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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr06G002216`

染色体: Chr06 坐标: 30999515-31010580 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr06G002216`
名称	SmilChr06G002216
描述	patatin-like protein 3
染色体 / SeqID	Chr06 / NC_080392.1
坐标与链方向	30999515 - 31010580 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130989071`
GeneID	`130989071`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130989071`
原始查询	`SmilChr06G002216`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	patatin-like protein 3
产物	patatin-like protein 3
Arabidopsis	`AT4G37070` (PLP1) Acyl transferase/acyl hydrolase/lysophospholipase superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:829861] identity=50.3; qcov=0.939; evalue=3.41e-136; confidence=high
Rice	`Os08g0477100` (OspPLAIIepsilon) - identity=53.6; qcov=0.961; evalue=2.58e-148; confidence=high
GO	GO:0004620 (glycerophospholipase activity); GO:0006629 (lipid metabolic process); GO:0047372 (monoacylglycerol lipase activity)
KEGG	-
Pfam	PF01734 (Patatin)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130989071

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Vacuole	液泡	0.60000	`XP_057769028.1`
2	Cell wall	细胞壁	0.20000	`XP_057769028.1`
3	Cell membrane	细胞膜	0.20000	`XP_057769028.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057769028.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057769028.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr6:30999875`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B80
`Chr6:31005992`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B23,D3
`Chr6:31007794`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	3	B118,B67,C63
`Chr6:31007794`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B118,B67,C63
`Chr6:31007847`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B32,C17,C48
`Chr6:31007904`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B107
`Chr6:31008621`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A3,B66,B98
`Chr6:31008648`	`GA`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	C42
`Chr6:31008648`	`GA`	`G`	1bp_deletion	CDS_variant	1	C42
`Chr6:31008714`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr6:31008795`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B37
`Chr6:31008798`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C24

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057769028.1

413 aa

206

413

Patatin

PF01734 Patatin 36-243 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057769028.1`	Pfam	`PF01734`	Patatin	Domain	36	243	9.9e-30	104.9	Patatin-like phospholipase

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057913045.1
CACAATTATTATCACAAAAATTTACCCTCATGCAGCCAAGGACGAAATGGAGAGGATCAATTTTCTAGTTGCATTAACTTTTCTTGCAACTCTGCAATTCCTACTATTTCCCATCTCTAATGCTCAAACAAAAGGAAGAATGGCGACGGTGCTAAGCATCGACGGAGGCGGCGTTAGAGGCATCATTCCAGGCACAATTCTGGGCAACCTCGAAGCCAAACTCCAGGAATTAGATGGCCCGGATGCAAGAATTGCAGATT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130989071
ATGGAGAGGATCAATTTTCTAGTTGCATTAACTTTTCTTGCAACTCTGCAATTCCTACTATTTCCCATCTCTAATGCTCAAACAAAAGGAAGAATGGCGACGGTGCTAAGCATCGACGGAGGCGGCGTTAGAGGCATCATTCCAGGCACAATTCTGGGCAACCTCGAAGCCAAACTCCAGGAATTAGATGGCCCGGATGCAAGAATTGCAGATTATTTCGATGTGATTGCCGGAACGAGCACCGGCGGGTTGGTCGCCAC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057769028.1
MERINFLVALTFLATLQFLLFPISNAQTKGRMATVLSIDGGGVRGIIPGTILGNLEAKLQELDGPDARIADYFDVIAGTSTGGLVATMLAAPGANNRPMYAAKDLTSFYIEHSPKIFPESSRNAFGASLTGLFGGPKYDGEYLKQLVEGLLGNHTLNQTLTNLVIPSFDLKRLQPVIFTTKDVDGNQILPTTVRLSDVCLSTSAAPTYFPPHYFEAKGANETVHSFNLIDGGVAANNPTLTALTHVSKQLILGKLKGLDV...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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