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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr06G002194`

染色体: Chr06 坐标: 30416605-30418907 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr06G002194`
名称	SmilChr06G002194
描述	E3 ubiquitin-protein ligase UPL1-like
染色体 / SeqID	Chr06 / NC_080392.1
坐标与链方向	30416605 - 30418907 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130989045`
GeneID	`130989045`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130989045`
原始查询	`SmilChr06G002194`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	E3 ubiquitin-protein ligase UPL1-like
产物	E3 ubiquitin-protein ligase UPL1-like
Arabidopsis	`AT1G70320` (UPL2) ubiquitin-protein ligase 2 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:843368] identity=73.9; qcov=1.12; evalue=1.51e-66; confidence=high
Rice	`Os09g0252800` - identity=72.5; qcov=1.12; evalue=8.16e-69; confidence=high
GO	GO:0000209 (protein polyubiquitination); GO:0004842 (ubiquitin-protein transferase activity); GO:0043161 (proteasome-mediated ubiquitin-dependent protein catabolic process); GO:0045732 (positive regulation of protein catabolic process)
KEGG	-
Pfam	PF00632 (HECT)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130989045

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	0.80000	`XP_057769023.1`
2	Cytosol	细胞质基质	0.20000	`XP_057769023.1`
3	Secreted	分泌到胞外	0.20000	`XP_057769023.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057769023.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057769023.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr6:30417693`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B134
`Chr6:30417861`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B107
`Chr6:30418017`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B118,B41,C22,C51,C9
`Chr6:30418034`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr6:30418037`	`G`	`GT`	1bp_insertion	frameshift_variant	1	B104
`Chr6:30418037`	`G`	`GT`	1bp_insertion	CDS_variant	1	B104
`Chr6:30418122`	`GC`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	5	B1,B28,B4,C19,C34
`Chr6:30418122`	`GC`	`G`	1bp_deletion	CDS_variant	5	B1,B28,B4,C19,C34
`Chr6:30418175`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B131,B132,C2
`Chr6:30418182`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C37
`Chr6:30418198`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B127,B24,B53,D6
`Chr6:30418234`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B26,C13

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057769023.1

137 aa

137

HECT

PF00632 HECT 11-111 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057769023.1`	Pfam	`PF00632`	HECT	Domain	11	111	1.2e-25	91.6	HECT-domain (ubiquitin-transferase)

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057913040.1
GCATCCACACTTCCCGTAAACAAAAAAAAACTAAGTTCTTCTACCCCTCTCAAAAAACTAAGTTCTCCACGTCTAGTTTAACAACCGCTCCTCCCCGCTGTCGCCGCCCACCTCCCCACCGGCCGCCGTCGCCGCCACCTTCTCCAGCCCGCGGATGACTGCTCGACGATAAATCGACGCTTCCTGCAGCGAATTTTGCTTCTGCATCACCTTCACCAATCGGACGGCTTCAGAATTTCTGTTATGGAGGTGCTCGAGAA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130989045
ATGCTGGAGAATGTTGTTAGTGACATACCTGATCTGACCTTTAGCATGGATGCGGATGAAGTAAAGCATATTCTTTATGAGAAAACAGAGGTTACTGATTATGAGCTCAAACCGGGAGGAAGAAATATTAGAGTGACAGAGGAGACGAAACATGAATATGTAGACCTTGCTGCTGATCATATCTTGACAAATGCCATCCGCCCCCAAATAAATTCGTTCCTTGATGGTTTCAATGAATTAGTGCCACGGGAGCTTATGTC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057769023.1
MLENVVSDIPDLTFSMDADEVKHILYEKTEVTDYELKPGGRNIRVTEETKHEYVDLAADHILTNAIRPQINSFLDGFNELVPRELMSIFNDKEVELLISGLLEIDLDDLKFNKEDMARLLQFVTGTSKVIHLKLELF

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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