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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr06G002154`

染色体: Chr06 坐标: 29357222-29360226 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr06G002154`
名称	SmilChr06G002154
描述	homeobox-leucine zipper protein ATHB-40-like
染色体 / SeqID	Chr06 / NC_080392.1
坐标与链方向	29357222 - 29360226 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130989025`
GeneID	`130989025`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130989025`
原始查询	`SmilChr06G002154`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	homeobox-leucine zipper protein ATHB-40-like
产物	homeobox-leucine zipper protein ATHB-40-like
Arabidopsis	`AT2G18550` (HB21) homeobox protein 21 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:816370] identity=49.3; qcov=1.07; evalue=9.6e-64; confidence=high
Rice	`Os07g0581700` (Oshox14) - identity=61.1; qcov=0.522; evalue=6.88e-37; confidence=medium
GO	GO:0000981 (DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific); GO:0005634 (nucleus); GO:0043565 (sequence-specific DNA binding); GO:0045893 (positive regulation of DNA-templated transcription)
KEGG	-
Pfam	PF00046 (Homeodomain)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130989025

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057769003.1`
2	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057769003.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057769003.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057769003.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057769003.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr6:29357968`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C13
`Chr6:29359962`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B25
`Chr6:29359981`	`AGT`	`A`	2bp_deletion	frameshift_variant	10	B125,B38,B39,B48,B7,B95,B97,C28,C39,C72
`Chr6:29359984`	`AGG`	`A`	2bp_deletion	frameshift_variant	10	B125,B38,B39,B48,B7,B95,B97,C28,C39,C72

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057769003.1

207 aa

104

207

Homeodomain

PF00046 Homeodomain 56-107 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057769003.1`	Pfam	`PF00046`	Homeodomain	Domain	56	107	4.4e-18	65.5	Homeodomain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057913020.1
CAAAGTCCTCCGAAGATAGCACCAACTTCTTTTCCTCCCTTCCCCTATACTCAAATTTGCAACTCAAAAAGTCCTACATATCTTAGAGAGAGAGAGGATGAACCCTGAAGCTCTAGTTGATGAACAGATGCCACTCATTTCTCAGTATTATCCTGATCCTGATGGGATATACACCCAGTTTGTACCTCAACCTGGGGCGGCGAAGACGAAGGCGAGGCGGCGGCGCAGGAAGAGTAAAGGGATTGAGGGAGTGATGCGGA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130989025
ATGAACCCTGAAGCTCTAGTTGATGAACAGATGCCACTCATTTCTCAGTATTATCCTGATCCTGATGGGATATACACCCAGTTTGTACCTCAACCTGGGGCGGCGAAGACGAAGGCGAGGCGGCGGCGCAGGAAGAGTAAAGGGATTGAGGGAGTGATGCGGAAGAGGAAGCTGAGCTCGGAGCAGGTGAAGATGCTGGAGGAGTGTTTCGGGAGCGAGCAGAAACTGGAGTCGGACAGGAAGGAGAGGCTGGCGGCGGA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057769003.1
MNPEALVDEQMPLISQYYPDPDGIYTQFVPQPGAAKTKARRRRRKSKGIEGVMRKRKLSSEQVKMLEECFGSEQKLESDRKERLAAELGLDPRQVAVWFQNRRARWKSNKLHEEYSKLKSDHHTAVLHKCRLETELLKLKEQLHEAEKEIQRLSDGFSSNSPCSSFSMEVGAPFLGEFGMEGLENVFYTSDQNYSAHGMEWDNLYYM

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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