当前解析结果
SmilChr06G002151| 统一新 Gene ID | SmilChr06G002151 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr06G002151 |
| 描述 | uncharacterized SmilChr06G002151 |
| 染色体 / SeqID | Chr06 / NC_080392.1 |
| 坐标与链方向 | 29228044 - 29229294 / + |
| NCBI Gene ID | LOC130990734 |
|---|---|
| GeneID | 130990734 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC130990734 |
| 原始查询 | SmilChr06G002151 |
| 来源 | GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | hit=Os12g0292200; species=rice; confidence=weak |
| 产物 | hit=Os12g0292200; species=rice; confidence=weak |
| Arabidopsis | AT2G06105 (AT2G06105)aspartyl protease gag-polyprotein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:28717693] identity=37.7; qcov=0.166; evalue=1.08e-06; confidence=weak |
| Rice | Os12g0292200- identity=30.9; qcov=0.226; evalue=1.02e-06; confidence=weak |
| GO | - |
| KEGG | - |
| Pfam | - |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:130990734 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Cytoplasm | 细胞质 | 1.00000 | XP_057770945.1 |
| 2 | Cytosol | 细胞质基质 | 0.80000 | XP_057770945.1 |
| 3 | Nucleus | 细胞核 | 0.40000 | XP_057770945.1 |
| 4 | Chromosome | 染色体 | 0.00000 | XP_057770945.1 |
| 5 | Centromere | 着丝粒 | 0.00000 | XP_057770945.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr6:29228062 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | B100,C81,C83,C9 |
Chr6:29228079 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B78 |
Chr6:29228086 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | A2,B80 |
Chr6:29228099 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | B66,C49,C54 |
Chr6:29228116 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | B35,C17,C59,C6 |
Chr6:29228123 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B69 |
Chr6:29228128 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | A15,B121,C4 |
Chr6:29228133 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | C28 |
Chr6:29228136 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | C28 |
Chr6:29228153 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | C20,C82 |
Chr6:29228157 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | B109,C20,C44 |
Chr6:29228169 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | C20 |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。