当前解析结果
SmilChr06G002143| 统一新 Gene ID | SmilChr06G002143 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr06G002143 |
| 描述 | uncharacterized SmilChr06G002143 |
| 染色体 / SeqID | Chr06 / NC_080392.1 |
| 坐标与链方向 | 29116242 - 29117342 / - |
| NCBI Gene ID | LOC130990728 |
|---|---|
| GeneID | 130990728 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC130990728 |
| 原始查询 | SmilChr06G002143 |
| 来源 | GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | confidence=no_hit |
| 产物 | confidence=no_hit |
| Arabidopsis | -- |
| Rice | -- |
| GO | - |
| KEGG | - |
| Pfam | - |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:130990728 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Nucleus | 细胞核 | 1.00000 | XP_057770940.1 |
| 2 | Cytoplasm | 细胞质 | 0.40000 | XP_057770940.1 |
| 3 | Chromosome | 染色体 | 0.00000 | XP_057770940.1 |
| 4 | Centromere | 着丝粒 | 0.00000 | XP_057770940.1 |
| 5 | Chromatin | 染色质 | 0.00000 | XP_057770940.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr6:29116270 |
TC |
T |
1bp_deletion | frameshift_variant | 3 | B10,B82,C76 |
Chr6:29116270 |
TC |
T |
1bp_deletion | CDS_variant | 3 | B10,B82,C76 |
Chr6:29116272 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | A10 |
Chr6:29116275 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 5 | B12,B29,B4,B60,B98 |
Chr6:29116292 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | stop_gained | 5 | A16,B13,B136,B139,B87 |
Chr6:29116292 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 5 | A16,B13,B136,B139,B87 |
Chr6:29116296 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | B117,B38,B39,B7 |
Chr6:29116307 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | B117,B38,B39,B7 |
Chr6:29116313 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | B125,B138,B52,B90 |
Chr6:29116322 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 5 | B117,B38,B39,B7,B75 |
Chr6:29116332 |
GA |
G |
1bp_deletion | frameshift_variant | 47 | A14,A21,A22,A25,A8,B111,B124,B13,B132,B136,B137,B140,B18,B21,B34,B35,B47,B50,B53,B55,B56,B68,B71,B72,B86,B94,B96,B98,C11,C30,C4,C41,C44,C48,C53,C6,C65,C69,C71,C76,C78,C85,C86,D1,D10,D4,D5 |
Chr6:29116379 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | A19,B121,B13,B42 |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。