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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr06G002283`

染色体: Chr06 坐标: 32824834-32846487 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr06G002283`
名称	SmilChr06G002283
描述	type 2 DNA topoisomerase 6 subunit B-like
染色体 / SeqID	Chr06 / NC_080392.1
坐标与链方向	32824834 - 32846487 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130989105`
GeneID	`130989105`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130989105`
原始查询	`SmilChr06G002283`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	type 2 DNA topoisomerase 6 subunit B-like
产物	type 2 DNA topoisomerase 6 subunit B-like
Arabidopsis	`AT1G60460` (AT1G60460) uncharacterized protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:842341] identity=44.1; qcov=1; evalue=9.69e-120; confidence=medium
Rice	`Os06g0708200` (OsMTOPVIB) - identity=38.7; qcov=1; evalue=2.03e-82; confidence=medium
GO	GO:0000793 (condensed chromosome); GO:0007131 (reciprocal meiotic recombination); GO:0030674 (protein-macromolecule adaptor activity); GO:0042138 (meiotic DNA double-strand break formation)
KEGG	-
Pfam	PF28618 (MTOPVIB_C); PF28653 (MTOPVIB_middle)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130989105

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057769047.1`
2	Chromosome	染色体	0.20000	`XP_057769048.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057769047.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057769047.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057769047.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr6:32825613`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr6:32827263`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C60
`Chr6:32827308`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A3,B66,B98,C16,C52
`Chr6:32830353`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B59

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057769047.1

457 aa

228

457

MTOPVIB_middle

MTOPVIB_C

PF28653 MTOPVIB_middle 183-356 aa PF28618 MTOPVIB_C 364-427 aa

XP_057769048.1

455 aa

228

455

MTOPVIB_middle

MTOPVIB_C

PF28653 MTOPVIB_middle 183-356 aa PF28618 MTOPVIB_C 364-427 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057769047.1`	Pfam	`PF28653`	MTOPVIB_middle	Domain	183	356	1.8e-75	253.0	MTOPVIB middle domain
`XP_057769047.1`	Pfam	`PF28618`	MTOPVIB_C	Domain	364	427	8.5e-30	103.3	Meiotic topoisomerase VIB-like C-terminal domain
`XP_057769048.1`	Pfam	`PF28653`	MTOPVIB_middle	Domain	183	356	1.8e-75	253.1	MTOPVIB middle domain
`XP_057769048.1`	Pfam	`PF28618`	MTOPVIB_C	Domain	364	427	8.4e-30	103.3	Meiotic topoisomerase VIB-like C-terminal domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XM_057913065.1
GTGTTAACTAAATTGAAGCGTTTGTATCTCCCGCGTCTCATTTCTGTATCTGGGTTAATTAATATCGCTTTTTCACCAACAATTTTCGCGGGGTTTTCTCTCGCTTCTGTCTCTCCGAACAATGGACGCAAATTCTGTGGAGGACCTTTTGAAACTGCTTATTTCTTCTGCGTTTCGGAGATGCCGCATGTTAGATGATCTCTGCAGATTATCGGTGTTTCTTAGACCTAGGCGGCCTTCAGTTCTAATTTCAGTATCTG...

XM_057913064.1
GTGTTAACTAAATTGAAGCGTTTGTATCTCCCGCGTCTCATTTCTGTATCTGGGTTAATTAATATCGCTTTTTCACCAACAATTTTCGCGGGGTTTTCTCTCGCTTCTGTCTCTCCGAACAATGGACGCAAATTCTGTGGAGGACCTTTTGAAACTGCTTATTTCTTCTGCGTTTCGGAGATGCCGCATGTTAGATGATCTCTGCAGATTATCGGTGTTTCTTAGACCTAGGCGGCCTTCAGTTCTAATTTCAGTATCTG...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA

LOC130989105
ATGGACGCAAATTCTGTGGAGGACCTTTTGAAACTGCTTATTTCTTCTGCGTTTCGGAGATGCCGCATGTTAGATGATCTCTGCAGATTATCGGTGTTTCTTAGACCTAGGCGGCCTTCAGTTCTAATTTCAGTATCTGATACAGGCACTGGAAGCATTTTGGAGGAATTTAGTGAATTGAAATTCGAAAACAATACCATTTTGTCTGGTAAATGGGATGGAGTTCTTTCCATAATGACCACAAGCAGCTCTGACAGAGA...

Protein

2 records

下载 Protein FASTA

XP_057769047.1
MDANSVEDLLKLLISSAFRRCRMLDDLCRLSVFLRPRRPSVLISVSDTGTGSILEEFSELKFENNTILSGKWDGVLSIMTTSSSDREIHHLKFDFKEVVSSRRLVRLSSATKNGAKFSGTEVSLSLYEEIDGLVTMLYLFLQKILLLKAFKIAIELIVESGGGTKSFFLQNGCSTTAMNASNIHNLMLGLEEYVSKHGNKFAEACHSCFSIGKNLKVGTGIACSRENQQNSGQVMEVVIIISNISMSDQSSCSRLYGRRT...

XP_057769048.1
MDANSVEDLLKLLISSAFRRCRMLDDLCRLSVFLRPRRPSVLISVSDTGTGSILEEFSELKFENNTILSGKWDGVLSIMTTSSSDREIHHLKFDFKEVVSSRRLVRLSSATKNGAKFSGTEVSLSLYEEIDGLVTMLYLFLQKILLLKAFKIAIELIVESGGGTKSFFLQNGCSTTAMNASNIHNLMLGLEEYVSKHGNKFAEACHSCFSIGKNLKVGTGIACSRENQQNSGQVMEVVIIISNISMSDQSSCSRLYGRRT...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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