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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr06G002221`

染色体: Chr06 坐标: 31184727-31188274 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr06G002221`
名称	SmilChr06G002221
描述	uncharacterized SmilChr06G002221
染色体 / SeqID	Chr06 / NC_080392.1
坐标与链方向	31184727 - 31188274 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130990758`
GeneID	`130990758`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130990758`
原始查询	`SmilChr06G002221`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os12g0142900; species=rice; confidence=low
产物	hit=Os12g0142900; species=rice; confidence=low
Arabidopsis	`-` -
Rice	`Os12g0142900` - identity=36.4; qcov=0.448; evalue=2.37e-50; confidence=low
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF00078 (RVT_1)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130990758

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytosol	细胞质基质	1.00000	`XP_057770971.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.80000	`XP_057770971.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057770971.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057770971.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057770971.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr6:31184776`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C71
`Chr6:31184820`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	1	B6
`Chr6:31184820`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B6
`Chr6:31184888`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C12
`Chr6:31184915`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B99,C78,D11
`Chr6:31184924`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B28,B99,C78,D11
`Chr6:31184925`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B99,C78,D11
`Chr6:31184931`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	1	B28
`Chr6:31184931`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B28
`Chr6:31184951`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C12
`Chr6:31184970`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B71
`Chr6:31185032`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A3,B126,B133,B23,C4

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057770971.1

589 aa

294

589

RVT_1

PF00078 RVT_1 328-429 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057770971.1`	Pfam	`PF00078`	RVT_1	Domain	328	429	3.2e-24	86.6	Reverse transcriptase (RNA-dependent DNA polymerase)

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057914988.1
ATGGTGGAGAAATCGGGGCTGACCGAGGTGCAACACCCCAAGCCGTATCGTTTGCAATGGCTGAATGAGACCGGCGTCGTCGAGATTACCACGCAAGTGAAAGTGCCTATTCACCTTGGCAGGTATGAAGATGAGGTTTTGTGCGATGTTATTCCCATGCAGGCGACCCACATTTTGTTGGGTAGACCGTGGCAGGTCGATAGACGAGCTATTCATGATGAAGTCACCAATAAGTACTCCTTCGCGTATAAGCAAAAGAA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130990758
ATGGTGGAGAAATCGGGGCTGACCGAGGTGCAACACCCCAAGCCGTATCGTTTGCAATGGCTGAATGAGACCGGCGTCGTCGAGATTACCACGCAAGTGAAAGTGCCTATTCACCTTGGCAGGTATGAAGATGAGGTTTTGTGCGATGTTATTCCCATGCAGGCGACCCACATTTTGTTGGGTAGACCGTGGCAGGTCGATAGACGAGCTATTCATGATGAAGTCACCAATAAGTACTCCTTCGCGTATAAGCAAAAGAA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057770971.1
MVEKSGLTEVQHPKPYRLQWLNETGVVEITTQVKVPIHLGRYEDEVLCDVIPMQATHILLGRPWQVDRRAIHDEVTNKYSFAYKQKKLAIVSLSPQQIYEDHVQLQQRHKEADKVQSTEQPVEQTEMKVEVEIDREVVALQDEVTDPDRPQLEETDEAMAVVVDIDREVVAVEEEEPNLTLLKLQDSREKVLEEYVPIPLEATVLLITSASEFFCDKAPMHDATWLFGRKVKHGSIFNNKFFMFKPSIRSVLQEFDDVFP...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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