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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr06G002213`

染色体: Chr06 坐标: 30916984-30921597 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr06G002213`
名称	SmilChr06G002213
描述	uncharacterized SmilChr06G002213
染色体 / SeqID	Chr06 / NC_080392.1
坐标与链方向	30916984 - 30921597 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130990756`
GeneID	`130990756`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130990756`
原始查询	`SmilChr06G002213`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	confidence=no_hit
产物	confidence=no_hit
Arabidopsis	`-` -
Rice	`-` -
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF14223 (Retrotran_gag_2)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130990756

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057770967.1`
2	Nucleus	细胞核	0.60000	`XP_057770967.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057770967.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057770967.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057770967.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr6:30916984`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A2,A25,B101,B52,C14
`Chr6:30916995`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A2,B52,C14
`Chr6:30917054`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B101,B47,B78,C15,C60
`Chr6:30917073`	`TG`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	2	B26,C63
`Chr6:30917073`	`TG`	`T`	1bp_deletion	CDS_variant	2	B26,C63
`Chr6:30917102`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C35
`Chr6:30917162`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B8,C18
`Chr6:30917401`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B14,B26,B44
`Chr6:30917465`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B15,B44
`Chr6:30917482`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B101,C37,D7
`Chr6:30917488`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A20,C23,C30,C84,C85
`Chr6:30917516`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B15,B37,C27,C62,D9

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057770967.1

390 aa

195

390

Retrotran_gag_2

PF14223 Retrotran_gag_2 25-116 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057770967.1`	Pfam	`PF14223`	Retrotran_gag_2	Domain	25	116	1.5e-10	41.8	gag-polypeptide of LTR copia-type

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057914984.1
ATGGAAGAAGTTGTCAAGCGGGTGCCATTGGATACTTCAAGAGATCCATTTGATGAAGTACAGATCAAGTCAAAGGTCGACTTCACCACAGAAGAGAGAAAACAAGAAGAGCTCGACAATCTTGCCAAAAGCATCATCTCCAGAACAGTCCCAGACAAGCACGTCACCAAAATCATTAAGTGCAAGACTGTAAAGGAGATGTGGGACACTCTAGAAGGAATGTGCATTGGATCAGAGGAGATAAATGAGAATAAGCTATC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130990756
ATGGAAGAAGTTGTCAAGCGGGTGCCATTGGATACTTCAAGAGATCCATTTGATGAAGTACAGATCAAGTCAAAGGTCGACTTCACCACAGAAGAGAGAAAACAAGAAGAGCTCGACAATCTTGCCAAAAGCATCATCTCCAGAACAGTCCCAGACAAGCACGTCACCAAAATCATTAAGTGCAAGACTGTAAAGGAGATGTGGGACACTCTAGAAGGAATGTGCATTGGATCAGAGGAGATAAATGAGAATAAGCTATC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057770967.1
MEEVVKRVPLDTSRDPFDEVQIKSKVDFTTEERKQEELDNLAKSIISRTVPDKHVTKIIKCKTVKEMWDTLEGMCIGSEEINENKLSIACQKFDSFLMLKNESIDEMELRFNHILNENKPGFNQRPTNKLFSDLVANEFDIQRNLETKKVGGLDDDAPSVSKRAALKVSAKESKKQSNEPTKLKPETSSEKRESKCRYSADRSGQRKASTTDLKDVECYGCKKKGNYKSESPELSQAERKEMKARRDRNYAKKKVRVAKD...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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