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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr06G002233`

染色体: Chr06 坐标: 31558196-31562791 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr06G002233`
名称	SmilChr06G002233
描述	chromatin assembly factor 1 subunit FAS2
染色体 / SeqID	Chr06 / NC_080392.1
坐标与链方向	31558196 - 31562791 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130989082`
GeneID	`130989082`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130989082`
原始查询	`SmilChr06G002233`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	chromatin assembly factor 1 subunit FAS2
产物	chromatin assembly factor 1 subunit FAS2
Arabidopsis	`AT5G64630` (FAS2) Transducin/WD40 repeat-like superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:836584] identity=60.7; qcov=1.02; evalue=1.08e-157; confidence=high
Rice	`Os08g0108200` - identity=54.8; qcov=1.08; evalue=2.12e-136; confidence=high
GO	GO:0005515 (protein binding); GO:0005634 (nucleus); GO:0006334 (nucleosome assembly); GO:0006335 (DNA replication-dependent chromatin assembly); GO:0033186 (CAF-1 complex)
KEGG	-
Pfam	PF00400 (WD40); PF24105 (Beta-prop_CAF1B_HIR1)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130989082

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057769035.1`
2	Nucleoplasm	核质	0.40000	`XP_057769035.1`
3	Chromosome	染色体	0.40000	`XP_057769036.1`
4	Nucleus membrane	核膜	0.20000	`XP_057769035.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057769035.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr6:31558416`	`TGG`	`T`	2bp_deletion	frameshift_variant	10	B120,B130,B29,B91,C29,C32,C35,C59,C63,C68
`Chr6:31558420`	`A`	`AAT`	2bp_insertion	frameshift_variant	10	B120,B130,B29,B91,C29,C32,C35,C59,C63,C68
`Chr6:31559028`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B97
`Chr6:31560141`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A10,C43

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057769035.1

453 aa

226

453

Beta-prop_CAF1B_HIR1

WD40

PF24105 Beta-prop_CAF1B_HIR1 3-373 aa PF00400 WD40 10-40 aa PF00400 WD40 58-91 aa PF00400 WD40 105-140 aa PF00400 WD40 147-181 aa PF00400 WD40 338-363 aa

XP_057769036.1

369 aa

184

369

Beta-prop_CAF1B_HIR1

WD40

PF24105 Beta-prop_CAF1B_HIR1 23-289 aa PF00400 WD40 27-56 aa PF00400 WD40 63-97 aa PF00400 WD40 254-279 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057769035.1`	Pfam	`PF24105`	Beta-prop_CAF1B_HIR1	Repeat	3	373	6.5e-115	384.9	CAF1B/HIR1 beta-propeller domain
`XP_057769035.1`	Pfam	`PF00400`	WD40	Repeat	10	40	5.1e-33	112.8	WD domain, G-beta repeat
`XP_057769035.1`	Pfam	`PF00400`	WD40	Repeat	58	91	5.1e-33	112.8	WD domain, G-beta repeat
`XP_057769035.1`	Pfam	`PF00400`	WD40	Repeat	105	140	5.1e-33	112.8	WD domain, G-beta repeat
`XP_057769035.1`	Pfam	`PF00400`	WD40	Repeat	147	181	5.1e-33	112.8	WD domain, G-beta repeat
`XP_057769035.1`	Pfam	`PF00400`	WD40	Repeat	338	363	5.1e-33	112.8	WD domain, G-beta repeat
`XP_057769036.1`	Pfam	`PF24105`	Beta-prop_CAF1B_HIR1	Repeat	23	289	3.3e-91	306.8	CAF1B/HIR1 beta-propeller domain
`XP_057769036.1`	Pfam	`PF00400`	WD40	Repeat	27	56	4.1e-20	72.0	WD domain, G-beta repeat
`XP_057769036.1`	Pfam	`PF00400`	WD40	Repeat	63	97	4.1e-20	72.0	WD domain, G-beta repeat
`XP_057769036.1`	Pfam	`PF00400`	WD40	Repeat	254	279	4.1e-20	72.0	WD domain, G-beta repeat

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XM_057913052.1
AGTGCGATTATACAACTTTAAGAGCGATTACGATTATTGGCCTCCATTTTCCCGCCTAAATTCCTTCATTTGTCAGCTGCTCTTGCTCTCGCGCCATCATTTCATTGCTCAAACCCTAAACCATCTTCGCAAAACCTGTGAATTTTTCGGATTAGCAACTCTTCGCGCTGCTTTAATTGCTGAAGAAATTTAGATTTAAGAAGAAAAATGAGGGGTGGAACGGTTCAGATCAATTGGCACGACACCAAACCCGTACTCGC...

XM_057913053.1
GTGAAGTATGGAAAGTGCATAAGTCCTTAGTGTGAGCATTCAATGTATCCATTTAAAATCTTTAGTTTTGGCTGCCTGATAATTTCAACCAAAATATGTAATCACCTTGTATCTAGGTTTCATCGTAAGGATGTATTAGACCTGCAATGGTCTGCTGATGGGGCATATCTCATGTCCGGTTCAGTTGATAATTCATGCATCATATGGGATGCTAATAAGGGTTCTGTACACCAAATTTTGGATGCACATTTTCATTATGT...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA

LOC130989082
ATGAGGGGTGGAACGGTTCAGATCAATTGGCACGACACCAAACCCGTACTCGCCTGCGATTTCCATCCGATCTCCGCCCTCCTCGCCACTGCCGGCGCCGACTTCGATATTAAGATATGGGCAACAGTTTCTAGCATTGATCAAAAGAAGGCTCCAGGGGTTACTTACCAGAGCAATCTTTCATACCATAGTTCTGCTGTAAATGCACTTCGCTTCTCTCCGTCTGGAGAGCAGTTGGCTTCTGGTGCTGATGGTGGTGA...

LOC130989082
ATGTATCCATTTAAAATCTTTAGTTTTGGCTGCCTGATAATTTCAACCAAAATATGTAATCACCTTGTATCTAGGTTTCATCGTAAGGATGTATTAGACCTGCAATGGTCTGCTGATGGGGCATATCTCATGTCCGGTTCAGTTGATAATTCATGCATCATATGGGATGCTAATAAGGGTTCTGTACACCAAATTTTGGATGCACATTTTCATTATGTTCAAGGTGTAGCATGGGATCCATTGGGGAAATATGCAGCATC...

Protein

2 records

下载 Protein FASTA

XP_057769035.1
MRGGTVQINWHDTKPVLACDFHPISALLATAGADFDIKIWATVSSIDQKKAPGVTYQSNLSYHSSAVNALRFSPSGEQLASGADGGELILWKLHVTDAGEVWKVHKSLVFHRKDVLDLQWSADGAYLMSGSVDNSCIIWDANKGSVHQILDAHFHYVQGVAWDPLGKYAASFSSDRTCRIYINKPSKAKGVERSNYVCQHVISKAESPAPDESKSAKSHLFLDETLPSFFRRLAWSPDGSFLLVPAGSHKSTPTSEPFNT...

XP_057769036.1
MYPFKIFSFGCLIISTKICNHLVSRFHRKDVLDLQWSADGAYLMSGSVDNSCIIWDANKGSVHQILDAHFHYVQGVAWDPLGKYAASFSSDRTCRIYINKPSKAKGVERSNYVCQHVISKAESPAPDESKSAKSHLFLDETLPSFFRRLAWSPDGSFLLVPAGSHKSTPTSEPFNTAYVFSRKDFSRPTLMLPGASKPVVAVRFCPMKFKLLGTNTSSLFKLPYRLIFAVATLNSLYVYDTESIQPIVIVAGVHYAAITD...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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