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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr06G002180`

染色体: Chr06 坐标: 30042023-30043574 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr06G002180`
名称	SmilChr06G002180
描述	uncharacterized SmilChr06G002180
染色体 / SeqID	Chr06 / NC_080392.1
坐标与链方向	30042023 - 30043574 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130989037`
GeneID	`130989037`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130989037`
原始查询	`SmilChr06G002180`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os12g0544600; species=rice; confidence=low
产物	hit=Os12g0544600; species=rice; confidence=low
Arabidopsis	`-` -
Rice	`Os12g0544600` - identity=33.7; qcov=1.07; evalue=3.73e-53; confidence=low
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF13952 (DUF4216); PF13960 (DUF4218)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130989037

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057769009.1`
2	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057769009.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057769009.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057769009.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057769009.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr6:30042130`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C14
`Chr6:30042133`	`TCC`	`T`	2bp_deletion	frameshift_variant	9	B117,B14,B91,C27,C31,C65,C70,C71,C80
`Chr6:30042146`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B106,B12,B52,C43
`Chr6:30042147`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A13,B104,C72
`Chr6:30042183`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B24,B52
`Chr6:30042284`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B36
`Chr6:30042296`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B104,C72
`Chr6:30042335`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B125,B42,B99,C87
`Chr6:30042446`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B22,B41,C46
`Chr6:30042450`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B13,B74,C12
`Chr6:30042488`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B21,B69,B87,C38,D9
`Chr6:30042609`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	3	B128,B44,D8

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057769009.1

433 aa

216

433

DUF4218

DUF4216

PF13960 DUF4218 31-136 aa PF13952 DUF4216 306-374 aa

XP_057769010.1

345 aa

172

345

DUF4218

DUF4216

PF13960 DUF4218 1-48 aa PF13952 DUF4216 218-286 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057769009.1`	Pfam	`PF13960`	DUF4218	Domain	31	136	7.4e-46	155.4	Domain of unknown function (DUF4218)
`XP_057769009.1`	Pfam	`PF13952`	DUF4216	Domain	306	374	6.2e-19	69.0	Domain of unknown function (DUF4216)
`XP_057769010.1`	Pfam	`PF13960`	DUF4218	Domain	1	48	9.6e-17	61.6	Domain of unknown function (DUF4218)
`XP_057769010.1`	Pfam	`PF13952`	DUF4216	Domain	218	286	3.8e-19	69.7	Domain of unknown function (DUF4216)

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XM_057913026.1
AAAGTCCCAACAGGTTATTCATCAAATGTGGCGAGTCTTTTGTCCGCTGACGATTCGAAGCTTGTTGGCCTTAAATCACATGATTGTCATACTTTAATGCAACAATTGCTTCCAGTGGCCATACGTGGTGTGTTGTCGAAACAAGTGCGGTATGACATTACTAGATTGTGTTTCTTTTTCAATGTCTTATGCAACAAAGTTGTTGACGTTTCAAAGTTGGAAGACATTCAAAAAGACATCACAATTACATTGTGCCTACT...

XM_057913027.1
AAAGTCCCAACAGGTTATTCATCAAATGTGGCGAGTCTTTTGTCCGCTGACGATTCGAAGCTTGTTGGCCTTAAATCACATGATTGTCATACTTTAATGCAACAATTGCTTCCAGTGGCCATACGTGGTGTGTTGTCGAAACAAGTGCGTGAAACTATGTGGACCAGTGTGGTATAGGTGGATGTATCCATTTGAGAGGTTCATGCGTGTGTTGAAAGGTTATGTGAGAAATCGCAATTGCCCTGAAGGATGTATCGCCG...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA

LOC130989037
ATGCAACAATTGCTTCCAGTGGCCATACGTGGTGTGTTGTCGAAACAAGTGCGGTATGACATTACTAGATTGTGTTTCTTTTTCAATGTCTTATGCAACAAAGTTGTTGACGTTTCAAAGTTGGAAGACATTCAAAAAGACATCACAATTACATTGTGCCTACTTGAAAAACATTTTCCTCCTTCATTCTTTGACATAATGGTCCATTTAACTATTCATCTTGTCCGTGAAGTGAAACTATGTGGACCAGTGTGGTATAG...

LOC130989037
ATGTATCCATTTGAGAGGTTCATGCGTGTGTTGAAAGGTTATGTGAGAAATCGCAATTGCCCTGAAGGATGTATCGCCGAATGCTACATAGCTGAAGAAGCTTTAGAGTTTTGCTCAGAGTACTTACATAATGTACACACAGTAGGACTGCCTTCTACTCATCGCCAAGTAAATCTAACAAAGCCTCTTTCAGCTCCTCAGATGAAATCAGTTGATCAGAATGAATGGGAACAAGCACATCGGTATATGCTCACAAATGA...

Protein

2 records

下载 Protein FASTA

XP_057769009.1
MQQLLPVAIRGVLSKQVRYDITRLCFFFNVLCNKVVDVSKLEDIQKDITITLCLLEKHFPPSFFDIMVHLTIHLVREVKLCGPVWYRWMYPFERFMRVLKGYVRNRNCPEGCIAECYIAEEALEFCSEYLHNVHTVGLPSTHRQVNLTKPLSAPQMKSVDQNEWEQAHRYMLTNDDVVAPLIEEYFGELKIMYPRKVKNEKWLQDEHNRTFIPWLRKRVANAITHTTQQVSERLKWLARGPNVRVLTYDAYMINGVTFHT...

XP_057769010.1
MYPFERFMRVLKGYVRNRNCPEGCIAECYIAEEALEFCSEYLHNVHTVGLPSTHRQVNLTKPLSAPQMKSVDQNEWEQAHRYMLTNDDVVAPLIEEYFGELKIMYPRKVKNEKWLQDEHNRTFIPWLRKRVANAITHTTQQVSERLKWLARGPNVRVLTYDAYMINGVTFHTKTRDNIRAVQNSGVSLVAKTMQVASAKDSNPIVSDMTFYGVIDEIWELDYNIFREVMFKCSWVENNNGIRVDDFGFTLVNLNRIGFKS...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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