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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr06G002307`

染色体: Chr06 坐标: 33301999-33302712 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr06G002307`
名称	SmilChr06G002307
描述	uncharacterized SmilChr06G002307
染色体 / SeqID	Chr06 / NC_080392.1
坐标与链方向	33301999 - 33302712 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130990779`
GeneID	`130990779`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130990779`
原始查询	`SmilChr06G002307`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os02g0630250; species=rice; confidence=low
产物	hit=Os02g0630250; species=rice; confidence=low
Arabidopsis	`AT2G02650` (AT2G02650) Ribonuclease H-like superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:814794] identity=24.5; qcov=0.878; evalue=8.02e-06; confidence=weak
Rice	`Os02g0630250` - identity=31.2; qcov=0.595; evalue=1e-09; confidence=low
GO	GO:0003676 (nucleic acid binding); GO:0004523 (RNA-DNA hybrid ribonuclease activity)
KEGG	-
Pfam	PF13456 (RVT_3)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130990779

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057770995.1`
2	Nucleus	细胞核	0.80000	`XP_057770995.1`
3	Cytosol	细胞质基质	0.20000	`XP_057770995.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057770995.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057770995.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr6:33302027`	`AT`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	2	A7,C81
`Chr6:33302027`	`AT`	`A`	1bp_deletion	CDS_variant	2	A7,C81
`Chr6:33302078`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A3,B106,C71,C85,D5
`Chr6:33302088`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B118,B41,B61,C22,C51
`Chr6:33302092`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B118,B41,B61,C51
`Chr6:33302127`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A3,B106,C71,D5
`Chr6:33302173`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C48,D11
`Chr6:33302182`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A3,B106,D3,D5
`Chr6:33302224`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C71
`Chr6:33302245`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	4	B131,C32,C68,C74
`Chr6:33302245`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B131,C32,C68,C74
`Chr6:33302312`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B95

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057770995.1

237 aa

118

237

RVT_3

PF13456 RVT_3 88-205 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057770995.1`	Pfam	`PF13456`	RVT_3	Domain	88	205	4.1e-13	50.0	Reverse transcriptase-like

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057915012.1
ATGTCCATTGTTTGGGGTATTTGGAACCATCGGAATAAGGCGGTGTTTGATGATGCTTCTATTTCTGCCACCACTTTGACTGTCCAGGTCAAGGCTTTCATTCTTGAGGCTTCTCGTTTCAATCTTAGCGAGATGACTAACTCGGTTGAGGAGTTGCCGGTTCTTCATGGTCTTGGGGTGCCGGGCAAACCCCGTCGTCCTACCTCTTATGTTTATGTCTTTTGGCTACCTCCTCCGTATCCTTGGCGAAAGATCAACAT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130990779
ATGTCCATTGTTTGGGGTATTTGGAACCATCGGAATAAGGCGGTGTTTGATGATGCTTCTATTTCTGCCACCACTTTGACTGTCCAGGTCAAGGCTTTCATTCTTGAGGCTTCTCGTTTCAATCTTAGCGAGATGACTAACTCGGTTGAGGAGTTGCCGGTTCTTCATGGTCTTGGGGTGCCGGGCAAACCCCGTCGTCCTACCTCTTATGTTTATGTCTTTTGGCTACCTCCTCCGTATCCTTGGCGAAAGATCAACAT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057770995.1
MSIVWGIWNHRNKAVFDDASISATTLTVQVKAFILEASRFNLSEMTNSVEELPVLHGLGVPGKPRRPTSYVYVFWLPPPYPWRKININGSVHGSPLCIHAGDIIRDSSTVIGCFHFAAGRDWAFKAELLALIIALEQVVVQGWDYIWIEIDYTYLVDLLCSCSYSVPWRFFNRWRKILQDITDLHIIITHIYREENHVADFLASSVVDEGYWPFAILYILQLVRDDNCSLPYVRIVQ

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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