990722`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130990722`
原始查询	`SmilChr06G002118`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os06g0523701; species=rice; confidence=weak
产物	hit=Os06g0523701; species=rice; confidence=weak
Arabidopsis	`-` -
Rice	`Os06g0523701` - identity=43.8; qcov=0.241; evalue=1.14e-16; confidence=weak
GO	GO:0003676 (nucleic acid binding)
KEGG	-
Pfam	-
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130990722

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057770934.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.40000	`XP_057770934.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057770934.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057770934.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057770934.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr6:28328342`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B135,B18,C58,C70
`Chr6:28328355`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B82,D7
`Chr6:28328428`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A14,B110,B120,C13,D1
`Chr6:28328439`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A10,C83
`Chr6:28328475`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B44
`Chr6:28328486`	`GA`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	7	B13,B65,B95,C1,C14,C48,C59
`Chr6:28328492`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B114
`Chr6:28328497`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C5
`Chr6:28328559`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A22,C11,C31,C34,C63
`Chr6:28328600`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	146	A1,A11,A13,A14,A16,A18,A2,A22,A23,A4,A6,A7,A8,A9,B1,B100,B102,B103,B105,B108,B109,B110,B111,B115,B117,B119,B12,B121,B122,B123,B126,B127,B128,B129,B130,B131,B132,B133,B136,B137,B139,B14,B140,B17,B18,B20,B23,B25,B29,B3,B31,B35,B36,B4,B49,B5,B50,B51,B52,B53,B54,B56,B59,B6,B64,B66,B68,B71,B72,B73,B76,B79,B80,B81,B83,B84,B85,B86,B87,B88,B89,B9,B90,B92,B94,B95,B96,B97,B99,C1,C11,C12,C13,C14,C16,C18,C21,C22,C23,C25,C26,C28,C29,C30,C31,C33,C34,C37,C39,C4,C40,C41,C42,C43,C44,C47,C51,C52,C54,C59,C6,C60,C61,C62,C65,C66,C67,C69,C7,C70,C73,C75,C76,C78,C79,C81,C83,C84,C85,C86,C9,D2,D5,D7,D8,D9
`Chr6:28328601`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B112,B49,C57,C75,D3
`Chr6:28328609`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B69,B9,C5

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

当前发布数据中，此基因没有可展示的 Pfam 结构域命中。

进入结构域查询

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057914951.1
ATGTACAACACTATCCATATCGATGAAAAGTGGTTCTACATCACCAAGGCTTCTCACAGATTCTATTTAACTCCAGCAGAGGCTGAGCCACATAGAAGTTGCAAGAGTAAAAAGTTCATAAAAAAGGTGATGTTCGTGTGTGCGGTGTGTCGACCAATATTTGGTGATGATGGGAGTGTTCTTTTTTACGGGAAGATAGGAATCTTCCCTTTAACAGAAATGGTACCAGCAAAGAGGTCAAGCAAGAATAGAGCAGCAGG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130990722
ATGTACAACACTATCCATATCGATGAAAAGTGGTTCTACATCACCAAGGCTTCTCACAGATTCTATTTAACTCCAGCAGAGGCTGAGCCACATAGAAGTTGCAAGAGTAAAAAGTTCATAAAAAAGGTGATGTTCGTGTGTGCGGTGTGTCGACCAATATTTGGTGATGATGGGAGTGTTCTTTTTTACGGGAAGATAGGAATCTTCCCTTTAACAGAAATGGTACCAGCAAAGAGGTCAAGCAAGAATAGAGCAGCAGG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057770934.1
MYNTIHIDEKWFYITKASHRFYLTPAEAEPHRSCKSKKFIKKVMFVCAVCRPIFGDDGSVLFYGKIGIFPLTEMVPAKRSSKNRAAGTLEQKPIKSITQQVMRECFIKQLVPAIKAKWPSFASKIIFIQQDNARPHIKNEDIEFRDCATADGFDINIIHQPPNSPDNNINDLGWFRAIQSLQTESVCFDVDSLVNAVVSSFNELAPMTLNKVFLSLQGCMIEIMKVKGQNCYKLPHMKKDALLRQQLLPQCLEVPTDLVK...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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