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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr06G002296`

染色体: Chr06 坐标: 33143365-33147033 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr06G002296`
名称	SmilChr06G002296
描述	uncharacterized SmilChr06G002296
染色体 / SeqID	Chr06 / NC_080392.1
坐标与链方向	33143365 - 33147033 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130990775`
GeneID	`130990775`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130990775`
原始查询	`SmilChr06G002296`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os01g0768600; species=rice; confidence=low
产物	hit=Os01g0768600; species=rice; confidence=low
Arabidopsis	`-` -
Rice	`Os01g0768600` - identity=32; qcov=0.466; evalue=4.17e-42; confidence=low
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF13952 (DUF4216); PF13960 (DUF4218)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130990775

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057770991.1`
2	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057770991.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057770991.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057770991.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057770991.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr6:33143386`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B40,B51,B67
`Chr6:33143394`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C51
`Chr6:33143404`	`CA`	`C`	1bp_deletion	frameshift_variant	6	B22,B40,B51,C11,D2,D5
`Chr6:33143445`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B122,B26,B95
`Chr6:33143449`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C60,D10
`Chr6:33143453`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	2	C24,C42
`Chr6:33143453`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C24,C42
`Chr6:33143454`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	6	B123,B55,B63,C30,C48,C71
`Chr6:33143498`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B112
`Chr6:33143502`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B80
`Chr6:33143508`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B117,B131,D6
`Chr6:33143534`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B126,B93,C47,C68,C7

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057770991.1

878 aa

439

878

DUF4218

DUF4216

PF13960 DUF4218 43-156 aa PF13952 DUF4216 323-396 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057770991.1`	Pfam	`PF13960`	DUF4218	Domain	43	156	6.1e-44	149.2	Domain of unknown function (DUF4218)
`XP_057770991.1`	Pfam	`PF13952`	DUF4216	Domain	323	396	1.3e-17	64.8	Domain of unknown function (DUF4216)

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057915008.1
ATGCACAACATGAAAAGTCACGACTGTCACGTTTTCATGCAAATACTGCTACCTGTTGCCTTTAAAGAACTTCTTCCTAAGAACGTTTGGGAGGCAATTACAGAGTTAAGTTTATTCTTCAGAGAATTAACATCTCGCAACATCTCAATAGATGATATGGGAACCCTGAGTGAGAAGATAGTTGTTACTCTATGCAAACTTGAGCGTATCTTCCCACCGAGTTTTTTTGACTCAATGGAGCACCTACCTGTTCATTTGGC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130990775
ATGCACAACATGAAAAGTCACGACTGTCACGTTTTCATGCAAATACTGCTACCTGTTGCCTTTAAAGAACTTCTTCCTAAGAACGTTTGGGAGGCAATTACAGAGTTAAGTTTATTCTTCAGAGAATTAACATCTCGCAACATCTCAATAGATGATATGGGAACCCTGAGTGAGAAGATAGTTGTTACTCTATGCAAACTTGAGCGTATCTTCCCACCGAGTTTTTTTGACTCAATGGAGCACCTACCTGTTCATTTGGC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057770991.1
MHNMKSHDCHVFMQILLPVAFKELLPKNVWEAITELSLFFRELTSRNISIDDMGTLSEKIVVTLCKLERIFPPSFFDSMEHLPVHLADEARLAGPVQYRWMYPFERYLRTLKNHIKNKAKVEGSISNAYILEEMSTFSSYYFEDHVTTKWRNLPRNIEEPIAENDDPNILAIFKSAGRPIGRTTRRYMEPKEYIAAHMYILSNCAEVADTYIKIFEGEMRYANPSITGAELEVAYDNNFLVWFSHYVSRPFNDDLNPYVK...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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