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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr06G002132`

染色体: Chr06 坐标: 28701691-28704281 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr06G002132`
名称	SmilChr06G002132
描述	uncharacterized SmilChr06G002132
染色体 / SeqID	Chr06 / NC_080392.1
坐标与链方向	28701691 - 28704281 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130989014`
GeneID	`130989014`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130989014`
原始查询	`SmilChr06G002132`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	P0492G09.27-1; symbol=P0492G09.27-1; hit=Os01g0935700; species=rice; confidence=weak
产物	P0492G09.27-1; symbol=P0492G09.27-1; hit=Os01g0935700; species=rice; confidence=weak
Arabidopsis	`AT3G27240` (AT3G27240) Cytochrome C1 family [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:822343] identity=86.7; qcov=0.221; evalue=2e-11; confidence=weak
Rice	`Os01g0935700` (P0492G09.27-1) - identity=86.7; qcov=0.221; evalue=2.36e-12; confidence=weak
GO	GO:0009055 (electron transfer activity); GO:0020037 (heme binding)
KEGG	-
Pfam	PF02167 (Cytochrom_C1)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130989014

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	0.60000	`XP_057768994.1`
2	Cytosol	细胞质基质	0.40000	`XP_057768994.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057768994.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057768994.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057768994.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr6:28702483`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B35
`Chr6:28702508`	`G`	`GCC`	2bp_insertion	frameshift_variant	4	A20,C24,C78,C85
`Chr6:28702508`	`G`	`GCC`	2bp_insertion	CDS_variant	4	A20,C24,C78,C85
`Chr6:28702548`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B121,B54
`Chr6:28702855`	`GA`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	44	A10,A24,A25,A3,B1,B108,B111,B119,B120,B125,B137,B17,B24,B30,B40,B51,B55,B6,B64,B65,B66,B71,B73,B99,C16,C21,C23,C29,C30,C36,C40,C43,C48,C53,C54,C55,C61,C62,C67,C73,C81,D4,D7,D8
`Chr6:28702906`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	2	B120,D8
`Chr6:28702906`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B120,D8
`Chr6:28703235`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	13	A9,B126,B129,B136,B138,B30,B47,B60,B84,C52,C65,C77,D1
`Chr6:28703243`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr6:28703256`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B25,C41,C81
`Chr6:28703269`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B76
`Chr6:28703311`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B128,C62,D10

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057768994.1

136 aa

136

Cytochrom_C1

PF02167 Cytochrom_C1 50-82 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057768994.1`	Pfam	`PF02167`	Cytochrom_C1	Family	50	82	4e-08	33.9	Cytochrome C1 family

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XR_009090400.1
CTCTCCTCTCTCTCTTCACCTTCACGTCACTCGTTTCTTCACTGGATCGCCGCCTTCTTGTCGCCTCGAATCGCCACCGTCACCGTCTGCATCAGCAGCAAGCGCCATCGCAATCTCTGCTCCATCCAACGGAGACGACTATCCTCCTTAGCATGAGCCTCTGTATTTGATCTTGATGGAAGCTTGCTACTTGTTTCCCCAAGTATACTTCATCAGTTGCCAAAAGAAATTTGGAAAATTTCTCAGGCTGCTCCGTTGCT...

XM_057913011.1
CTCTCCTCTCTCTCTTCACCTTCACGTCACTCGTTTCTTCACTGGATCGCCGCCTTCTTGTCGCCTCGAATCGCCACCGTCACCGTCTGCATCAGCAGCAAGCGCCATCGCAATCTCTGCTCCATCCAACGGAGACGACTATCCTCCTTAGCATGAGCTTGCTACTTGTTTCCCCAAGTATACTTCATCAGTTGCCAAAAGAAATTTGGAAAATTTCTCAGGCTGCTCCGTTGCTTTTTTCCAAGCATGGTCAAGCTGAA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130989014
ATGAGCTTGCTACTTGTTTCCCCAAGTATACTTCATCAGTTGCCAAAAGAAATTTGGAAAATTTCTCAGGCTGCTCCGTTGCTTTTTTCCAAGCATGGTCAAGCTGAATCGGGATCTACTAGTACAAAGTTTTTCAAGATATTTGCACTTTTTGGTGATCGTCTTCCTCAGCCTTATGCAAACAACCAAGCTGCAAGATTTGCAAATGGAGGGGCCTATCCTCCTAATTTAAGTCTTATCACAAAGATTATCCGAGACCA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057768994.1
MSLLLVSPSILHQLPKEIWKISQAAPLLFSKHGQAESGSTSTKFFKIFALFGDRLPQPYANNQAARFANGGAYPPNLSLITKIIRDHLTRLPASMKNVERFHNGAGLRSSVGVDGKGRSARGCIGGEMPVEQHTSK

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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