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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr06G002217`

染色体: Chr06 坐标: 31013419-31017432 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr06G002217`
名称	SmilChr06G002217
描述	peptidyl-prolyl cis-trans isomerase CYP40-like
染色体 / SeqID	Chr06 / NC_080392.1
坐标与链方向	31013419 - 31017432 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130989072`
GeneID	`130989072`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130989072`
原始查询	`SmilChr06G002217`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	peptidyl-prolyl cis-trans isomerase CYP40-like
产物	peptidyl-prolyl cis-trans isomerase CYP40-like
Arabidopsis	`AT2G15790` (SQN) peptidyl-prolyl cis-trans isomerase / cyclophilin-40 (CYP40) / rotamase [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:816074] identity=63.1; qcov=0.997; evalue=6.97e-176; confidence=high
Rice	`Os06g0216800` (OsCYP40a) - identity=69.1; qcov=0.994; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0000413 (protein peptidyl-prolyl isomerization); GO:0003755 (peptidyl-prolyl cis-trans isomerase activity); GO:0005515 (protein binding)
KEGG	-
Pfam	PF00160 (Pro_isomerase); PF00515 (TPR_1); PF07719 (TPR_2); PF13181 (TPR_8)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130989072

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057769030.1`
2	Cytosol	细胞质基质	1.00000	`XP_057769030.1`
3	Nucleus	细胞核	0.40000	`XP_057769030.1`
4	Mitochondrion	线粒体	0.20000	`XP_057769029.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057769030.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr6:31014336`	`C`	`CT`	1bp_insertion	frameshift_variant	1	C49
`Chr6:31014336`	`C`	`CT`	1bp_insertion	CDS_variant	1	C49
`Chr6:31016147`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B140

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057769029.1

390 aa

195

390

Pro_isomerase

TPR_1

TPR_2

TPR_8

PF00160 Pro_isomerase 8-171 aa PF00515 TPR_1 298-331 aa PF07719 TPR_2 298-331 aa PF13181 TPR_8 299-330 aa

XP_057769030.1

361 aa

180

361

Pro_isomerase

TPR_1

TPR_2

TPR_8

PF00160 Pro_isomerase 8-171 aa PF00515 TPR_1 298-331 aa PF07719 TPR_2 298-331 aa PF13181 TPR_8 299-330 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057769029.1`	Pfam	`PF00160`	Pro_isomerase	Domain	8	171	1.4e-41	143.1	Cyclophilin type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase/CLD
`XP_057769029.1`	Pfam	`PF00515`	TPR_1	Repeat	298	331	4.2e-16	58.7	Tetratricopeptide repeat
`XP_057769029.1`	Pfam	`PF07719`	TPR_2	Repeat	298	331	2.8e-14	52.7	Tetratricopeptide repeat
`XP_057769029.1`	Pfam	`PF13181`	TPR_8	Repeat	299	330	2.7e-10	40.3	Tetratricopeptide repeat
`XP_057769030.1`	Pfam	`PF00160`	Pro_isomerase	Domain	8	171	1.2e-41	143.3	Cyclophilin type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase/CLD
`XP_057769030.1`	Pfam	`PF00515`	TPR_1	Repeat	298	331	3.1e-16	59.1	Tetratricopeptide repeat
`XP_057769030.1`	Pfam	`PF07719`	TPR_2	Repeat	298	331	2.1e-14	53.1	Tetratricopeptide repeat
`XP_057769030.1`	Pfam	`PF13181`	TPR_8	Repeat	299	330	2e-10	40.7	Tetratricopeptide repeat

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XM_057913047.1
TTTGTAAGTTTTCCAAAAAGAGAGAATCTCTGCGCGACCCCAAATTACTACGGATTTTATTTGAAACTTTGAGAGTTAAAAATGAAAACCAAAATCGCTTTTGTAGATGTGCATTTATTGCTGCACAAAAACACATTCATATTTGTATATATGTATGCAGAGACGGTTACTCCCACGCTGGTGCGCCATTGTACCTCTCCATTTTGCATTCTTTCCGCACAAGATACGCAGAGCATTTCTTCGTCTCGCACACAAAACGG...

XM_057913046.1
GCGGTTTGTAAGTTTTCCAAAAAGAGAGAATCTCTGCGCGACCCCAAATTACTACGGATTTTATTTGAAACTTTGAGAGTTAAAAATGAAAACCAAAATCGCTTTTGTAGATGTGCATTTATTGCTGCACAAAAACACATTCATATTTGTATATATGTATGCAGAGACGGTTACTCCCACGCTGGTGCGCCATTGTACCTCTCCATTTTGCATTCTTTCCGCACAAGATACGCAGAGCATTTCTTCGTCTCGCACACAAA...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA

LOC130989072
ATGGTGAATCCGCGGTGCTTTTTGGATGTCAGCATCGGCGGAGAACTGGAGGGGAGAATGGTGGTGGAGTTGTACAAGGACGTGGTGCCGAAGACCGTCGATAATTTCAGAGCTCTCTGCACCGGAGAGAGAGGCGTCGGCTCCGTCACCGGCGTTCCTCTTCACTATAAGGGTTCACGCTTCGGTCGTATTATCAGAGGTTTTATGGTGCAAGGGGGTGCAATTTCTGTTGAAAATGGCGTGTCTGGTGAATCCATTTA...

Protein

2 records

下载 Protein FASTA

XP_057769029.1
MVNPRCFLDVSIGGELEGRMVVELYKDVVPKTVDNFRALCTGERGVGSVTGVPLHYKGSRFGRIIRGFMVQGGAISVENGVSGESIYGLTFEDENFELKHTRKGMLSMANNGPNSNESQFSILTTQAPHLDGKCVVFGKLIKGFGVLRAVEYTAVTEDYCPTADVVIVDCGEIPEGGDDGTVNFFKDGDLYPDSPMDLDVKPDTYSWVISAIESIKIIGNMHFKKQDFKMAIRKYRKAIKYQDLCWEMPDLDQEQSELLR...

XP_057769030.1
MVNPRCFLDVSIGGELEGRMVVELYKDVVPKTVDNFRALCTGERGVGSVTGVPLHYKGSRFGRIIRGFMVQGGAISVENGVSGESIYGLTFEDENFELKHTRKGMLSMANNGPNSNESQFSILTTQAPHLDGKCVVFGKLIKGFGVLRAVEYTAVTEDYCPTADVVIVDCGEIPEGGDDGTVNFFKDGDLYPDSPMDLDVKPDTYSWVISAIESIKIIGNMHFKKQDFKMAIRKYRKAIKYQDLCWEMPDLDQEQSELLR...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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