当前解析结果
SmilChr06G002240| 统一新 Gene ID | SmilChr06G002240 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr06G002240 |
| 描述 | uncharacterized SmilChr06G002240 |
| 染色体 / SeqID | Chr06 / NC_080392.1 |
| 坐标与链方向 | 31719294 - 31720307 / - |
| NCBI Gene ID | LOC130990764 |
|---|---|
| GeneID | 130990764 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC130990764 |
| 原始查询 | SmilChr06G002240 |
| 来源 | GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | confidence=no_hit |
| 产物 | confidence=no_hit |
| Arabidopsis | -- |
| Rice | -- |
| GO | - |
| KEGG | - |
| Pfam | - |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:130990764 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Cytoplasm | 细胞质 | 1.00000 | XP_057770979.1 |
| 2 | Nucleus | 细胞核 | 0.60000 | XP_057770979.1 |
| 3 | Cytosol | 细胞质基质 | 0.40000 | XP_057770979.1 |
| 4 | Nucleoplasm | 核质 | 0.20000 | XP_057770979.1 |
| 5 | Cytoplasmic granule | 细胞质颗粒 | 0.20000 | XP_057770979.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr6:31719306 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | C2,C32,C68 |
Chr6:31719309 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | A3,B66,B98 |
Chr6:31719324 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | B125,B49,C83 |
Chr6:31719333 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B125,B49 |
Chr6:31719348 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B51,C49 |
Chr6:31719366 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | B15,B39,C40 |
Chr6:31719373 |
GGT |
G |
2bp_deletion | frameshift_variant | 9 | A20,B103,B113,B132,B51,B8,C3,C48,C7 |
Chr6:31719386 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | B110,B6,B8 |
Chr6:31719395 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | C18,C37 |
Chr6:31719400 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | B110,B6,B79,B8 |
Chr6:31719419 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | B125,B49,B6,B8 |
Chr6:31719424 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B125,B49 |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。