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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr06G002139`

染色体: Chr06 坐标: 29008274-29012212 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr06G002139`
名称	SmilChr06G002139
描述	vegetative incompatibility protein HET-E-1-like
染色体 / SeqID	Chr06 / NC_080392.1
坐标与链方向	29008274 - 29012212 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130989016`
GeneID	`130989016`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130989016`
原始查询	`SmilChr06G002139`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	vegetative incompatibility protein HET-E-1-like
产物	vegetative incompatibility protein HET-E-1-like
Arabidopsis	`AT5G53500` (AT5G53500) Transducin/WD40 repeat-like superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:835432] identity=36.2; qcov=1.06; evalue=4.4e-125; confidence=medium
Rice	`Os04g0568400` (OsWD40-106) - identity=41; qcov=0.815; evalue=2.04e-125; confidence=medium
GO	GO:0005515 (protein binding)
KEGG	-
Pfam	PF00400 (WD40)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130989016

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	0.80000	`XP_057768995.1`
2	Cytosol	细胞质基质	0.60000	`XP_057768995.1`
3	Nucleus	细胞核	0.20000	`XP_057768995.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057768995.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057768995.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr6:29009398`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B134
`Chr6:29009432`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B12,B137,B55,C2
`Chr6:29010048`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A10,C43,D1
`Chr6:29010416`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B71
`Chr6:29011712`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B120,B29,B91,C35

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057768995.1

643 aa

322

643

WD40

PF00400 WD40 202-234 aa PF00400 WD40 285-319 aa PF00400 WD40 325-361 aa PF00400 WD40 378-402 aa PF00400 WD40 471-496 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057768995.1`	Pfam	`PF00400`	WD40	Repeat	202	234	2.2e-38	129.7	WD domain, G-beta repeat
`XP_057768995.1`	Pfam	`PF00400`	WD40	Repeat	285	319	2.2e-38	129.7	WD domain, G-beta repeat
`XP_057768995.1`	Pfam	`PF00400`	WD40	Repeat	325	361	2.2e-38	129.7	WD domain, G-beta repeat
`XP_057768995.1`	Pfam	`PF00400`	WD40	Repeat	378	402	2.2e-38	129.7	WD domain, G-beta repeat
`XP_057768995.1`	Pfam	`PF00400`	WD40	Repeat	471	496	2.2e-38	129.7	WD domain, G-beta repeat

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057913012.1
ATCTTTTTTTAATTTCTGATTTCCCCCAATTTAATTACACAGTAAAATTTTGACATTTCCTTTCCTTTTAATTTTTTGGGTAGAATTCCAAACTCCAGTTGAATTTCAACTTTTAACAGCTTGTCGCTAAAGTGGAGAAAGCTTTGGACTTTGTGTGGAAATTGACTTTGGAGAGAGAGAGAGTACTATCTCATTCTCATATAGCATAGCATAGCATAGCATAGCATATTGGCAGAGGAAACAATACATATATATAGCAG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130989016
ATGTTGAGCTTTGGTGAGGAAGAAGAGGCTTTCTTTGATACAACTGATGAATTGGTGTTTGATGAGTCTGTTGTTGTGAGAGAGGATTCAGATTATGATATTTGGTTGAGGGAGCCCTCTAGTGTTGGGGAAAGAAGGAAGGATTTCTTGTGCAGAACGGGGTTTTTGGAGTGCTCGATTCGTGGTGAAACGGTTGAGATTGAGAGAGCTGATGAGGTGAGTACCGGCATGGATGATGATAGTTTGCTGTCTGAGAGAAG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057768995.1
MLSFGEEEEAFFDTTDELVFDESVVVREDSDYDIWLREPSSVGERRKDFLCRTGFLECSIRGETVEIERADEVSTGMDDDSLLSERRKSNSEANCSVDYSAEGWLDLDAMRLLDVEEVMNVNEKLASIEQCEMDREGLTISKKKKKVMSWWRSFSRRMKRDDANVGSKKSELVAEAGKMARMRVEQSRKRCVECSAVYAGQVVQAHDGLIWTMRFSPDGQYLASGGADGVVCIWRLTMVDASSEAEECCYGGGHDMEGKP...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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