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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr06G002258`

染色体: Chr06 坐标: 32004740-32005574 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr06G002258`
名称	SmilChr06G002258
描述	uncharacterized SmilChr06G002258
染色体 / SeqID	Chr06 / NC_080392.1
坐标与链方向	32004740 - 32005574 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130990770`
GeneID	`130990770`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130990770`
原始查询	`SmilChr06G002258`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	OS-CAD; symbol=OS-CAD; hit=Os03g0581100; species=rice; confidence=low
产物	OS-CAD; symbol=OS-CAD; hit=Os03g0581100; species=rice; confidence=low
Arabidopsis	`AT3G06250` (FRS7) FAR1-related sequence 7 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:819799] identity=35.6; qcov=0.326; evalue=6.47e-09; confidence=low
Rice	`Os03g0581100` (OS-CAD) - identity=25.1; qcov=0.871; evalue=3.47e-13; confidence=low
GO	GO:0008270 (zinc ion binding)
KEGG	-
Pfam	PF04434 (SWIM)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130990770

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057770985.1`
2	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057770985.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057770985.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057770985.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057770985.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr6:32005049`	`AT`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	11	A11,A24,B20,B35,B46,B53,B66,B94,C33,C42,C58
`Chr6:32005140`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	1	B47
`Chr6:32005140`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B47
`Chr6:32005164`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B2,C87,D4,D5
`Chr6:32005187`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B47,D4,D5
`Chr6:32005555`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	83	A11,A14,A15,A21,A24,A7,B10,B101,B102,B107,B108,B109,B11,B112,B115,B117,B118,B122,B126,B138,B14,B140,B17,B19,B2,B22,B25,B28,B3,B31,B32,B35,B40,B45,B47,B58,B66,B67,B69,B71,B73,B75,B76,B77,B79,B82,B89,B9,B93,B94,B99,C1,C10,C11,C14,C16,C17,C20,C21,C27,C3,C33,C34,C36,C38,C39,C4,C41,C42,C48,C52,C55,C56,C58,C65,C69,C70,C79,C82,C87,D11,D4,D5

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057770985.1

224 aa

112

224

SWIM

PF04434 SWIM 30-55 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057770985.1`	Pfam	`PF04434`	SWIM	Domain	30	55	4e-05	23.8	SWIM zinc finger

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057915002.1
ATGGGGGAGAAGAAGCGCAGGGTTGTCTCCTTATATGAGGTTTCCGATATTGATCAAGAGGTTTTCAACGTTAGCTACAATGGGGAAGATAAAATAGCTACGTGTGGTTGTAAAAATTTTGAAAAGATCGGCTTACTGTGTCGTCATATATTTGTCGTATACATTAACCTCAAGATTGAATGCATTCCTGAGAAAAATGTGGTGAGTCGATGGACTAAATATGCTCCCAAGATAATTCTTCAGGAAGTTGACAGTACAAT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130990770
ATGGGGGAGAAGAAGCGCAGGGTTGTCTCCTTATATGAGGTTTCCGATATTGATCAAGAGGTTTTCAACGTTAGCTACAATGGGGAAGATAAAATAGCTACGTGTGGTTGTAAAAATTTTGAAAAGATCGGCTTACTGTGTCGTCATATATTTGTCGTATACATTAACCTCAAGATTGAATGCATTCCTGAGAAAAATGTGGTGAGTCGATGGACTAAATATGCTCCCAAGATAATTCTTCAGGAAGTTGACAGTACAAT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057770985.1
MGEKKRRVVSLYEVSDIDQEVFNVSYNGEDKIATCGCKNFEKIGLLCRHIFVVYINLKIECIPEKNVVSRWTKYAPKIILQEVDSTIDAQCSRMEDNKYLMNQLHSEFFETVGLVEGDTDQMNIFLRGLRDLKQMLAQQNQSDVASDQQLFDRYYGYSLPKEVSVLPPDPVKNKGSGSRLKSRKEKEQQLKNKPLRRCSKCRQMRHHDARNCDEVSTTWLRANS

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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